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华大基因0
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参考基因组
参考基因组 基因参考组由正常和病理条件下非正常的分子表达所组成。基因容器提供主流基因参考组,作为基因分析参考。 登录GCS控制台,左侧导航栏中选择“参考基因组”。 图1 参考基因组页面 在右侧页面单击“查看”,可查看基因参考组的详细情况。 图2 基因参考组详情 单击“下载”,可下
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单一步骤(一个并发)
首先以执行单一命令为例。以 gcs sub job 为例,我们使用: gcs sub job --cpu 0.5 --memory 1g --tool bwa:0.7.12 --shell sh bwa_help.sh 生成GCS流程示例 该命令将会生成以下模板,并提交基因容器语法解析器: 1
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gcs obs upload
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gcs set env
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gcs config add
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gcs del execution
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gcs set execution
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gcs get enviroment
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gcs get wdl
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gcs get tool
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gcs sub job
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unable to import 'smart_open.gcs', disabling that module
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数据管理
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分析流程
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使用命令行工具执行测序
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单一步骤(一个并发)
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这件“小棉袄”,真心不简单
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gcs sub wdl
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gcs config list
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gcs set sfs