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聚类分析作业管理 创建聚类分析作业 查询聚类分析作业详情 父主题: API(盘古辅助制药平台)
Notebook常用操作 打开Notebook 首次打开Notebook之前,请先获取url,然后访问url。 然后单击“高级 > 继续前往xxxx(不安全)”,页面显示“403 : Forbidden”,然后返回Notebook列表页面。 请不要使用无痕浏览器访问。 返回平台操
创建自动作业 针对存在需要批量创建分析作业的场景,您可以选择创建自动作业。 在“自动作业”页签,您可以查看已创建的自动作业,包含作业名称、状态、数据表、创建者、创建时间;在操作列,您可以对已创建的自动作业执行启动、编辑、删除操作,运行中的作业可以执行停止操作。 图1 自动作业 前提条件
自定义属性任务(MCP) 新建自定义属性任务接口 查询自定义属性任务 父主题: API(AI辅助药物设计)
通用工具 MOL 3D Viewer MOL Editor 聚类分析 父主题: 功能模块
创建数据库 创建数据库 数据库支持使用.csv、.txt、.vcf文件生成数据库。创建的数据库需要保证数据文件与模板对应。创建数据库时,可以不选择导入的数据文件,建立空的数据库,后期可以新增数据行或者导入数据。如果使用自动作业的数据表创建数据库,在导入数据,需要参照数据库模板格式进行导入。
作业管理简介 在作业中心页面,可以创建分子对接、分子优化、自由能微扰、合成路径规划功能的作业。 在“作业中心”页面,以列表形式展示了项目中作业的运行状态。您可以查看作业的名称、创建时间、运行状态、总时长、运行时长、已运行时间、预计还需时间。对于列表中的作业,支持通过作业名称、状态
查询分子优化任务 功能介绍 通过分子优化任务ID查询分子优化任务状态及结果。 URI GET /v1/{project_id}/task/optimization/{task_id} 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String 华为云项目id
查询分子搜索任务 功能介绍 通过分子搜索任务ID查询分子搜索任务状态及结果。 URI GET /v1/{project_id}/task/search/{task_id} 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String 华为云项目id task_id
分子合成路径规划任务(MSP) 新建分子合成路径规划任务接口 查询分子合成路径规划任务 父主题: API(AI辅助药物设计)
靶点口袋发现作业管理 创建靶点口袋发现作业 查询靶点口袋发现作业详情 父主题: API(盘古辅助制药平台)
分子属性预测作业管理 创建分子属性预测作业 查询分子属性预测作业详情 父主题: API(盘古辅助制药平台)
创建模型 功能介绍 创建模型。 URI POST /v1/{project_id}/drug-models 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String 项目ID,您可以从获取项目ID中获取。 最小长度:1 最大长度:128 请求参数 表2
CSS集群解绑 功能介绍 CSS集群解绑。 URI DELETE /v1/{project_id}/drug/css-clusters/{css_cluster_id} 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String 项目ID,您可以从获取项目ID中获取。
配体索引(从0起编号)。 最小值:0 最大值:9 name String 配体名称,即配体所在的残基表示。 最小长度:1 最大长度:128 success Boolean 解析是否成功。 smiles String 分子SMILES表达式。 最小长度:1 最大长度:512 formula String
搭建NGS流程 登录医疗智能体平台,进入项目并选择“工具 > 流程”页签,单击“新建流程”。 图1 新建流程 在弹出的“流程设置”页面填写“流程名称”和“版本”,其他参数可选填。参数填写完成后,单击“确定”,完成流程设置。 在流程设计器左侧应用列表中选择fastp、bwa-mem应用,并使用鼠标拖拽至画布中。
"destination_database_name": "test001", "failed_reason": "", "status": "success" } ] 引用多个数据库实例 health import database instance 12345;123333;56777
列举对象 使用ls命令查询EIHealth项目中的对象,返回的对象名称按照字典序排列。同时,该命令支持显示引用的其他项目的数据。 在使用该命令前,需要使用switch命令进入待操作的项目,才可以执行数据相关操作,使用逻辑与EIHealth平台相同。 命令结构 health ls <path>
分子属性预测(MPP) ADMET属性预测接口 ADMET属性预测接口(默认+自定义属性) 父主题: API(AI辅助药物设计)
导入流程 导入流程是将隶属于其他项目中流程导入至本项目中,流程所依托的应用和镜像会同步导入。 使用“导入流程”功能,用户需是其他项目中的成员,且为其他项目的“所有者”或“管理员”。 单击“导入流程”,进入导入流程页面。 图1 导入流程 选择需要引用的项目以及项目中的流程,选择流程