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NextflowJobReportFile objects 作业报告文件列表 表4 NextflowJobReportFile 参数 参数类型 描述 name String 报告文件名 最小长度:1 最大长度:1024 download_url String 报告文件下载地址 最小长度:1 最大长度:1024
最小长度:1 最大长度:32768 表3 请求Body参数 参数 是否必选 参数类型 描述 files 是 Array of strings 导入文件l路径列表 最小长度:1 最大长度:1024 数组长度:1 - 5 delimiter 是 String 分隔符,常见分隔符为, ; 最小长度:1
PRIVATE PUBLIC RAW url 否 String 文件URL,当数据源为外部网络数据时为https地址;用户私有数据中心为项目路径、公共数据场景为obs地址。 最小长度:1 最大长度:2000 format 否 String 文件格式,仅支持PDB,仅数据源为RAW时提供。 最小长度:1
workflow_file String 流程的文件名 workflow_file_url String 流程的文件名下载地址 main_file String 主文件名 params_file String 用户上传时使用的参数文件名 params Array of NextflowParamsDto
0:srcproject。 --yaml -y 否 本地的流程模板路径。 --summary -s 否 流程的简要描述。 --description -d 否 流程的详细描述。 --output_dir -o 否 输出路径。不指定时,以当前项目的根目录为工作路径。 --timeout -t 否 超时时间
运行分析作业时,流程中的每一个应用称之为一个任务(Task),在编排流程时,如果“输出路径”修改为空,实际作业输出结果依然默认存在该路径。最终输出结果路径按照“流程输出路径/作业名称-UUID/Task输出路径/应用输出路径”规则生成。 单击界面上方按钮,保存流程。并提示“流程保存成功”。 创建好的流程,将显示在流程列表中。
表4 ImportDatabaseDataReq 参数 是否必选 参数类型 描述 files 是 Array of strings 导入文件l路径列表 最小长度:1 最大长度:1024 数组长度:1 - 5 delimiter 是 String 分隔符,常见分隔符为, ; 最小长度:1
String 模型数据文件来源。 枚举值: public private url String 文件URL,用户私有数据中心为项目路径、公共数据场景为obs地址。 最小长度:1 最大长度:2000 eihealth_project_id String 模型文件所在项目id,仅文件为数据中心时填写。
标签:设置作业标签。 描述:根据需要填写。 输出路径:可选择“数据库表”和“自定义”。选择“自定义”时,存放输出结果的路径,格式以/开头。例如项目中的output文件夹,输出路径可设置为/output。不填写路径时,默认以“作业名-UUID”格式生成输出路径。 优先级:运行优先级,分为0~9级
EIHealth平台提供了数据库的创建、查询和管理能力。您可以将表型、基因型或其他数据导入EIHealth平台并生成数据库。同时,除了自定义数据库外,支持将作业运行中产生的数据文件创建为数据库。 创建数据库时,数据库模板为您提供了一个数据表的搭建框架,可通过数据库模板灵活的定义数据结构,描述数据及其关系。数据库以项目
PRIVATE PUBLIC RAW url String 文件URL,当数据源为外部网络数据时为https地址;用户私有数据中心为项目路径、公共数据场景为obs地址。 最小长度:1 最大长度:2000 format String 文件格式,支持PDB、SDF、MOL2、SMI,仅数据源为RAW时提供。
单击具体的每个应用,可以查看每个应用的运行信息:输入输出,节点参数,应用以及日志等信息。 单击具体的输出参数便可跳转到具体的文件位置。 图14 查看应用信息 图15 查看输入、输出数据位置 单击输出参数路径,可以跳转至输出文件位置。 图16 获取输出数据 父主题: 运行作业
获取项目ID的接口为GET“https://{Endpoint}/v3/projects”,其中{Endpoint}为IAM的终端节点,可以从地区和终端节点获取。 响应示例如下,例如EIHealth部署的区域为"cn-north-4",响应消息体中查找“name”为"cn-nor
ABNORMAL、FAILED。 最小长度:1 最大长度:16 filename String 下载文件名。 最小长度:1 最大长度:512 out_dir String 下载路径。 最小长度:1 最大长度:2000 progress TaskProgress object 任务进度。
String 流程的子任务展示名称 output_dir String 子任务的输出存放路径 whole_output_dir String 子任务的完整输出路径,查看流程不会返回,查看作业时才会返回完整输出路径 io_acc_type String 子任务使用的IO加速类型,不填表示不使用;
--storage-path -s 是 notebook存储路径。 包含本项目桶最多挂载6个,不包含本项目桶最多挂载5个。 格式为ProjectName:/path,多个路径用分号(;)隔开。 --project 无 否 指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。 命令示例 本节以Windows
在“作业”列表中,可单击作业名称查看作业信息和输入输出数据。 图8 查看作业信息 单击输出路径,可跳转至输出文件位置。html文件支持在线预览,zip文件可下载至本地查看。 图9 输出数据 图10 预览html文件 图11 获取zip文件 父主题: 运行作业
设置供应商配置 功能介绍 设置供应商配置 URI PUT /v1/{project_id}/system/vendor-config 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String 华为云项目ID,您可以从获取项目ID中获取。 最小长度:1 最大长度:128
缺省值:true sub_paths 是 Array of strings 复制的路径集 最小长度:1 最大长度:2000 数组长度:0 - 50 target_folder 否 String 目标文件夹 最小长度:0 最大长度:2000 响应参数 状态码: 202 表4 响应Body参数
/v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/backups/{backup_id}/restore 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 backup_id 是 String 归档ID 最小长度:1 最大长度:128 eihealth_project_id