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执行以下命令,导入配置的MPI环境变量。 # source ~/.bashrc 执行以下命令,查看MPI环境变量是否正常。 # which mpirun 图2 查看MPI环境变量 系统回显结果如图2所示,则环境配置正常。 执行以下命令,在单个弹性云服务器上运行Intel MPI benchmark。
创建镜像需选择ECS系统盘镜像。 需修改镜像属性才能在ECS创建界面的C6h规格中选择到相应的镜像。 镜像获取 请联系技术支持进行操作。 创建系统盘镜像 请使用镜像文件创建系统盘镜像,需注意镜像用途选择ECS系统盘镜像如图1,选择启动方式为UEFI图2,否则系统无法启动。 图1 创建系统盘镜像
什么是HPC 高性能计算(High-performance computing,HPC)是一个计算机集群系统,它通过各种互联技术将多个计算机系统连接在一起,利用所有被连接系统的综合计算能力来处理大型计算问题,所以又通常被称为高性能计算集群。 HPC的业务特点 科学研究、气象预报、
如果当前资源配额限制无法满足使用需要,您可以申请扩大配额。 怎样查看我的配额? 登录管理控制台。 单击管理控制台左上角的,选择区域和项目。 在页面右上角,选择“资源 > 我的配额”。 系统进入“服务配额”页面。 图1 我的配额 您可以在“服务配额”页面,查看各项资源的总配额及使用情况。 如果当前配额不
选择“许可证类型”。 在云平台上使用操作系统或软件的许可证类型。如果您选择的镜像为免费的,则系统不会展示该参数。如果您选择的镜像为计费镜像,此时系统会展示该参数。 使用平台许可证 使用云平台提供的许可证,申请许可证需要支付一定的费用。 使用自带许可证(BYOL) 使用用户已有操作系统的许可证,无需重新申请。
选择,单击下拉框查看支持的云服务器规格。 系统盘:根据所需要的选择磁盘类型和大小。 选择云服务器类型前,请认真阅读各种类型云服务器的介绍和注意事项。具体内容请参见实例类型。 选择“计算节点配置”。 规格:公有云提供了多种类型的弹性云服务器供您选择,单击下拉框查看支持的云服务器规格。
MANPATH=$MPI_ROOT/share/man:$MANPATH unset MPI_REMSH 执行以下命令,查看环境变量导入是否成功。 # which mpirun 图3 查看环境变量 执行以下命令,在单个弹性云服务器上通过Spectrum MPI运行可执行文件。 执行以下命令,编辑文件。
MPI应用(以版本10.01.01为例)。 对于集群中的每台BMS,都需要执行该操作。 背景信息 IBM Spectrum MPI v10.1版本当前支持的操作系统列表如下: IBM Spectrum MPI 10.1.0.1 Eval for x86_64 Linux Red Hat Enterprise
执行以下命令,导入配置的MPI环境变量。 # source ~/.bashrc 执行以下命令,查看MPI环境变量是否正常。 # which mpirun 图2 查看社区OpenMPI环境变量 系统回显结果如图2所示,则环境配置正常。 执行以下命令,在单个弹性云服务器上运行Intel MPI
方便的对集群、节点、任务以及共享存储进行查看及管理操作,实现集群的一键式开通和部署等功能。 功能 说明 集群管理 HPC-S²的管理控制台提供了HPC-S²集群相关的集群创建、集群进度(包括创建/部署/扩容/缩容等操作)查看、集群详情查看、对集群进行管理(包括扩容、启动、停止、删除等操作)、实例topo管理的功能。
PC的权限。具体请参考“创建文件系统” 选择“调度器”。 当前只支持slurm和sge两种调度器,系统默认调度器为slurm,请根据所需自行选择。 核对当前配置,确认无误后单击“部署HPC集群”,提交创建。 提交成功后,返回到集群管理页面,可查看到集群列表中该集群已经是“部署中”
已成功创建弹性云服务器,并绑定了弹性IP进行登录。 操作步骤 使用“PuTTY”,采用密钥对方式登录集群中任意一台ECS。 执行以下命令,防止系统超时退出。 # TMOUT=0 将ECS对应的密钥文件(.pem文件,假设为*.pem)拷贝至.ssh目录下,命名为“id_rsa”。 $
-a 命令查看 关闭超线程 系统默认关闭,如果是打开的,需要进行关闭。 判断系统是否开启超线程。 通过查询系统的物理核数和逻辑核数的关系可以判断是否开启多线程,如果:逻辑核数 = 物理核数,说明没有开超线程;逻辑核数 = 2*物理核数,说明系统开启了多线程。 Linux系统可以通过
前提条件 已成功创建BMS,并绑定了弹性IP进行登录。 操作步骤 使用“PuTTY”,采用密钥对方式登录集群中任意一台BMS。 执行以下命令,防止系统超时退出。 # TMOUT=0 将BMS对应的密钥文件(.pem文件)拷贝至.ssh目录下,命名为“id_rsa”。 $ cd ~/.ssh
报文。 connected模式具有更好的性能,但是会消耗系统更多的内存。多数系统更关注性能,因此大多数场景下IB网口配置为connected模式。 当前版本的网卡驱动不支持connected模式。 由于网卡驱动性能原因,系统关闭了connected模式,因此,当前版本网卡驱动不支持配置connected模式。
已使用私有镜像创建多个弹性云服务器。 操作步骤 使用“PuTTY”,采用密钥对方式登录弹性云服务器。 登录用户为创建弹性云服务器时指定的用户名。 执行以下命令,防止系统超时退出。 # TMOUT=0 执行以下命令,验证参加测试的弹性云服务器之间是否可以免密码互相登录。 $ ssh 用户名@SERVER_IP
Bring your own license (BYOL) 磁盘 也称云硬盘,包括系统盘和数据盘。 系统盘 如果镜像未加密,则系统盘也不加密,并在界面上显示“Unencrypted”。如果您选择加密镜像,系统盘会自动加密,具体请参见• 加密涉及的参数(可选配置)。 数据盘 您可以为弹性
已配置BMS集群间互相免密登录。 操作步骤 查询是否安装了IB驱动。 执行以下命令,查询是否已成功安装IB驱动。 $ ls /usr/mpi/gcc/openmpi-3.1.0rc2/bin/mpirun $ rpm -qa | grep mlnx-ofa 图1 确认已安装IB驱动 查看回显结果。 如果回