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FPGA基因测序加速服务介绍
领域解决性能瓶颈。 功能描述 测序数据与参考基因组比对 支持BWA比对软件的FPGA异构加速,显著提升BWA计算效率,大大缩短数据比对时间。经测试30x人重测序数据(90GB)比对耗时从常规的20小时下降到2.5小时以内,且比对准确度完全一致。 单个样本Germline遗传变异检测
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BLAST是什么
或多个核酸或蛋白序列库中进行比对。BLAST还能发现具有缺口的能比对上的序列。 BLAST是基于Altschul等人在J.Mol.Biol上发表的方法(J.Mol.Biol.215:403-410(1990)),在序列数据库中对查询序列进行同源性比对工作。从最初的BLAST发展到现在NCBI提供的BLAST2
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