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Notebook的简要描述。 镜像类型 支持系统镜像和自定义镜像。 工作环境 选择系统镜像时,工作环境选择“PY3”。 自定义镜像:当提供的镜像无法满足您的需求时,可以使用自己制作的Notebook镜像。镜像制作方法请参见镜像管理。制作Notebook自定义镜像时,需要依赖平台提供的基础镜像,获取地址请参见获取镜像。
的开发需求时,您可以基于EIHealth提供的基础镜像包制作自定义镜像,并上传至平台。您可以在EIHealth平台“开发环境”中使用此自定义镜像创建Notebook。 创建Notebook时,如果使用自定义镜像。该自定义镜像,需要基于EIHealth平台提供的基础镜像进行制作。 父主题:
运行作业 方式1:使用预置的NGS流程 方式2:使用预置应用搭建NGS流程 方式3:自定义镜像运行FastQC流程
分子属性预测(MPP) ADMET属性预测接口 ADMET属性预测接口(默认+自定义属性) 父主题: API(AI辅助药物设计)
开发环境(Notebook) Notebook简介 创建Notebook Notebook常用操作 数据的上传和下载 自定义镜像创建Notebook样例 JupyterLab简介及常用操作 url获取方法 Notebook安装Conda指导 父主题: 用户指南(基因平台)
用户指南(盘古辅助制药) 欢迎使用盘古辅助制药平台 关键概念 准备工作 配额管理 系统设置 项目管理 功能模块 AI模型 自定义数据库 数据管理 作业管理 收藏夹 相关参数
分子生成(MG) 分子优化(MO) 靶点化合物结合预测(CPI) 分子属性预测(MPP) 分子搜索(MS) 分子合成路径规划任务(MSP) 自定义属性任务(MCP)
Integer 期望最大返回条目数(排序后取Top) custom_props Array of CustomProp objects 用户已开启的自定义属性集合 表5 CpiResult 参数 参数类型 描述 header String 蛋白质FASTA标题 fasta String 蛋白质FASTA序列
00个已上市、进入临床的小分子药物进行了约18万种药物-靶点配对情况的计算评估,让研究人员可以同时从21个蛋白的角度,综合、无偏地评估药物效果,从而为后续的药物机制研究、临床试验提供线索。 本案例介绍如何使用EIhealth平台虚拟药物筛选功能复现上述研究成果(https://doi
填写作业参数配置。填写完成后,单击“下一步:设置流程参数”。 作业名称:可选择“数据库表”、“自定义”或“自动生成”。 标签:设置作业标签。 描述:根据需要填写。 输出路径:可选择“数据库表”和“自定义”。选择“自定义”时,存放输出结果的路径,格式以/开头。例如项目中的output文件夹,输出路
全生命周期管理的服务,提供简单易用、安全可靠的镜像管理功能,帮助您快速部署容器化服务。 医疗智能体使用SWR存储工具镜像,包括内置工具及自定义工具的存储。
custom_props 否 Array of CustomProp objects 用户已开启的自定义属性集合 表4 CustomProp 参数 是否必选 参数类型 描述 id 是 String 自定义属性的ID(API侧) 最小长度:1 最大长度:64 prop_definition 否
BindingSite object 结合位点 custom_props Array of CustomProp objects 用户已开启的自定义属性集合 表5 GenerationResult 参数 参数类型 描述 name String 任务名 最小长度:1 最大长度:128 num_rounds
进入“专题”页签,单击“新建研究”。 填写任务的基本信息,包括选择任务所属项目,研究的名称和描述。 图1 基本信息 选择配体分子和受体蛋白。 作业名称:自定义名称。 类型:选择小分子化合物。 流程:选择从资产市场中订阅的“Docking Summary”流程。 配体分子:配体分子文件,支持SMILES、3D
binding_site 否 表6 object 结合位点 custom_props 否 Array of 表8 objects 用户已开启的自定义属性集合 表4 MoleculeConstraint 参数 是否必选 参数类型 描述 name 否 String 属性名称 type 是 String
BindingSite object 结合位点 custom_props Array of CustomProp objects 用户已开启的自定义属性集合 表5 OptimizationResult 参数 参数类型 描述 name String 任务名 最小长度:1 最大长度:128
自己的分析流程。 使用流程 EIHealth提供了个性化分析流程的搭建和管理操作。您可以将生物信息学软件封装为应用,并将其编排调度,形成自定义分析流程。 同时集成了基于开源的Jupyter Notebook,可为您提供在线的开发和调试工具,用于编写和调测模型训练代码。 图1 使用流程
BindingSite object 结合位点 custom_props 否 Array of CustomProp objects 用户已开启的自定义属性集合 表4 MoleculeConstraint 参数 是否必选 参数类型 描述 name 否 String 属性名称 type 是 String
快速创建一个kubernetes集群 自定义购买 什么是ECS 创建容器应用基本流程 快速创建一个kubernetes集群 04 使用 EIHealth提供了个性化分析流程的搭建和管理操作。您可以将生物信息学软件封装为应用,并将其编排调度,形成自定义分析流程。 准备工作 1. 购买服务
若选择PY3,则代表使用系统镜像创建notebook;若选择SourceProjectName/ImageName:TagName,则代表使用自定义镜像创建notebook。 --flavor -f 否 flavor规格,格式为cpu:gpu:memory,不填默认为1:0:2,也即其中cpu规格默认1C,范围[1