source/usr/local/ROMs/env-ROMs.sh mpirun-np 4./oceanM ocean_upwelling.in 如果当前账户为root账户，则mpirun还需加入允许root运行的参数“mpirun–allow-run-as-root-np 4./oceanM

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修改“NPCOL”和“NPROW”变量值，其值的乘积与并行核心数相等，如： NPCOL=2; NPROW=2 修改OpenMPI运行参数，如： time mpirun-np$NPRO CS --allow-run-as-root$BLD/$EXEC 保存并退出vim。 2)执行如下命令，解压缩注册下载得到的算例输入文件至工作目录

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dat' 保存并退出vim。 3)依次执行如下命令，执行测试 source/usr/local/fvcom/env-fvcom.sh mpirun-n 4--allow-run-as-root/usr/local/fvcom/FVCOM4.1/FVCOM_source/fvcom--casename=tst

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1～步骤2.2。 运行MPI benchmark。 在任意一台BMS中执行以下命令，检验hostfile文件是否配置成功。 $ mpirun -np 2 -pernode --hostfile hostfile -mca btl_openib_if_include "mlx5_0:1" -x

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e～2.f。 运行MPI benchmark。 在任意一台BMS中执行以下命令，检验hostfile文件是否配置成功。 $ mpirun -np 2 -pernode --hostfile hostfile -mca btl_openib_if_include "mlx5_0:1" -x

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168.0.2 ... 执行以下命令，在集群中运行hostname命令。 # mpirun --allow-run-as-root -np <hostfile_node_number> -pernode --hostfile hostfile hostname 图1 在集群中运行hostname命令

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依次登录集群中所有BMS，重复执行2.e～2.f。 执行以下命令，在单个BMS上通过Spectrum MPI运行可执行文件。 $ mpirun -np 2 -pernode --hostfile hostfile /home/rhel/hello 图3 集群上运行Spetrum MPI成功

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依次登录集群中所有BMS，重复执行2.e～2.f。 在任意一台BMS中执行以下命令，运行社区Open MPI。 以两个BMS为例： $ mpirun -np 2 --pernode -hostfile hostfile /home/rhel/hello 图3 集群上运行社区OpenMPI成功 ho

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依次登录集群中所有BMS，重复执行步骤2.1～步骤2.2。 在任意一台BMS中执行以下命令，运行社区Open MPI。 以两个BMS为例： $ mpirun -np 2 --pernode -hostfile hostfile /home/rhel/hello 图2 集群上运行社区OpenMPI成功 ho

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修改hostfile，运行MPI benchmark，运行时指定hostfile文件路径。 以两个 弹性云服务器 为例： # mpirun --allow-run-as-root -np 2 --pernode -hostfile /root/hostfile /usr/mpi/gcc/openmpi-3.0

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执行以下命令，查看MPI环境变量是否正常。 $ which mpirun 图3 查看IB驱动自带的Open MPI环境变量 如果回显如图3所示，表示环境变量配置成功。 执行以下命令，在单台BMS上运行IB驱动自带的Open MPI。 $ mpirun -np 2 -mca btl_openib_if_include

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128/lib64 执行下列命令，导入环境变量。 $ source ~/.bashrc 执行下列命令，查看是否导入成功。 $ which mpirun 图2 Intel MPI环境变量导入成功 回显结果如图2所示，表示环境变量导入成功。 执行以下命令，在单个BMS上运行Intel MPI。

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