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tag-name> 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 source-image-name 无 是 本地源镜像名称。 source-tag-name 无 是 本地源镜像tag名称。 target-image-name 无 是 新创建的镜像名称。 target-tag-name
pdbqt：将配体的sdf文件转换为pdbqt文件。 task-2-ligand smiles to 3dsdf：将配体的smiles文件转换为3dsdf文件。 task-3-receptor pdb to pdbqt：将受体的pdb文件转换为pdbqt文件。 task-4-qvina-w：分子对接。
String 文件URL，用户私有数据中心为项目路径、公共数据场景为obs地址。 最小长度：1 最大长度：2000 format 否 String 文件格式，支持PDB、SDF、MOL2、SMI，仅数据源为RAW时提供。 最小长度：1 最大长度：6 data 否 String 文件原始数据，仅数据源为RAW时提供。
使用流程 初始化数据盘 什么是ECS 创建容器应用基本流程 05 实践 基于EIHealth平台，搭建NGS流程，流程以fastq格式数据作为输入，对碱基的质量信息进行评估，判断可靠程度，通过质控、比对、变异检测等步骤，最终输出包含样本SNP、INDEL的VCF文件。 基于二代测序的基因突变检测
模板名称，带此参数时会覆盖yaml文件里面的模板名称。 --description -d 否 描述，带此参数时会覆盖yaml文件里面的模板描述。 --yaml -y 是 本地模板yaml文件。 --project 无 否 指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。 命令示例 本节以
受体的数据源：外部网络数据（如RCSB在线数据库）、用户私有数据中心、承载租户公共数据（含样例/公共库）。 枚举值： EXTRANET PRIVATE PUBLIC RAW url 否 String 文件URL，当数据源为外部网络数据时为https地址，为用户私有数据中心时为项目路径，为公共数据场景时为obs地址。
删除单个对象时生成结果清单文件。 --versionId -V 否 待删除对象的版本号。 --o -o 否 生成结果清单文件的文件夹，命令执行完成后，会在该文件夹下生成结果清单文件（可能包含成功结果和失败结果两个文件），默认为运行obsutil命令的用户目录的子文件夹.obsutil_output。
项。 删除 通过单击操作列“删除”，可删除对应的流程。 下载流程文件 单击流程名称，进入流程详情页面，单击流程文件后的“下载”，可下载该流程文件。 下载流程参数 单击流程名称，进入流程详情页面，单击流程参数后的“下载”，可下载该流程设置的参数文件。 图1 下载流程文件/参数 父主题：
a/目录进行归档，a/目录下最深一级的文件 a/xxxx/xxx./.../obj的总长度不能超过987。 执行归档操作时，若包含禁止删除的文件或文件夹，并打开了删除原数据开关，则被设置为禁止删除的文件或文件夹会删除失败，其他文件或文件夹删除正常。 使用obsutil上传数据，必须加full
受体的数据源：外部网络数据（如RCSB在线数据库）、用户私有数据中心、承载租户公共数据（含样例/公共库）。 枚举值： EXTRANET PRIVATE PUBLIC RAW url 否 String 文件URL，当数据源为外部网络数据时为https地址；用户私有数据中心为项目路径、公共数据场景为obs地址。
ct为源项目名称，可选。不指定srcproject时，默认为当前项目。例如ngs:1.0:srcproject。 --yaml -y 否 本地的流程模板路径。 --summary -s 否 流程的简要描述。 --description -d 否 流程的详细描述。 --output_dir
受体的数据源：外部网络数据（如RCSB在线数据库）、用户私有数据中心、承载租户公共数据（含样例/公共库）。 枚举值： EXTRANET PRIVATE PUBLIC RAW url 否 String 文件URL，当数据源为外部网络数据时为https地址；用户私有数据中心为项目路径、公共数据场景为obs地址。
存储路径 单击“存储路径”右侧文件夹图标，设置用于存储Notebook数据的OBS路径。如果想直接使用已有的文件或数据，可将数据提前上传至对应的OBS路径下。 包含本项目桶最多挂载6个，不包含本项目桶最多挂载5个。 用户在Notebook列表的所有文件读写操作是基于所选择的OBS路径下的内容操作。
单击“下一步”，添加流程文件。 单击“流程文件”后面的“添加”，添加流程文件。 如果流程文件上传的是zip包，则可以选择添加“主文件”。主文件必须为.nf，为压缩文件夹中的文件完整路径。例如：main.nf。若不填写，默认为main.nf。 支持上传的文件格式为nf、 zip，大
受体的数据源：外部网络数据（如RCSB在线数据库）、用户私有数据中心、承载租户公共数据（含样例/公共库）。 枚举值： EXTRANET PRIVATE PUBLIC RAW url 否 String 文件URL，当数据源为外部网络数据时为https地址；用户私有数据中心为项目路径、公共数据场景为obs地址。
获取项目 使用get命令获取当前用户有权限访问的所有项目列表，以及项目信息，包含项目名称、ID、所有者、项目角色、存储大小、状态、创建时间、更新时间。 在使用该命令前，您需要通过平台创建项目。 命令结构 health get project <project-name> [flags]
[flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 job-id 不涉及 是 作业ID -- params -p 否 本地json/yaml格式参数文件路径 命令示例 health nextflow retry job f17a3542-3f7c-11eb-868a-fa163e3ddba1
最大长度：512 数组长度：10 - 10000 molecule_file 否 DrugFile object 分子文件，分子表达式列表和分子文件二选一，分子文件优先级最高。 binding_sites 否 Array of BindSiteDto objects 靶点列表。 数组长度：0
选择原始配体：选择靶点结构文件中已存在的原始配体用来定位口袋或作为片段优化，存在多个原始配体时可通过下拉框选择，与上传配体文件二选一。 上传配体文件：通过上传与靶点结构有良好结合构象的配体文件确定配体，若文件中包含多个配体，默认只处理第一个，与选择原始配体二选一。仅支持SDF、MOL2、PDB格式文件，且只支持3D结构。
作流。 分析流程通过流程设计器创建，创建好的流程将存储于项目中。同时，您也可以通过“导入流程”的方法，将隶属于其他项目的流程导入至自己的项目中。 创建好的流程显示在流程列表中，您可以基于这些流程创建分析作业。 详细的流程创建和运行请参见新建流程。 父主题： 用户指南（基因平台）
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