VarScan2是独立于平台的突变调用程序，用于在lllumina、SILiD、Life/PGM、Roche/454和类似仪器上生成的靶向，外显子组和全基因组数据重测序。最新版VarScan2使用Java编写，因此它可以在绝大多数平台运行。 配置流程 1.配置编译环境 1）安装相关依赖。 yum install-y

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云知识 HTSlib是什么 HTSlib是什么 时间：2020-11-03 10:43:01 简介 HTSlib是一个C库，用于读取和写入高通量测序数据。HTSlib是SAMtools使用的核心库。HTSlib还提供了bgzip，htsfile和tabix实用程序。 配置流程 1.配置编译环境

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华为云计算 云知识 edgeR是什么 edgeR是什么 时间：2020-11-03 16:03:07 简介 edgeR是R语言软件包，主要用于DNA测序技术产生的计数数据差异分析。特别是设计用于RNA-Seq或SAGE数据的差异表达分析。 配置流程 1.配置编译环境 1）安装相关依赖。 apt-get

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能力解决方案，可用于解决计算密集型、海量数据处理等业务的计算需求，如科学研究、气象预报、计算模拟、军事研究、CAD/CAE、生物制药、基因测序、图像处理等，缩短需要的大量计算时间，提高计算精度。 公有云上部署HPC的优势： 传统的HPC使用中存在如下问题： 投资成本高，扩容部署复杂，重复利用已有投资十分困难。

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什么是Delly 时间：2020-11-03 09:51:08 Delly是一种集成的结构变异（SV）预测方法，可以在短期读取的大规模并行测序数据中以单核苷酸分辨率发现基因分型和可视化缺失、串联重复、倒位和易位等缺陷。它使用配对末端，拆分阅读和阅读深度来敏感而准确地描绘整个基因组的重排。

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术公司、医院、制药公司等进行AI和数字化转型，突入行业的深水区，找到业务发展的第二曲线。 基因组分析 提供高性能、高可靠性、高性价比的基因测序计算、存储、分析和AI能力支持，让科研过程标准化、可执行。 药物研发 提供多个药物研发AI模型、AI算法、药物 知识图谱 ，支撑药企高效的开展

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，例如 1.家庭安防，cloud VR，智能工厂等业务场景需要的是ARM原生的鲲鹏、AI大算力的昇腾和GPU图像处理的多样算力。 2.基因测序、高性能计算、媒体内容分析等业务场景需要的是可业务封装的云容器、并发处理的批量计算（Batch）、灵活业务响应的Serverless的多形粒度。

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内存优化型 弹性云服务器 典型代表型号包括：M6型弹性云服务器、M3ne型弹性云服务器、M3型弹性云服务器、M2型弹性云服务器、M1型弹性云服务器 M6型弹性云服务器搭载第二代英特尔® 至强® 可扩展处理器 ，多项技术优化，计算性能强劲稳定。配套25GE智能高速网卡，提供超高网络带宽和PPS收发包能力；提供最大5

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如高性能计算、 媒体处理 、文件共享和内容管理和Web服务等。 说明：高性能计算：主要是高带宽的需求，用于共享文件存储，比如基因测序、图片渲染这些。 如大数据分析、静态网站托管、在线 视频点播 、基因测序和智能视频监控等。 如高性能计算、企业核心集群应用、企业应用系统和开发测试等。 说明：高性能计算：主要是

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件电路，满足机器学习中海量计算和极低时延的要求。因此，FPGA在满足机器学习的硬件需求上提供极具吸引力的替代方案。 基因组学研究：通过基因测序和分析、生物和医疗信息等海量数据的快速分析，可实现精准医疗；同时在药物研发、分子育种等领域都有海量数据的处理，该领域需要硬件加速来解决生物

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人基因组的软件包。BWA主要是由三种算法组成：BWA-backtrack、BWA-SW和BWA-MEM。第一个算法是针对于illumina测序reads最多100bp的算法。后面两个主要是针对于从70bp到1Mbp的更长序列。BWA-SW和BWA-MEM拥有一些相同的特征例如长r

