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从头生成：通过指定的口袋从头生成小分子。 选定设计方式后，上传靶点结构，并配置其他参数。 图1 查看配置页面 靶点结构：选择靶点结构文件，仅支持PDB格式。若文件中包含多个受体，则默认只处理第一个。 单击下一步，配置配体文件，支持选择原始配体与上传配体文件两种方式 选择原始配体：选择靶
否 按指定的对象名前缀批量删除分段上传任务。 批量删除分段上传任务时该参数必选。 --jobs -j 否 批量删除分段上传任务的最大并发数，默认为配置文件中的defaultJobs。 批量删除分段上传任务时该参数可选。 --o -o 否 生成结果清单文件的文件夹，命令执行完成后，会
failed}_report_时间_TaskId.txt。单个结果清单文件默认情况下最大为30MB且最大可保留的文件个数为1024，可在配置文件中通过recordMaxLogSize和recordBackups分别配置。 当涉及多文件/文件夹时，如需确认失败任务的具体错误信息，可参考结果清单文件夹下的失败结果清单文件
与example.ipynb内容基本相同，为python脚本形式示例。 配置eihealth-toolkit（见example.ipynb中配置提示，需要添加config以及切换到当前目录）。 初始化配置请参考步骤3：初始化配置章节。 切换项目，请参考切换项目，运行成功时会提示： health
安装Nextflow 功能介绍 安装Nextflow（file和version参数必须提供其中一种） 调试 您可以在API Explorer中调试该接口，支持自动认证鉴权。API Explorer可以自动生成SDK代码示例，并提供SDK代码示例调试功能。 URI POST /v1
limit_concurrency Integer 限制的并发量。 请求示例 创建靶点口袋发现作业，作业名称为demo-job， 受体文件为project:/dir/file，时间步长为0.001ps，最小化步数为20000，预平衡时间为100ps，口袋发现时长为50ns，表面原子离散点数量为30，探针半径1
创建药物作业基本信息。 receptors 是 Array of CpiReceptor objects 受体文件列表。 数组长度：1 - 100 ligands 是 Array of MoleculeFileDto objects 小分子。 数组长度：1 - 1 表4 CreateDrugJobBasicInfo
流程创建成功后，您可以对流程进行编辑，删除操作。 编辑 选择已创建成功的流程，单击操作列的“编辑”，进入流程编辑页面。除了流程名称不能更改，您可以修改已有流程的其他参数配置项。 删除 通过单击操作列“删除”，可删除对应的流程。 下载流程文件 单击流程名称，进入流程详情页面，单击流程文件后的“下载”，可下载该流程文件。
在“功能模块”页面，选择对应的模块，单击“立即使用”。 在具体的功能模块页面，配置相关参数信息。具体参考功能模块章节。 通过“作业中心”页面创建 新建作业 单击“新建”，在新建作业页面选择对应的模块。 图1 新建作业 单击“确定”，在对应的模块页面配置详细信息，具体请参考功能模块。 克隆作业 克隆已有的作
图1 设置靶点优化配置页面 单击“下一步”，配置靶点优化配置参数。 MD引擎：仅支持GROMACS。 时间步长：MD模拟的时间步长，范围支持0<时间步长≤5fs，默认是2fs。 温度：MD模拟的温度，范围支持0<温度≤1000K，默认是300K。 配置MD的计算步骤 Energy
和作业，不填默认使用前一级的配置，填值会覆盖更新。覆盖关系：作业->流程->应用 最小长度：0 最大长度：24 gpu_type 否 String gpu架构类型，取值范围 ' '|GPU|Snt9|D310。对于流程和作业，不填默认使用前一级的配置，填值会覆盖更新。覆盖关系：作业->流程->应用
和作业，不填默认使用前一级的配置，填值会覆盖更新。覆盖关系：作业->流程->应用 最小长度：0 最大长度：24 gpu_type 否 String gpu架构类型，取值范围 ' '|GPU|Snt9|D310。对于流程和作业，不填默认使用前一级的配置，填值会覆盖更新。覆盖关系：作业->流程->应用
构相似的化合物聚成一类，从而找到有效骨架 ，辅助苗头化合物发现。 单击“功能模块 > 通用工具 > 聚类分析”功能卡片，进入配置页面。 图1 聚类分析配置页面 输入方式：选择文件和手动输入类型。 上传分子文件：选择可上传的分子文件。分子文件支持SMI格式文件；文件大小不超过5G；小分子支持10-10
数据的上传和下载 在Notebook页面，可以通过“Upload”和“Download”上传和下载文件。上传和下载的文件大小限制为100MB。 当在Notebook中上传文件提示大小受限时，您可以根据以下不同场景将大文件上传或下载到Notebook中。 图1 上传和下载文件 OBS存储类型的Notebook
health get job -o 10 同 health get job -l 100 -o 10 #列出当前project的job的基本信息 #表示取100条数据，也就是取11-110 100 条数据 health get job -l 10 -o 3 #列出当前project的job的基本信息
--type -t 否 查询某个类型的镜像，可选APP、NOTEBOOK、OTHER。 --project 无 否 指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。 命令示例 查询当前所在项目demo-project下面的类型为APP的镜像。 health docker images -t
和作业，不填默认使用前一级的配置，填值会覆盖更新。覆盖关系：作业->流程->应用 最小长度：0 最大长度：24 gpu_type 否 String gpu架构类型，取值范围 ' '|GPU|Snt9|D310。对于流程和作业，不填默认使用前一级的配置，填值会覆盖更新。覆盖关系：作业->流程->应用
使用create app命令引用本地的配置文件，创建应用。 命令结构 health create app [flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 --yaml -y 否 本地的应用模板路径。获取应用模板方法请参见应用配置文件说明。 --description -d
和作业，不填默认使用前一级的配置，填值会覆盖更新。覆盖关系：作业->流程->应用 最小长度：0 最大长度：24 gpu_type 否 String gpu架构类型，取值范围 ' '|GPU|Snt9|D310。对于流程和作业，不填默认使用前一级的配置，填值会覆盖更新。覆盖关系：作业->流程->应用
使用create workflow命令引用本地的配置文件，创建流程。 命令结构 health create workflow [flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 --yaml -y 否 本地的流程模板路径。获取流程模板方法请参见流程配置文件说明。 --description
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