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使用Unix管道技术连接比对和排序步骤,以缩短bwa和samtools的存放、读取、删除中间文件的时间。 流程针对GATK4中的限速步骤,进行了系统的优化加速。流程从contig-file中提取contig,根据contig下发对应的任务,并依据不同任务,指定并行下发的任务数,以降低流程整体的运行时间。
最大长度:128 响应参数 状态码: 200 表4 响应Body参数 参数 参数类型 描述 id String 镜像id 请求示例 导入镜像,选取指定项目中指定镜像的版本 https://eihealth.cn-north-4.myhuaweicloud.com/v1/{project_id}
String 资产封面图访问链接 create_time String 创建时间 update_time String 更新时间 请求示例 查询指定资产版本详情 https://eihealth.cn-north-4.myhuaweicloud.com/v1/{project_id}/
响应参数 状态码: 201 表4 响应Body参数 参数 参数类型 描述 id String study id 请求示例 创建药筛study,指定名称和描述 https://eihealth.cn-north-4.myhuaweicloud.com/v1/{project_id}/e
购买EIHealth平台 根据实际需求选择计费方式。 图4 选择计费方式 区域:请就近选择靠近您业务的区域,可减少网络延迟,提高访问速度。不同区域云服务产品之间内网互不相通。 平台规格:选择“基因平台”或“药物平台”。 平台计费方式:选择“包年包月”或“按需”计费。 购买时长:如果选择的“包年包月”计
144000],单位分钟,默认1440 最小值:1 最大值:144000 output_dir 否 String 流程的当前工作目录,默认为根目录,用户可显式指定;输出路径必须以斜杠(/)开头且不能以斜杠(/)结尾,不能包含两个以上相邻的斜杠(/),不能包含以下特殊字符:\ : ; * ? < " > |
144000],单位分钟,默认1440 最小值:1 最大值:144000 output_dir 否 String 流程的当前工作目录,默认为根目录,用户可显式指定;输出路径必须以斜杠(/)开头且不能以斜杠(/)结尾,不能包含两个以上相邻的斜杠(/),不能包含以下特殊字符:\ : ; * ? < " > |
最大长度:128 表2 Query参数 参数 是否必选 参数类型 描述 path 是 String 指定文件夹(路径) 最小长度:0 最大长度:2000 limit 否 Integer 限制量,单次查询总量,必须由数字组成,默认为100,取值范围[1,1000] 最小值:1 最大值:1000 缺省值:100
202 表4 响应Body参数 参数 参数类型 描述 id String 资产id version String 资产版本 请求示例 发布镜像,指定资产形成为demo-image,版本号为1.0.0 https://eihealth.cn-north-4.myhuaweicloud.c
恢复归档 功能介绍 将指定的归档数据拷贝到目标项目的某个目录下 调试 您可以在API Explorer中调试该接口,支持自动认证鉴权。API Explorer可以自动生成SDK代码示例,并提供SDK代码示例调试功能。 URI POST /v1/{project_id}/eihea
是否必选 参数类型 描述 user_id 是 String 转移用户id 最小长度:1 最大长度:64 响应参数 无 请求示例 转移项目给指定用户 https://eihealth.cn-north-4.myhuaweicloud.com/v1/{project_id}/eihe
自定义镜像 创建Notebook时所需的自定义镜像,依赖于医疗智能体平台自研的基础镜像,您需要基于获取的基础镜像制作自定义镜像。 先连接容器镜像服务,参考步骤1.连接容器镜像服务操作,然后使用如下的镜像地址拉取基础镜像。 # 基础镜像 docker pull swr.cn-north-4.myhuaweicloud
CSS集群管理 绑定CSS集群 获取CSS集群列表 获取最终租户CSS集群列表 测试CSS集群连接 CSS集群解绑 父主题: API(盘古辅助制药平台)
获取数据详情 功能介绍 获取指定数据对象的详细信息 调试 您可以在API Explorer中调试该接口,支持自动认证鉴权。API Explorer可以自动生成SDK代码示例,并提供SDK代码示例调试功能。 URI GET /v1/{project_id}/eihealth-pro
输出路径。不指定时,以当前项目的根目录为工作路径。 --timeout -t 否 超时时间。运行时间超过设置时间时,认为超时,默认1440分钟,最大可设置为144000分钟。 --labels -l 否 标签。多个标签使用;符号分隔开。 --project 无 否 指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。
cOS环境使用方法基本相同,可参考。 当前目录,不进行跳转。 health cd . 切换到上一级路径。 health cd .. 切换到指定的路径,如切换到src1。 health cd /src1 回到本项目根路径。 health cd / 回到本项目下DataSet路径。 health
eport_时间_TaskId.txt”及日志路径下的日志文件。 --e -P 否 指定终端节点。 --i -i 否 指定用户的AK。 --k -k 否 指定用户的SK。 --t -n 否 指定用户的securitytoken。 --recover -z 否 待恢复下载任务结果清单文件的任务号。
购买平台 购买盘古辅助制药平台。 图4 购买盘古辅助制药 区域:请就近选择靠近您业务的区域,可减少网络延迟,提高访问速度。不同区域云服务产品之间内网互不相通。 平台规格:选择“盘古辅助制药平台”基础版或者专业版。 平台计费方式:选择“包年包月”或“按需”计费。 购买时长:如果选择的“包
144000],单位:分钟,默认数值1440 output_dir String job结果存储目录,不指定则在workflow的工作目录下生产job同名子目录,指定则已指定路径为准; output_dir_type String 输出路径的类型 node_labels Array
参考。 不指定参数。 执行health get project命令获取当前用户有权限访问的项目列表。 指定“project-name”参数。 例如查看名为“test-zh-0507”项目信息,执行health get project test-zh-0507命令。 指定“--cu