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在使用Nextflow时，作业运行失败的可能原因 由于Nextflow支持的特殊字符继承了Nextflow原有特性，因此请排查参数值，或者选择的数据名称，或者路径中带的特殊字符是否符合Nextflow原有特性。 建议启动并发作业数最多为8个。 父主题： Nextflow
虚拟药物筛选 创建study 删除study 列举study所有作业 创建study作业 列举study 获取study作业的最值信息 获取生成study作业3D结构的内容 父主题： 项目管理
初始化配置”中的platform-id对应。 登录医疗智能体平台。 在右上角用户名中选择“个人设置”，获取平台ID。 图3 平台ID 父主题： 获取并使用命令行工具eihealth-toolkit
log-path successfully! 清空配置请执行health config clear命令 在Notebook中使用命令行工具 在EIHealth开发环境Notebook中使用命令行工具时，请依据以下步骤配置代理。 打开Notebook，并选择Terminal，打开Notebook的命令行界面。
/指定当前路径。 使用数据、应用、流程、作业命令时，需先使用switch命令进入待操作的项目中。使用逻辑与EIHealth平台一致，进入项目，再对项目内的数据等内容进行操作。 命令行的参数缩写支持合并使用，例如，-r -s 可以写成-rs。 父主题： 获取并使用命令行工具eihealth-toolkit
筛选以项目成员为粒度进行资源的隔离和访问控制，不同成员角色对数据库的操作权限请参见成员角色和权限。 创建药物虚拟筛选任务 虚拟药物筛选支持使用资产市场中预置的“Docking Summary”流程对小分子化合物配体和蛋白受体进行对接。该流程可以实现以下功能。 整合分子对接结果，生成结合能矩阵。
大规模药物虚拟筛选 “神农项目”简介 药物虚拟筛选 父主题： 用户指南（基因平台）
创建虚拟药物筛选任务 创建药物虚拟筛选任务 虚拟药物筛选可以使用资产市场中预置的“Docking Summary”流程对小分子化合物配体和蛋白受体进行对接。 使用步骤如下所示。 登录医疗智能体平台，在“资产市场”中订阅“Docking Summary”流程至所需的项目中。 进入“专题”页签，单击“新建研究”。
用户管理 用户管理介绍 创建子用户 导入用户 登录平台方式 管理用户 父主题： 用户指南（基因平台）
如果当前目录为health所在目录，可以使用./health命令使用命令行工具。 如果当前目录不是health所在目录，需要使用绝对路径。如当前目录为/opt，假设health存放在/root/health-toolkit/下，需要指定/root/health-toolkit/health路径进行使用。 如果无法运行，提示Permission
况的计算评估，让研究人员可以同时从21个蛋白的角度，综合、无偏地评估药物效果，从而为后续的药物机制研究、临床试验提供线索。 本案例介绍如何使用EIhealth平台虚拟药物筛选功能复现上述研究成果（https://doi.org/10.1021/acs.jcim.0c00821），并搭建虚拟药物筛选数据库。
运行大规模虚拟药筛任务 药物数据输入格式说明 订阅Docking Summary流程 新建研究 查看药筛结果 查看药筛作业和结果下载
新型冠状病毒（COVID-19）虚拟药物筛选 虚拟药物筛选简介 获取示例数据 创建虚拟药物筛选任务
获取示例数据 本示例中使用小分子化合物SMILES结构式文件和蛋白3D结构PDB文件作为输入数据，可通过如下方式获取。 登录医疗智能体平台，在“资产市场”中订阅“docking summary测试数据”至所需的项目中。 图1 示例数据 父主题： 新型冠状病毒（COVID-19）虚拟药物筛选
0c00821 查看“神农项目”药物筛选结果 登录EIHealth平台，可在“专题”页签中查看“神农项目”药物筛选结果。可参考视频介绍了解详细的使用指导。 在图2中，页面最右侧显示结合能的最大值和最小值，以及对应的列名称、行名称。 单击列名称或行名称，在弹窗中单击图标，可以对结合能数据进行排序。
output_file_type String 生成study作业结果的文件的类型 workflow_name String 使用的workflow名称 label String 使用的workflow标签 create_time String 作业创建时间 update_time String
搭建Docker环境，您可以任选以下两种方式搭建Docker环境。 使用自己的电脑搭建Docker环境。 使用华为云弹性云服务器ECS搭建Docker环境。 本示例中使用华为云弹性服务器ECS，并通过ECS搭建Docker环境。在创建ECS时，可以选择ECS的操作系统。例如，ECS如果为Linux操作系统，可以依次执行如下命令快速安装容器引擎。
Docker环境。 使用自己的电脑搭建Docker环境。 使用华为云弹性云服务器ECS搭建Docker环境。 本示例中使用华为云弹性服务器ECS，并通过ECS搭建Docker环境。在创建ECS时，可以选择ECS的操作系统。例如，在Linux操作系统下，可以使用如下命令快速安装容器引擎。
output_file_type String 生成study作业结果的文件的类型 workflow_name String 使用的workflow名称 label String 使用的workflow标签 create_time String 作业创建时间 update_time String
容器引擎几乎支持在所有操作系统上安装，用户可以根据需要选择要安装的容器引擎版本。请使用自己的电脑搭建Docker环境，或者使用华为云弹性云服务器ECS搭建Docker环境。 例如，在Linux操作系统下，可以使用如下命令快速安装容器引擎。 curl -fsSL get.docker.com
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