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什么是GATK?
git 3.编译和安装 1)进入GATK目录。 cd gatk 2)编译GATK。 ./gradlew shadowJar 编译完成后会在“build/libs”目录里面生成“gatk.jar”文件。 4.运行和验证 测试GATK是否安装完成。 java-jar build/lib/gatk
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VarScan2如何配置
运行和验证 查看jar包执行参数。 cd varscan java-jar VarScan.v2.4.1.jar 出现类似如下回显表示VarScan2可正常使用。 VarScan v2.4 ***NON-COMMERCLAL VERSION*** USAGE:java-jar VarScan
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