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什么是Oases
简介 Oases是一个转录组组装器，旨在没有任何基因组组装的情况下从短读测序技术生成转录本。 配置流程 1.配置编译环境 安装相关依赖。 yum install-y git 2.获取源码 获取“oases”源码包。 cd/usr/local git clone--recursive
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SeqTK是什么
格式的序列。它可以无缝解析FASTQ和FASTA文件，也可以选择使用gzip对其进行压缩。 配置流程 1.配置编译环境 安装相关依赖。 yum install-y zlib-devel 2.获取源码 获取“Seqtk-1.3”源码包。 cd/usr/local/ wget https://github
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如何配置canal
目前主要支持了MySQL（也支持mariaDB）。 配置安装流程 1.配置安装环境 1)安装wget工具。 yum install wget -y 2)安装JDK。 yum install java-1.8.0-openjdk 3)配置环境变量。 echo “export JAV
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如何配置StringTie
，Cuffdiff或其他（DESeq，edgeR等）专用软件来处理StringTie的输出。 配置流程 1.配置编译环境 安装相关依赖 yum install-y zlib zlib-devel 2.获取源码 获取“stringtie-1.3.6”源码包。 cd/usr/local/
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pflask是什么
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lzop是什么
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lzop是一个实现LZO算法的软件工具，较之常见的gzip，lzop可以提供更快的压缩与解压缩速度。 编译配置流程 1.配置编译环境 1)安装wget工具。 yum install wget -y 2)安装lzop依赖的算法库LZO。 cd /usr/local/src wget https://www
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Picard是什么
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时间：2020-11-03 11:44:58 简介 一组Java命令行工具，用于处理高通量排序（HTS）数据和格式。 配置流程 1.配置编译环境 安装相关依赖。 yum install-y git java-1.8.0-openjdk 2.获取源码 获取“picard-2.23.0”源码包。 cd/usr/local/src
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什么是wrk
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wrk是一个开源的简单http性能测试工具，也可以叫做http benchmark工具。 编译配置流程 1.配置编译环境 安装wget工具。 yum install wget -y 2.获取源码 获取“wrk”源码包。 cd /usr/local/src git clone https://github
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Solr是什么
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回结果。 配置流程 1. 运行环境配置和必要条件准备 Java版本建议在1.8.0以上版本。 执行如下命令，安装java-1.8.0： yum install java-1.8.0-openjdk 2. 软件的安装步骤 1) 执行如下命令，下载软件包。 wget https://archive
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什么是SAMtools
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供了简单和高级工具，支持复杂任务，例如变体调用和对齐查看以及分类、索引、数据提取和格式转换。 配置流程 1.配置编译环境 安装相关依赖 yum install-y bzip2 bzip2-devel ncurses ncurses-devel xz xz-devel libcurl
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如何配置ant
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ant是一个将软件编译、测试、部署等步骤联系在一起加以自动化的工具，大多用于Java环境中的软件开发。 配置编译流程 1.配置安装环境 安装wget工具。 yum install wget -y 2.获取软件包 获取“apache-ant-1.10.6”软件包。 cd /usr/local/src wget
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KBEngine如何配置
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ty3D, OGRE, Cocos2d, HTML5, 等等)技术结合形成一个完整的客户端。 配置编译方法 配置编译环境 安装依赖包。 yum install gcc-c++ autoconf automake libtool mysql-devel apr apr-devel apr-util
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MISO是什么意思
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同工型产生读数的生成过程进行建模，MISO模型使用贝叶斯推断来计算读数源自同工型的可能性。 配置流程 1.配置编译环境 安装相关依赖。 yum install gcc gcc-c++gcc-gfortran python36 python36-devel python36-numpy
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什么是LZO
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LZO是致力于解压速度的一种数据压缩算法，LZO是Lempel-Ziv-Oberhumer的缩写，该算法是无损压缩算法。 编译配置流程 1.配置编译环境 安装wget工具。 yum install wget -y 2.获取源码 获取“lzo-2.06”源码包。 cd /usr/local/src wget https://www
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CMake是什么
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oject文件，能测试编译器所支持的C++特性，类似UNIX下的automake。 配置编译流程 1.配置编译环境 安装wget工具。 yum install wget -y 2.获取源码 获取“cmake-3.9.2”源码包。 cd /usr/local/src wget https://cmake
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consul是什么
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、Key/Value存储、多数据中心方案等。安装包仅包含一个可执行文件，方便部署。 配置安装流程 1.配置编译环境 安装wget工具。 yum install wget -y 2.获取源码 获取“consul-1.5.1”源码包。 cd /usr/local/src wget https://releases
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miRanda是什么
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miRanda是一种用于寻找microRNA基因组标靶的算法。该算法有C语言编写，可视作GPL下的开源方法使用。 配置流程 1.配置编译环境 安装wget。 yum install wget-y 2.获取源码 获取“miRanda-v3.3a”源码包。 cd/usr/local/ wget http://cbio
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SnpEff如何配置
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SnpEff是一款常用的突变位点注释工具。这款软件基于Java语言开发，安装过程相对简单，下载后解压缩即可使用。 配置流程 1.配置编译环境 1）安装JDK1.8。 yum install-y java-1.8.0-openjdk 2.获取源码 获取“SnpEff”源码包。 mkdir-p/usr/local
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什么是GATK?
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于从sequencing数据中进行variant calling，包括SNP、INDEL。 配置流程 1.配置编译环境 安装相关依赖。 yum install-y git git-lfs java-1.8.0-openjdk 2.获取源码 获取GATK最新版本源码。 cd/usr/local/src
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VarScan2如何配置
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因组数据重测序。最新版VarScan2使用Java编写，因此它可以在绝大多数平台运行。 配置流程 1.配置编译环境 1）安装相关依赖。 yum install-y git java-1.8.0-openjdk 2.获取源码 获取“VarScan2 v2.4.1”源码包。 cd/usr/local/src
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Scala如何配置
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各种特性。Scala运行在Java虚拟机上，并兼容现有的Java程序。 配置编译流程 1.配置编译环境 安装wget和openjdk。 yum install java-1.8.0-openjdk java-1.8.0-openjdk-devel wget -y 2.获取源码 获取“scala-2
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