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说明 ID 不涉及 否 流程ID,指定后获取流程ID对应的流程详情。不指定时,获取的是流程列表。 --param-file -p 否 参数文件保存路径,以yaml格式保存。如果没指定,则不会显示和保存参数信息。 命令示例 health nextflow get workflow
of strings 导入路径集 最小长度:1 最大长度:2000 数组长度:0 - 50 target_folder 否 String 目标文件夹 最小长度:0 最大长度:2000 响应参数 状态码: 202 表4 响应Body参数 参数 参数类型 描述 id String 数据作业ID
最大值:100000000 缺省值:0 sort_dir 否 String 降序或升序(分别对应desc和asc,默认为desc) 缺省值:desc sort_key 否 String 排序字段(支持type, end_time) 请求参数 表3 请求Header参数 参数 是否必选 参数类型 描述 X-Auth-Token
步骤3:新建作业 单击作业页面的“新建作业”按钮,并选择需要运行的流程。这里作业名称可以用默认的名称,也可自己更改一个名称。同时,若想比较好的方式管理输出文件,也可以自行指定输出路径。 图6 新建作业 在作业页面添加好运行参数,添加方式与方式1相同。 配置好参数后,单击右上角“启动作业”按钮启动作业,同时会跳转回作业列表。
在部署容器化应用时可以指定镜像。例如一个Docker镜像可以包含一个完整的Ubuntu操作系统环境,里面仅安装了用户需要的应用程序及其依赖文件。EIHealth平台使用容器镜像服务(Software Repository for Container,简称SWR)进行简单易用、安全可靠的镜像管理。
二分型:预测二分类离散变量的模型,主要侧重定性分析。 模型数据 选择模型数据。可选择数据中心数据,或者示例数据。 仅支持CSV格式,数据条数支持100-50000条,文件不大于5MB。 组织共享 如果关闭,则该模型只能自己使用。 如果开启组织共享,则其他子用户也可以使用您的模型做分析。 默认为关闭。 单击“确定”。
主键用于唯一地标识数据表中的信息,可通过设置复合主键将数据表中的多个数据设置为唯一,主键至多设置10个。 允许为空 主键所包含的列不允许设置为空。当数据库中某些数据允许没有值时,可设置为空。 是否可查询 依据模板中定义的列信息,给出数据库中可进行查询的数据,可查询至多设置10个。 描述 当参数设置为可查询时,可以添加描述信息。
杠(/)开头且不能以斜杠(/)结尾,不能包含两个以上相邻的斜杠(/),不能包含以下特殊字符:\ : ; * ? < " > | 。其中单个文件夹名称不能以中划线(-)开头,不能以英文句号(.)或斜杠(/)或空格开头或结尾 最小长度:0 最大长度:128 tasks 否 Array
杠(/)开头且不能以斜杠(/)结尾,不能包含两个以上相邻的斜杠(/),不能包含以下特殊字符:\ : ; * ? < " > | 。其中单个文件夹名称不能以中划线(-)开头,不能以英文句号(.)或斜杠(/)或空格开头或结尾 最小长度:0 最大长度:128 tasks 否 Array
标签数量取值范围[0,1]。单个标签最大长度为63字符,必须以health.开头。 --project 无 否 指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。 如果同时使用yaml模板和参数命令对描述、标签等参数进行了修改,最终修改结果以参数命令为准。 对于可选参数,如果命令中包含了特殊字符,需使用""括起来。
5 workflow_id 是 String 作业依赖的流程id 最小长度:0 最大长度:135 params 否 File 流程参数列表文件,取值范围[0, 10M] priority 否 Integer 作业的优先级,取值范围[0,9],0最低,默认数值0 最小值:0 最大值:9
最小值:1000000000000 最大值:9999999999999 sort_dir 否 String 排序规则 目前默认时间降序 缺省值:desc sort_key 否 String 排序规则 目前默认时间降序,支持根据status,name,type,creator,create_time,end_time
config_files Array of strings 作业标签 config_context String nextflow config文件内容 表4 NextflowParamsDto 参数 参数类型 描述 name String 参数名 最小长度:1 最大长度:1024 value
String 资产类别,支持IMAGE/APP/WORKFLOW/DATASET,支持查询多个,以','分隔 最小长度:0 最大长度:2000 key_word 否 String 关键字,支持在资产名、资产标题、短描述、长描述中搜索 最小长度:0 最大长度:2000 labels 否 String
最小值:0 最大值:100000000 缺省值:0 sort_dir 否 String 排序规则 目前默认时间降序 缺省值:DESC sort_key 否 String 排序规则目前默认时间降序,支持根据status job_name 否 String 作业名称 最小长度:1 最大长度:128
4000分钟,即作业运行至多100天。 “输出路径”指运行分析作业时的输出结果存放路径。 例如,gene-assets项目中的output文件夹,输出路径格式为/gene-assets/output。 图3 流程参数 将左侧应用列表中的应用,拖拽至画布中。对于由多个应用构成的流程
最小值:0 最大值:100000000 缺省值:0 sort_dir 否 String 排序规则 目前默认时间降序。 缺省值:DESC sort_key 否 String 排序规则 目前默认时间降序,支持根据create_time|finish_time|running_time|total_time排序。
偏移量,查询起始偏移,必须由数字组成,默认为0,取值范围[0,100000000] 最小值:0 最大值:100000000 缺省值:0 sort_key 否 String 排序字段 sort_dir 否 String 排序方向,升序或降序,即ASC 和DESC 缺省值:DESC 请求参数 表3
最小值:0 最大值:100000000 缺省值:0 sort_dir 否 String 排序规则,目前默认时间降序 缺省值:DESC sort_key 否 String 排序规则,目前默认时间降序,支持根据create_time|finish_time|running_time|total_time排序
生成分子数量 strong_constraints Array of MoleculeConstraint objects 强约束集合 weak_constraints Array of MoleculeConstraint objects 弱约束集合 num_expected Integer