基于Jenkins快速部署源码编译环境

17:23:17 简介 RE2是Google开源的正则表达式库，提供对C/C++、Python、Ruby等多种语言的支持。 编译和测试方式 1.配置编译环境 安装wget工具。 yum install wget -y 2.获取源码 获取“re2-2019-08-01”源码包。 cd

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libgcrypt是一个非常成熟的加密算法库，也是著名的开源加密软件GnuPG的底层库，支持多种对称、非对称加密算法，以及多种Hash算法。 编译和测试方式 1.配置编译环境 1)安装wget工具。 yum install wget -y 安装bzip2工具。 yum install bzip2 -y

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义语言)来定义RPC的接口和数据类型，然后通过一个编译器生成不同语言的代码（支持C++、Java、Python、PHP、Ruby、Erlang等语言）并由生成的代码负责RPC协议层和传输层的实现。 编译安装方法 1.配置编译环境 1)安装wget工具。 yum install wget

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10:22:54 简介 Lua JIT是Lua语言的即时（JIT:Just-In-Time）编译器，它提供基于快速解释器和跟踪编译器的虚拟机,可显著提高Lua程序的性能。 编译安装方法 配置编译环境 安装wget工具。 yum install wget -y 获取“v2.1.0-beta3”源码包。

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时间：2020-11-03 15:55:57 简介 DESeq2是R语言软件包，旨在用于高维计数数据的标准化可视化和差异分析。 配置流程 1.配置编译环境 1）安装相关依赖。 apt-get install-y liblapack-dev libxml2-dev libxml++2.6-dev

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WA）作为输出生成的。提供了简单和高级工具，支持复杂任务，例如变体调用和对齐查看以及分类、索引、数据提取和格式转换。 配置流程 1.配置编译环境 安装相关依赖 yum install-y bzip2 bzip2-devel ncurses ncurses-devel xz xz-devel

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09:40:36 简介 lzop是一个实现LZO算法的软件工具，较之常见的gzip，lzop可以提供更快的压缩与解压缩速度。 编译配置流程 1.配置编译环境 1)安装wget工具。 yum install wget -y 2)安装lzop依赖的算法库LZO。 cd /usr/local/src

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buddy是一个二进制决策图开发库，它包括许多功能，比如：许多高效的矢量化BDD操作，动态变量重新排序，自动垃圾收集，具有自动引用计数的C++接口等等。 编译和测试方式 1.配置编译环境 安装wget工具。 yum install wget -y 2.获取源码 获取“buddy-2.4”源码包。 cd /usr/local/src

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可以使用Ballgown，Cuffdiff或其他（DESeq，edgeR等）专用软件来处理StringTie的输出。 配置流程 1.配置编译环境 安装相关依赖 yum install-y zlib zlib-devel 2.获取源码 获取“stringtie-1.3.6”源码包。

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性能测试，即批量数据传输（bulk data transfer）模式和请求/应答（request/reponse）模式。 配置编译方法 1.配置编译环境 安装依赖。 yum install wget -y 2.获取源码 获取“netperf-2.7.0”源码包。 cd /usr/local/src

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它自己的JUnit扩展生态圈。多数Java的开发环境都已经集成了JUnit作为单元测试的工具。 编译和测试方式 1.选择操作环境 本文选用华为鲲鹏云服务E CS KC1实例做测试 2.配置编译环境 1)安装JUnit依赖的JDK环境。 yum install java-1.8.0-openjdk

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如何提升软件编译构建效率？ 编译构建效率的提升是个系统工程，需要构建工程、构建工具、构建环境等各个方面协同优化。通过自动化的构建过程、高效的构建机制、最大化共享的基础设施，才可实现端到端的编译构建效率提升。 第一、将编译构建的过程自动化 软件是将源代码及其所依赖的二进制文件等，通过编译、链接、打包等过程

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11:19:29 简介 Swagger UI是目前最流行的RestFul接口API文档和测试工具。 编译和测试方式 1.选择操作环境 本文选用华为鲲鹏云服务ECS KC1实例做测试 2.配置编译环境 1)Swagger UI依赖于nodejs，因此先安装nodejs。 cd /usr/local/src

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rnet协议（IP）在网络上进行通信。ISC DHCP是一个软件集合，它实现了DHCP（动态主机配置协议）套件的所有方面。 编译和测试方式 1.配置编译环境 1)安装wget工具。 yum install wget -y 2)安装依赖库glibc。 yum install glibc

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配置流程 1.配置编译环境 安装wget工具。 yum install wget-y 2.获取源码 获取“wtdbg2”源码包。 cd/usr/local/src git clone https://github.com/ruanjue/wtdbg2 3.编译和安装 1)下载“sse2neon

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一种通用的read对比软件，它可以对比基因组DNA-seq和RNA-seq的reads，也可以用于发现基因组突变，包括短插入缺失和结构变异。 配置流程 1.配置编译环境 1）安装相关依赖。 yum install-y zlib-devel 2.获取源码 获取“subread-2.0.1”源码包。 cd/usr/local/

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移植，同时能够生成高质量的输出（字形图像）。它还可以用于图形库、显示服务器、字体转换工具、文本图像生成工具和许多其他产品。 编译和测试方式 1.配置编译环境 安装wget工具。 yum install wget -y 2.获取源码 获取“freetype-2.10.0”源码包。 cd

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Control-FREEC是使用居里研究所（巴黎）生物信息学实验室最初开发的深度测序数据检测拷贝数变化和等位基因失衡（包括LOH）的工具。 配置流程 1.配置编译环境 安装相关依赖。 yum install zlib-devel bzip2 bzip2-devel xz-devel-y 2.获取源码 获取“FREEC-11

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攻击。以Python程序设计语言编写，并能够在POSIX系统上运行。 配置流程 1.配置编译环境 1）安装wget包 yum install wget-y 2）安装依赖 fail2ban编译安装要求Python2>=2.6或者Python3>=3.2。 Python2安装请参考https://www

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Library）是一个在X/MIT许可协议下的开源栅格空间数据转换库。它利用抽象数据模型来表达所支持的各种文件格式。它还有一系列命令行工具来进行数据转换和处理。 编译和测试方式 1.配置编译环境 1)安装wget工具。 yum install wget -y 2)安装gdal的依赖库。 yum install -y subversion

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简介 miRanda是一种用于寻找microRNA基因组标靶的算法。该算法有C语言编写，可视作GPL下的开源方法使用。 配置流程 1.配置编译环境 安装wget。 yum install wget-y 2.获取源码 获取“miRanda-v3.3a”源码包。 cd/usr/local/

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