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1~步骤1.3,关闭所有ECS的防火墙。 修改配置文件。 登录集群中任意一台ECS。 执行以下命令,查看ECS的主机名。 # hostname 图2 查看ECS的主机名 依次登录集群中所有ECS,重复执行步骤2.1~步骤2.2,获取所有ECS的主机名。 登录集群中任意一台ECS。
1.1版本为例)。 对于集群中的每台BMS,都需要执行该操作。 前提条件 已配置BMS集群间互相免密登录。 操作步骤 安装HPC-X工具套件。 使用社区OpenMPI时,需要同时使用Mellanox的HPC-X 套件,适用于CentOS 7.3的HPC-X版本是“hpcx-v2
01.04.03r-ce为例)。 前提条件 已配置弹性云服务器免密登录。 操作步骤 安装Platform MPI。 执行以下命令,安装需要的库文件。 # yum install glibc.i686 libgcc-4.8.5-11.el7.i686 增加执行权限,例如安装包所在路径为/root。
nd-drivers/linux/mlnx_ofed/,选择相应版本的InfiniBand网卡驱动下载,并根据Mellanox提供的操作指导进行安装。 以操作系统CentOS 7.3为例,推荐安装4.2.1版本的安装包,下载安装包“MLNX_OFED_LINUX-4.2-1.2.0
stop 执行以下命令,用“IP:Number”的形式作为MPI集群运行程序时的hostlist参数,在集群上通过Spectrum MPI运行可执行文件。其中, IP代表集群中的弹性云服务器IP地址。 Number代表该弹性云服务器的任务数。 假设集群中共有两个弹性云服务器,主机名
+指定的物理核数。 ip1,ip2:运行STAR-CCM+指定的主机信息。 core_num1,core_num2:指定每个主机运行的物理核数。 hiroce gids:查下设备名和index。 UCX_NET_DEVICES: hiroce gids查到的有ip值一行的ib_dev的值:
裸金属服务器场景典型应用 创建裸金属服务器集群 配置BMS集群互相免密登录 安装和使用MPI(X86 BMS场景) 安装和使用MPI(鲲鹏BMS场景) 在HPC集群上运行MPI应用(X86 BMS场景) 在HPC集群上运行MPI应用(鲲鹏BMS场景)
弹性云服务器场景典型应用 创建支持IB网卡的弹性云服务器 配置单个ECS免密登录 安装和使用MPI 制作私有镜像 创建应用集群 配置ECS集群互相免密登录 在HPC集群上运行MPI应用
弹性云服务器场景最佳实践 HPC断点续算计算方案 基于STAR-CCM+部署HPC集群
/etc/hosts 添加的内容为弹性云服务器的主机名及IP地址,例如 #cat /etc/hosts 192.168.1.3 vm1 192.168.1.4 vm2 ... 执行以下命令,添加hostfile文件。 # vi hostfile 添加的内容为集群中参与测试的弹性云服务器的主机名。 vm1
本节指导用户在BMS集群上安装和使用Platform MPI应用(以版本platform_mpi- 09.01.04.03r-ce.bin为例)。 对于集群中的每台BMS,都需要执行该操作。 前提条件 已配置BMS集群间互相免密登录。 操作步骤 安装Platform MPI 下载platformMPI,如:platform_mpi-
依次登录集群中所有BMS,重复执行1.b~1.c,关闭所有BMS的防火墙。 修改配置文件。 登录集群中任意一台BMS。 执行以下命令,查看BMS的主机名。 $ hostname 图2 查看BMS的主机名 依次登录集群中所有BMS,重复执行1.b~2.b,获取所有BMS的主机名。 登录集群中任意一台BMS。 执行以下命令,添加hosts配置文件。
单击“创建弹性云服务器”,开始创建应用集群。 按照界面提示,填写弹性云服务器的参数配置,详细操作请参见创建支持IB网卡的弹性云服务器。其中, 规格:需与转化的私有镜像的云服务器规格保持一致。 镜像:选择“私有镜像”,然后选择制作私有镜像中制作的私有镜像。 虚拟私有云:集群中的所有弹性云服务器需在同一VPC、同一子网内。
安装和使用IB驱动自带的Open MPI 操作场景 该任务指导用户在鲲鹏BMS集群上运行IB驱动自带的MPI应用(以版本4.0.2a1为例)。 前提条件 已配置BMS集群间互相免密登录。 集群中所有的BMS,均已安装IB驱动自带的OpenMPI。 操作步骤 关闭防火墙。 登录集群中任意一台BMS。
到完整地址。静态IP地址配置举例如下: 图1 静态IP地址配置 DHCP动态配置: 标准的DHCP帧格式包括了硬件类型(htype)、硬件地址长度( hlen)、 硬件地址(chaddr)等字段。由于MAC地址字段的长度不能容纳IPoIB的硬件地址,因此定义client-iden
安装和使用MPI 弹性云服务器场景支持使用的MPI IB驱动自带的OpenMPI 社区OpenMPI Spectrum MPI Intel MPI Platform MPI 父主题: 弹性云服务器场景典型应用
gids查到的有ip一行的ib_dev的值,:后面的值为port的id。 UCX_IB_GID_INDEX:hiroce gids查到的有ip一行的idx的值。 /opt/Siemens/A-1.4T-inletsystem-blockqian-case2.sim:算例文件。 运行参数调优下的STAR-CCM+ 端口范围修改
此时,pbs作业回到queued状态,等待可用的计算资源。 开机2中关闭的计算节点,提供可用的计算资源。 此时,pbs作业会继续进行。 作业执行完成后,执行以下命令,查看作业信息。 qstat -f 作业ID 如图5所示,作业运行了3分03秒。由此可以看出,作业是从断点的位置进行续算的。 图5 中断后运行作业信息
操作步骤 使用“PuTTY”,采用密钥对方式登录集群中任意一台BMS。 执行以下命令,防止系统超时退出。 # TMOUT=0 将BMS对应的密钥文件(.pem文件)拷贝至.ssh目录下,命名为“id_rsa”。 $ cd ~/.ssh $ mv *.pem id_rsa 执行以下命令,给密钥文件配置权限。
本节指导用户安装和使用社区OpenMPI(以3.1.1版本的OpenMPI为例)。 前提条件 已配置弹性云服务器免密登录。 操作步骤 安装HPC-X工具套件。 下载需要的HPC-X工具套件以及OpenMPI。 使用社区OpenMPI时,需要同时使用Mellanox的HPC-X 套件,HPC-X 的下载需要参考弹性云服