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数据上传下载请参见数据的上传和下载。 对于非挂载目录以外的目录下的文件，重启Notebook后会消失。例如，上传文件至Notebook的根目录下，该文件并不在被挂载的obs路径中，重启Notebook，该文件会消失。 图3 Upload上传数据 父主题： 资产市场
查看流程的压缩文件内容是否符合要求。 400 eihealth.01090009 The size of a decompressed nextflow process file exceeds the upper limit. 检查解压出的nextflow各个流程文件，大小是否超出限制。
成“.health”文件夹，文件夹中包含config.ini配置文件，用于存储任务执行所涉及到的配置，如密钥、区域、当前项目等信息。 生成的配置文件不建议直接修改，如需改动请使用命令行工具修改。 配置文件中保存有用户的AK、SK信息，为了避免密钥泄露，会对文件中的SK进行加密以保护密钥安全。
模板名称，带此参数时会覆盖yaml文件里面的模板名称。 --description -d 否 描述，带此参数时会覆盖yaml文件里面的模板描述。 --yaml -y 是 本地模板yaml文件。 --project 无 否 指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。 命令示例 本节以
fastq目录，包含待分析的fastq格式的文件。 fastq-extend string fastq文件后缀<extend>，适配不同的后缀。 read-cmd string 读取输入文件时使用的命令，如读取.gz文件使用zcat，文本文件使用cat。 para-str string
-w 否 本地workflow文件路径，可以是zip或nf文件。 --description -d 否 workflow的详细描述信息。 --labels -l 否 流程标签列表，用","分割，如"a,b,c"。 --main_file -m 否 流程主文件名。 --params -p
针对构建Index后的bam文件，统计测序数据的Insert size的分布。 picard-insertsize:2.23.3 docker pull broadinstitute/picard:2.23.3 Bam QC 评估比对得到的bam文件的质量。 qualimap-bamqc:2
receptors Array of DockingReceptorDto objects 受体文件列表。 数组长度：1 - 20 ligands Array of LigandDto objects 配体文件列表，当前仅支持1个。 数组长度：1 - 1 engine String 引擎，支持
source String 文件来源，支持用户私有数据中心、公共数据和源数据。 最小长度：1 最大长度：8 url String 文件URL，用户私有数据中心为项目路径、公共数据场景为obs地址。 最小长度：1 最大长度：2000 format String 文件格式，支持PDB、SD
-e 否 常用的三种分隔符为（;,\t），也可以根据导入数据的文件格式设定其他分隔符。 --files -f 否 生成实例数据的文件列表，多个文件用分号(;)分隔。 --project 无 否 指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。 命令示例 本节以Windows为例介绍eih
RESIDUES receptor_file 是 ReceptorDrugFileReq object 受体文件。 ligand_file 否 DrugFile object 配体文件。 residues 否 Array of strings 残基列表，当识别模式为残基时提供。 最小长度：4
数据库文件来源。 枚举值： public private url 是 String 文件URL，用户私有数据中心为项目路径、公共数据场景为obs地址。 最小长度：1 最大长度：2000 eihealth_project_id 否 String 数据库文件所在项目id，仅文件为数据中心时填写。
差异计算方法：RMSD、EMD。 枚举值： RMSD EMD file 是 DrugFile object 配体文件。 ref_file 是 DrugFile object 参考的配体文件。 表4 DrugFile 参数 是否必选 参数类型 描述 source 是 String 受体的数据
构建数据库。 数据文件：输入数据库文件，仅支持CSV格式，文件不大于1G，数据条数支持最多5,000,000条，超过5,000,000条将进行截取。文件必须有两列是“SMILES”、“NAME”，不区分大小写。文件不允许有中文，数据库小分子会自动去重。 数据文件列名：选择数据库列
>>abc.txt #对外暴露端口 EXPOSE 80 8080 1038 #复制文件 COPY abc.txt /opt/ #复制文件夹 COPY /webapp /opt/webapp #复制图片文件 COPY bd_logo1.png /opt/ #设置环境变量 ENV WEBAPP_PORT=9090
EditedLigand 参数 参数类型 描述 source String 文件来源，仅支持RAW。 最小长度：1 最大长度：6 format String 文件格式，仅支持CIF。 最小长度：1 最大长度：6 data String 文件原始数据，仅数据源为RAW时提供。 最小长度：0 最大长度：10000000
靶点结构：选择靶点结构文件，仅支持PDB格式。若文件中包含多个受体，则默认只处理第一个。 单击下一步，配置配体文件，支持选择原始配体与上传配体文件两种方式 选择原始配体：选择靶点结构文件中已存在的原始配体用来定位口袋或作为片段优化，存在多个原始配体时可通过下拉框选择，与上传配体文件二选一。
是否必选 参数类型 描述 file 否 File 文件流对象 part_number 否 Integer 分段序号，表示第几个文件片段 最小值：1 最大值：128 缺省值：1 total_part 否 Integer 分段总数，上传的文件总共分成了几个片段 最小值：1 最大值：128
stat <obj> [flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 obj 不涉及 是 查看的文件、文件夹对象。 注意： 如果为引用数据，必须要使用绝对路径（文件夹最后要加/）。未引用的数据不能查看。 --bf -b 附加参数，可选 设置是否以人方便阅读方式输出结果。
String 主文件名 最小长度：4 最大长度：1023 params 否 File 流程参数列表文件，取值范围[0, 10M] 响应参数 无 请求示例 更新Nextflow流程，修改流程描述为description，标签为labelA,labelB，流程主文件为main.nf https://eihealth
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