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上传数据 使用upload命令，将本地数据上传到EIHealth平台。该命令不支持将数据上传到引用目录。 最小可以上传0Byte的空文件或文件夹，最大可以上传48.8TB的单个文件。 数据在上传的过程中，受网络影响可能出现损坏，上传命令默认会在上传完成后，验证项目中数据的MD5值
创建归档 使用create命令创建数据归档。 命令结构 health create archive <archive-name> [flags] # 命令中的archive可替换为backup 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 archive-name 无 是 归档名称。
强制操作，不进行询问提示。 批量移动时该参数可选。 --jobs -j 否 批量移动时的最大并发数，默认为配置文件中的defaultJobs。**说明：**工具会保证该值至少为1。 批量移动时该参数可选。 --exclude -x 否 不包含源对象的匹配模式，如：*.txt。批量移动时该参数可选。
修改流程 功能描述 修改指定workflow内容（名称不支持修改）。 命令结构 health nextflow edit workflow ID [params] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 ID 无 是 流程id。 --workflow -w 否 本地work
删除流程 功能描述 删除指定workflow。 命令结构 health nextflow delete workflow ID 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 ID 不涉及 是 模板id 命令示例 health nextflow delete workflow 550
下载数据 使用download命令将EIHealth平台的数据下载到本地，此命令不支持下载引用项目中的数据。 数据在下载的过程中，受网络影响可能出现损坏，下载命令默认会在下载完成后，验证项目中数据的MD5值与本地数据的MD5值的一致性，以及验证项目中数据的大小与本地数据大小一致性。
删除流程 使用delete命令删除指定流程。 命令结构 health delete workflow ID [flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 ID 无 是 流程的ID（workflow-id）或流程的名称、版本、所在项目名称（workflow-name:
获取系统标签 使用get命令获取系统标签库列表。 命令结构 health get label [flags] 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程，Linux和macOS环境使用方法基本相同，可参考。 health get label #
数据导入 使用import命令引用数据到当前所在项目或者导入网上数据。 命令结构 health import data <src-dir> <dest-dir> [flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 src-dir 无 是 源路径，支持四种格式，分别是医疗项
记录文件恢复任务。 --jobs -j 否 同步上传文件夹时批量任务的最大并发数，默认为配置文件中的defaultJobs。**说明：**工具会保证该值至少为1。 同步文件夹时该参数可选。 --exclude -x 否 不包含文件的匹配模式，如：*.txt。 支持“*”匹配多个任意字符和“
添加系统标签 添加系统标签库。 命令结构 health create label [name] [flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 name 不涉及 是 标签名。 description -d 否 标签描述。 命令示例 health create label
run the notebook again！”时，请单击Notebook工具栏中的按钮，重启Notebook环境，并重新执行出现告警的代码。 您可以在Notebook工作目录中上传数据，使用AutoGenome工具。数据上传下载请参见数据的上传和下载。 对于非挂载目录以外的目录下的文
查询作业 功能描述 查询指定job详情。 命令结构 health nextflow get job ID [flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 ID 不涉及 否 job id，不指定job-id时，列出当前project的全部job的基本信息。 --type
切换项目 使用switch命令切换到指定的项目中。 使用该命令前，您需要先创建项目，再使用switch命令进入该项目。 命令结构 health switch project <project-name> 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 project-name 无 是
显示当前目录 使用pwd命令显示当前所在的EIHealth项目中的目录。同时，该命令支持显示引用项目的目录。 命令结构 health pwd 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程，Linux和macOS环境使用方法基本相同，可参考。 health
更新项目 使用update或edit命令更新项目描述信息、标签或状态。 命令结构 health update project <project-name> [flags] 或 health edit project <project-name> [flags] 表1 参数说明 参数
恢复归档 使用restore命令恢复归档数据。 命令结构 health restore archive <archive-id> [flags] # 命令中的archive可替换为backup 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 --destdir -d 是 目标路径。 archive-id
获取数据作业 使用get命令获取数据作业列表、数据作业详情、数据作业执行日志或者下载数据作业执行日志。 命令结构 health get data-job <data-job-id> [flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 data-job-id 无 否 数据作
重试数据作业 使用retry命令重试数据作业。 命令结构 health retry data-job <data-job-id> [flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 data-job-id 无 是 数据作业id。 --project 无 否 指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。
取消数据作业 使用cancel命令取消数据作业。 命令结构 health cancel data-job <data-job-id> [flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 data-job-id 无 是 数据作业id。 --project 无 否 指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。
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