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bp-100bp的Illumina数据来说,效果也更好些。 对于上述三种算法,首先需要使用索引命令构建参考基因组的索引,用于后面的比对。所以,使用BWA整个比对过程主要分为两步,第一步建索引,第二步使用BWA MEM进行比对。 bwa的使用需要两中输入文件: Reference genome
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