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HTSeq是什么
17:13:59 简介 HTSeq是使用Python编写的一支用于进行基因Count表达量分析的软件,能根据SAM/BAM比对结果文件和基因结构注释GTF文件得到基因水平的Counts表达量。HTSeq进行Counts计算的原理简单易懂,容易上手。 配置流程 1.配置编译环境 安装相关依赖。
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SpeedSeq是什么
SpeedSeq是什么 SpeedSeq是什么 时间:2020-11-03 14:58:13 简介 SpeedSeq是一个快速基因组分析和注释的灵活框架,发表在Nature Method上,封装了大量基因组分析的软件,比如比对软件BWA,calling SNP软件freebays,SV鉴定软件lumpy等。
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