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大规模药物虚拟筛选 “神农项目”简介 药物虚拟筛选 父主题: 用户指南(基因平台)
项目管理 项目简介 创建项目 项目成员和权限 父主题: 用户指南(盘古辅助制药)
数据管理 数据管理简介 添加数据 数据管理常用操作 父主题: 用户指南(盘古辅助制药)
用户指南(基因平台) 欢迎使用医疗智能体服务 关键概念 准备工作 用户管理 配额管理 系统设置 项目管理 数据管理 数据库管理 镜像管理 工具管理 作业管理 Nextflow 资产市场 开发环境(Notebook) 大规模药物虚拟筛选
genomeagent镜像 使用genomeagent镜像 genomeagent镜像功能点介绍 父主题: 资产市场
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资产市场,提供官方发布的镜像、数据、应用、流程资产。 提供了数据库的创建、查询和管理能力。 支持药物虚拟筛选能力。 命令行工具迭代更新。 开放镜像管理类API。 商用 用户指南 命令行工具 API参考 2021年3月 序号 功能名称 功能描述 阶段 相关文档 1 医疗智能体EIHealth平台迭代更新 支持消息、邮件、安全、商标设置。
3分钟创建一个游戏类容器应用 3分钟创建一个游戏类容器应用 3分钟创建一个游戏类容器应用 06 API EIHealth提供API用于对平台资源进行操作和二次开发。 API文档 API概览 创建容器应用基本流程 快速创建一个kubernetes集群 3分钟创建一个游戏类容器应用 3分钟创建一个游戏类容器应用
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your-job -n your-instance # 返回结果如下 { "kind": "Pod", "apiVersion": "v1", "metadata": { ... } 获取事件 health get task
登录盘古辅助制药平台,选择“AI模型”。 图1 AI模型 单击“创建模型”,设置相关参数信息。 表1 参数说明 参数 说明 名称 模型名称。 长度为5-32个字符,首位需以英文字母开头,仅可以使用字母、数字、下划线“_”和中划线“-”和空格。 描述 设置模型的描述信息。 基模型 设置基模型,基模型与分子描述符有关。选择不同的基模型,分子描述符不一样。
创建数据库”,并填写相关信息。每个用户可新建100个自定义数据库。 图1 创建数据库 名称:数据库名称。长度为5-32个字符,首位需小写英文字母开头,仅可以使用小写字母、数字、下划线“_”和中划线“-”。最终租户下的所有用户数据库名称不能重名,可以和官方数据库名称重名,不区分大小
联系技术支持开通白名单。 需要提供账号名,账号ID,项目ID等信息。相关信息获取方式如下: 使用华为云账号登录后,在右上角账号下选择“我的凭证”。 在API凭证中可以查看相关信息。 购买服务 盘古辅助制药平台提供包年包月、按需两种计费方式,您可以按需求进行选择。 关于计费模式的详细介绍,请参见计费说明。
"username" adb1127979a1 bwa:v0.7 -a:提交的镜像作者,例如tsj。 container-id:容器id。 -m:提交时的说明文字,例如xx。 tsj/image:tag:仓库名/镜像名:TAG名,名称可自定义。 执行docker images查看制作完成的Docker镜像。
在本地编写模板,模板中的参数与在EIHealth平台新建流程过程一致。 修改yaml模板时,详细的命令和参数请参见流程配置文件说明。 # 详情说明可参考API文档中流程管理- 创建流程 workflow: id:
在本地编写模板,模板中的参数与在EIHealth平台启动作业过程一致。模板修改好后,再使用命令行工具上传模板,启动分析作业。 # 详情说明可参考API文档中作业管理-创建作业 job: name: demo-job
在本地编写模板,模板填写好后,再使用命令行工具上传模板,创建流程。示例流程由app1和app2两个应用构成,通过指定输入、输出关系链接两个应用。 # 详情说明可参考API文档中流程管理- 创建流程 workflow: name: 'demo-workflow'
"username" adb1127979a1 bwa:v0.7 -a:提交的镜像作者,例如tsj。 container-id:容器id。 -m:提交时的说明文字,例如xx。 tsj/image:tag:仓库名/镜像名:TAG名,名称可自定义。 执行docker images命令查看制作完成的Docker镜像。
在本地编写模板,模板中的参数与在EIHealth平台创建作业过程一致。 修改yaml模板时,详细的命令和参数请参见作业配置文件说明。 # 详情说明可参考API文档中作业管理-创建作业 job: name: demo-job