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金融、证券等行业对业务部署的合规性，以及某些客户对数据安全有苛刻的要求。采用裸金属服务器部署，能够确保资源独享、数据隔离、可监管可追溯。 高性能计算场景 超算中心、基因测序等高性能计算场景，处理的数据量大，对服务器的计算性能、稳定性、实时性等要求很高，裸金属服务器可以满足高性能计算的需求。 核心数据库场景 某

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够弹性伸缩至PB规模，具备高可用性和持久性，为海量数据、高带宽型应用提供有力支持。适用于多种应用场景： HPC：在仿真实验、生物制药、基因测序、图像处理、科学研究、气象预报等涉及高性能计算解决大型计算问题的行业，弹性文件系统为其计算能力、存储效率、网络带宽及时延提供重要保障。 媒

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节点之间进行紧密的通信，要求文件系统高带宽、低时延。 生物科学：要求参与大数据计算的文件系统高带宽、高存储且易于扩展。 对生物基因数据进行测序、拼接、比对等处理，提供基因组信息以及相关数据系统的生物信息学领域。 进行大规模分子动力学模拟来分析和验证蛋白质在分子和原子水平上的变化的分子动力学模拟领域。

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灵活定制 可基于计算模式，灵活调整架构，适合于广泛、多变的混合负载场景 高性价比 提供高性能、低功耗和低成本的解决方案 基因组学研究 通过基因测序和分析、生物和医疗信息等海量数据的快速分析，可实现精准医疗；同时在药物研发、分子育种等领域都有海量数据的处理，该领域需要硬件加速来解决生物

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华为云计算 云知识 Wtdbg2是什么 Wtdbg2是什么 时间：2020-11-05 11:29:41 简介 Wtdbg2是一个三代测序数据（同时适用于pacbio和nanopore）denovo组装软件，它是一款基于C语言开发的开源软件。相较于其他三代数据组装软件(Canu，

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最大网络收发包：100万PPS 最大内网带宽：6Gbps   通用计算型S6 CPU/内存配比：1:1/1:2/1:4 vCPU数量范围：1-8 处理器：第二代英特尔® 至强® 可扩展处理器 基频/睿频：2.6GHz/3.5GHz 超高IO 通用型SSD 高IO 支持IPv6 实例网络性能与计算规格对应，规格越高网络性能越强

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多云/混合云解决方案，就可以将开发环境的集群和生产环境的集群统一管理，实现应用线上发布的全自动流水线。 业务与计算分离场景 对于AI、基因测序、视频处理等行业的用户，其计算任务依赖特殊的硬件，如CPU、裸金属服务器等，通过华为容器多云/混合云解决方案，用户就可以将计算业务部署在云

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金融、证券等行业对业务部署的合规性，以及某些客户对数据安全有苛刻的要求。采用裸金属服务器部署，能够确保资源独享、数据隔离、可监管可追溯。 2、高性能计算场景 超算中心、基因测序等高性能计算场景，处理的数据量大，对服务器的计算性能、稳定性、实时性等要求很高。虚拟化带来的性能损耗和超线程等对裸金属服务器影响不大，裸金属服务器可以满足高性能计算的需求。

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最大网络收发包：100万PPS 最大内网带宽：6Gbps   通用计算型S6 CPU/内存配比：1:1/1:2/1:4 vCPU数量范围：1-8 处理器：第二代英特尔® 至强® 可扩展处理器 基频/睿频：2.6GHz/3.5GHz 超高IO 通用型SSD 高IO 支持IPv6 实例网络性能与计算规格对应，规格越高网络性能越强

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，在处理高负载、多线程、大数据量计算的业务时依然稳定强劲。 旗舰机皇：C6云服务器 主打重负载场景，数据库、中大型电商/网站、视频类、基因测序等。集高计算性能、强网络性能于一身，满足高负载、高并发场景的业务需求。40Gbps最大内网带宽，超低内网时延，内存频率2933MHZ，网络

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