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资产市场 资产管理 资产收藏管理 供应商管理 父主题: API(医疗智能体平台)
EIHealth中的每一个分析作业都依托于应用运行。应用可以组合形成分析流程。 应用是生物信息学软件的镜像封装。您可以将软件制作成镜像,并将镜像上传至EIHealth平台,通过应用引入镜像。制作好的应用可以单独使用,也可以将多个应用编排入流程串联使用。在“项目管理”页面“工具”页签中,以列表形式展示了项目中
应用管理 应用管理 作业管理 自动作业管理 流程管理 流程统计管理 父主题: API(医疗智能体平台)
CPI作业管理 创建CPI作业 查询CPI作业详情 父主题: API(盘古辅助制药平台)
Nextflow引擎生命周期管理 Nextflow作业管理 Nextflow任务管理 Nextflow流程管理 父主题: API(医疗智能体平台)
数据管理 数据归档 数据管理 数据作业管理 OBS桶管理 父主题: API(医疗智能体平台)
药物作业管理 获取药物作业列表 取消药物作业 删除药物作业 更新药物作业 创建分子聚类作业 父主题: API(盘古辅助制药平台)
药物模型管理 获取基模型列表 创建模型 获取模型列表 更新药物模型 删除模型 父主题: API(盘古辅助制药平台)
{row_num} 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 eihealth_project_id 是 String 平台项目ID,您可以在平台单击所需的项目名称,进入项目设置页面查看。 最小长度:1 最大长度:128 project_id 是 String 华为云项目ID,您可以从获取项目ID中获取。
新建作业 Nextflow作业依托于流程运行,需要您先新建流程,再基于流程创建作业。 选择“作业>分析作业>Nextflow”,单击“新建作业”。 设置作业参数。 作业名称:设置作业名称。名称长度为1-63,只允许出现中划线、字母和数字。 标签:设置作业标签。最多可以设置5个。 描述:作业描述。
分子优化作业管理 创建分子优化作业 查询分子优化作业详情 父主题: API(盘古辅助制药平台)
需求进行设置;CPU架构、计算节点标签,不可修改。GPU包含NAIDIA架构GPU和自研的D310+ARM。选择GPU资源时,需要您在购买平台时包含了GPU资源,并且需要应用支持GPU运行。选择D310+ARM时,需要应用支持ARM环境运行,并在创建应用时,镜像系统为ARM类系统。
notebook开发环境 notebook开发环境 父主题: API(医疗智能体平台)
分子对接作业管理 创建分子对接作业 查询分子对接作业详情 父主题: API(盘古辅助制药平台)
分子生成作业管理 创建分子生成作业 查询分子生成作业详情 父主题: API(盘古辅助制药平台)
药物数据库管理 创建数据库 获取数据库列表 删除数据库 更新药物数据库 数据库追加文件 父主题: API(盘古辅助制药平台)
yaml或.txt文件,保存为txt文件时,其内容需为yaml格式。 修改流程yaml模板。 在本地编写模板,模板中的参数与在EIHealth平台新建流程过程一致。 修改yaml模板时,详细的命令和参数请参见流程配置文件说明。 # 详情说明可参考API文档中流程管理- 创建流程 workflow:
yaml或.txt文件,保存为txt文件时,其内容需为yaml格式。 修改应用yaml模板。 在本地编写模板,模板中的参数与在EIHealth平台新建应用过程一致。 修改yaml模板时,详细的命令和参数请参见应用配置文件说明。 # 详情说明可参考API文档中应用管理-创建应用 app:
安装容器引擎 容器引擎是一个开源的引擎,可以轻松的为任何应用创建一个轻量级的、可移植的、自给自足的容器。 容器引擎几乎支持在所有操作系统上安装,用户可以根据需要选择要安装的容器引擎版本。请使用自己的电脑搭建Docker环境,或者使用华为云弹性云服务器ECS搭建Docker环境。
导入流程 导入流程是将隶属于其他项目中流程导入至本项目中,流程所依托的应用和镜像会同步导入。 使用“导入流程”功能,用户需是其他项目中的成员,且为其他项目的“所有者”或“管理员”。 单击“导入流程”,进入导入流程页面。 图1 导入流程 选择需要引用的项目以及项目中的流程,选择流程