检测到您已登录华为云国际站账号，为了您更好的体验，建议您访问国际站服务网站 https://www.huaweicloud.com/intl/zh-cn
不再显示此消息
检测到您已登录华为云国际站账号，为了您更好的体验，建议您访问国际站服务网站 https://www.huaweicloud.com/intl/zh-cn
不再显示此消息
工作效率的有效方式。 从搭建、执行NGS流程中可以看出，图形化的操作界面提供了友好、便捷的操作体验，但是当面临大批量的测序数据时，需要重复设置输入、输出、执行等步骤。为进一步提高NGS流程的执行效率，本章节介绍如何通过循环读取输入数据，批量运行NGS。同时，您也可以参考本示例，将批量运行的方法复制到其他的分析任务中。
据库，在导入数据，需要参照数据库模板格式进行导入。 您可以导入本项目或使用其他项目中的数据生成数据库。 选择好文件后，通过设置数据的分隔符、跳过的行数来设置有效数据的起始位置。 常见的分隔符有“;”、“,”、“\t”，除此之外您也可以使用其他分隔符。以图1为例，分隔符为制表符，创
选择“自定义”镜像。 工作环境 选择“autogenome”镜像。 CPU 设置CPU为8.0核。 GPU 设置GPU为1.0。 内存 设置内存大于50G。 存储路径 单击“存储路径”右侧文件夹图标，设置用于存储Notebook数据的OBS路径。如果想直接使用已有的文件或数据，可将数据提前上传至对应的OBS路径下。
则后面就不会对其进行FEP计算。在相似度返回之前，您也可以直接选择配体对进入下一步。 图4 选择计算路径 单击“下一步”，进入FEP设置页面，设置相关参数。 时间步长：默认值：0.002，取值范围：0.001 ≤ dt ≤ 0.005，单位：ps。分子动力学模拟的步长，建议不超过0
是否必选 参数类型 描述 eihealth_project_id 是 String 平台项目ID，您可以在平台单击所需的项目名称，进入项目设置页面查看。 最小长度：1 最大长度：128 project_id 是 String 华为云项目ID，您可以从获取项目ID中获取。 最小长度：1
流程、作业 应用的参数和镜像启动命令如何设置 直接挂载OBS目录进行大规模计算，如何解决偶现报错
最小长度：1 最大长度：32768 响应参数 状态码： 200 表3 响应Body参数 参数 参数类型 描述 count Integer 归档设置记录总数 configs Array of GetArchiveConfigRsp objects 配置项 表4 GetArchiveConfigRsp
项目名称。取值范围3~45个字符，包含数字、小写字母、下划线、中划线，且只能以小写字母数字开头结尾。 项目创建成功后，不支持修改名称。 描述 设置项目描述。 图2 创建项目 单击“确认”，创建一个新的项目。 项目的创建者默认拥有项目的完整权限，同时项目可以分享给其他用户，并限定其他用
&& ./configure --prefix=/usr/local/samtools && make && make install 按Esc键，并执行:wq保存并退出Dockerfile。 制作镜像。 docker build -t bwa_samtools:0.7.17-1.10
用户指南（盘古辅助制药） 欢迎使用盘古辅助制药平台 关键概念 准备工作 配额管理 系统设置 项目管理 功能模块 AI模型 自定义数据库 数据管理 作业管理 收藏夹 相关参数
产品功能 eihealth-toolkit提供了以下功能： 系统设置 您可以使用该工具获取系统标签、系统资源、系统配额信息、消息列表，查询和修改消息及完成作业保留配置，也可以获取和修改供应商logo、名称设置。 项目管理 您可以使用该工具获取、切换、创建、更新、删除和转移项目，也可以添加、修改、移除项目成员角色。
1GB。 图1 上传数据 复制数据 复制数据会从别的项目中复制一份数据到当前项目中，这里可选择的源项目需是当前账号为管理员的对应项目。如需设置项目成员，请参考用户指南中的项目成员和权限。 图2 复制数据 引用数据 引用数据可以引用其他项目中或对应的obs桶的数据。引用的数据不能在
是否必选 参数类型 描述 eihealth_project_id 是 String 平台项目ID，您可以在平台单击所需的项目名称，进入项目设置页面查看。 最小长度：1 最大长度：128 image_id 是 String 镜像id 最小长度：1 最大长度：128 project_id
-o 否 输出路径。不指定时，以当前项目的根目录为工作路径。 --timeout -t 否 超时时间。运行时间超过设置时间时，认为超时，默认1440分钟，最大可设置为144000分钟。 --labels -l 否 标签。多个标签使用;符号分隔开。 --project 无 否 指定
图4 拖拽应用 设置输入、输出关系。 fastp的两个输出参数fq-file1和fq-file2是bwa-mem算法的输入参数，bwa-mem的sorted-bam参数是bamqc与picard-insertsize输入参数，参考图进行连接。 图5 设置输入、输出关系 若想修
选择IAM用户登录，填写账号名、IAM用户名、密码，登录平台。 账号名：与管理员（购买平台的账户）的账号名一致。 IAM用户名、密码：创建子用户时设置的用户名和密码。 图2 IAM用户登录界面 父主题： 用户管理
单击流程名称，进入流程详情页面，单击流程文件后的“下载”，可下载该流程文件。 下载流程参数 单击流程名称，进入流程详情页面，单击流程参数后的“下载”，可下载该流程设置的参数文件。 图1 下载流程文件/参数 父主题： Nextflow
是否必选 参数类型 描述 eihealth_project_id 是 String 平台项目ID，您可以在平台单击所需的项目名称，进入项目设置页面查看。 最小长度：1 最大长度：128 project_id 是 String 华为云项目ID，您可以从获取项目ID中获取。 最小长度：1
单击“新建应用”，创建fastqc应用。 图3 设置镜像名称、版本等信息 镜像启动命令如下所示。镜像启动命令需要引用输入、输出参数中的变量，并以大括号{}扩起，以$符号进行引用。 fastqc -f fastq -o ${output-dir} ${input-file} 图4 设置CPU、内存、输入输出参数
、数字、下划线“_”、中划线“-”和空格；首位只能以数字或字母开头。 标签：设置任务标签。 功能调用消耗：运行一次功能会消耗一次。 单击“提交”。 提交成功后，可以在“作业中心”查看执行结果。 图1 设置靶点口袋发现文件 查看靶点口袋发现结果。 单击作业名称，在输出结果页面，可以
长按/截图保存，微信识别二维码
或者关注公众号“华为云”
