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bedtools如何配置
中: a. cpg.bed:人类基因组中的CpG岛。 b. exons.bed:人类基因的RefSeq外显子。 c. gwas.bed:在全基因组关联研究(GWAS)中鉴定的与人类疾病相关的SNP。 2)获取交集信息。 比如,找到A和B文件中重叠的部分。 bedtools intersect
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如何配置StringTie
基因,可以使用Ballgown,Cuffdiff或其他(DESeq,edgeR等)专用软件来处理StringTie的输出。 配置流程 1.配置编译环境 安装相关依赖 yum install-y zlib zlib-devel 2.获取源码 获取“stringtie-1.3.6”源码包。
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