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什么是GATK?
配置编译环境 安装相关依赖。 yum install-y git git-lfs java-1.8.0-openjdk 2.获取源码 获取GATK最新版本源码。 cd/usr/local/src git clone https://github.com/broadinstitute/gatk
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VarScan2如何配置
VarScan2是独立于平台的突变调用程序,用于在lllumina、SILiD、Life/PGM、Roche/454和类似仪器上生成的靶向,外显子组和全基因组数据重测序。最新版VarScan2使用Java编写,因此它可以在绝大多数平台运行。 配置流程 1.配置编译环境 1)安装相关依赖。 yum install-y
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