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已配置BMS集群间互相免密登录。 操作步骤 安装OpenMPI。 下载社区OpenMPI,版本号为“openmpi-4.0.2.tar.bz2”。 下载地址:https://download.open-mpi.org/release/open-mpi/v4.0/openmpi-4.0.2.tar
MMPS, GROMACS。同时HPC常用的调度软件也对断点续算有集成支持,如PBS、Slurm与LSF等。 本节以LAMMPS为例,介绍如何在HPC进行断点续算。 步骤1 安装FFTW 依次执行以下命令,安装FFTW软件。 yum install gcc-gfortran gcc-c++
集群云服务器节点创建完成,但在部署过程中失败了能否修复? 将集群删除,不要勾选“删除云服务器”,使用已有节点部署集群的方法重新部署集群。 父主题: 常见问题
sysctl -w net.ipv4.ip_local_port_range=”20000 65535” >> /etc/sysctl.conf 执行以下命令验证。 sysctl -a | grep ipv4 | grep range 修改内存限制 设置方法: 设置在内存中锁定进程的最大
鲲鹏裸金属服务器支持使用的MPI HPC当前支持的MPI包括: 驱动自带的OpenMPI 社区OpenMPI MPICH 以下小节的内容详细介绍了MPI的安装与使用,您可以根据需要选择合适的MPI进行安装。 父主题: 安装和使用MPI(鲲鹏BMS场景)
3的HPC-X版本是“hpcx-v2.2.0-gcc-MLNX_OFED_LINUX-4.3-1.0.1.0-redhat7.3-x86_64.tbz”。 下载地址:https://developer.nvidia.com/networking/hpc-x 将下载的软件包拷贝到BMS内(建议在“/home/rhel”目录下)。
对于集群中的每台BMS,都需要执行该操作。 前提条件 已配置BMS集群间互相免密登录。 操作步骤 安装MPICH。 下载MPICH。 下载地址:https://aur.archlinux.org/packages/mpich/ 执行以下命令,解压并安装MPICH。 以mpich-3
裸金属服务器场景典型应用 创建裸金属服务器集群 配置BMS集群互相免密登录 安装和使用MPI(X86 BMS场景) 安装和使用MPI(鲲鹏BMS场景) 在HPC集群上运行MPI应用(X86 BMS场景) 在HPC集群上运行MPI应用(鲲鹏BMS场景)
弹性云服务器场景最佳实践 HPC断点续算计算方案 基于STAR-CCM+部署HPC集群
弹性云服务器场景典型应用 创建支持IB网卡的弹性云服务器 配置单个ECS免密登录 安装和使用MPI 制作私有镜像 创建应用集群 配置ECS集群互相免密登录 在HPC集群上运行MPI应用
0.1/bin:$PATH” >> /root/.bashrc 验证MPI运行在RoCE网络上 执行以下命令,安装iproute2。 yum -y install iproute* 执行以下命令,查看RoCE上是否有流量。 rdma res show 若MPI运行中,回显结果中qp
ssh-key-gen # 拷贝公钥到指定主机的~/.ssh/authorized_key文件中 ssh-copy-id root@目标主机IP 例如:ssh-copy-id root@192.168.0.166 配置ssh第一次登录免输入yes 在~/.ssh/config文件中加入如下内容:
操作步骤 关闭防火墙。 登录集群中任意一台BMS。 执行以下命令,关闭BMS防火墙。 # service firewalld stop # iptables -F 执行以下命令,查看防火墙是否关闭成功。 # service firewalld status 图1 确认关闭防火墙成功
Access)是一种直接内存访问技术,它将数据直接从一台计算机的内存传输到另一台计算机,无需尤其是面对高性能计算HPC、大数据分析和浪涌型IO高并发、低时延应用,现有TCP/IP软硬件架构和应用高CPU消耗的技术特征根本不能满足应用的需求。 RDMA优势 零复制:零复制网络技术使网卡可以直接与应用内存相互传输数据,
STAR-CCM+部署HPC集群流程图 本文档介绍如何通过仿真软件STAR-CCM+部署HPC集群,流程如图1所示。 图1 基于STAR-CCM+部署HPC集群流程图 父主题: 基于STAR-CCM+部署HPC集群
操作步骤 关闭防火墙。 登录集群中任意一台BMS。 执行以下命令,关闭BMS防火墙。 # service firewalld stop # iptables -F 执行以下命令,查看防火墙是否关闭成功。 # service firewalld status 图1 确认关闭防火墙成功
操作步骤 关闭防火墙。 登录集群中任意一台BMS。 执行以下命令,关闭BMS防火墙。 # service firewalld stop # iptables -F 执行以下命令,查看防火墙是否关闭成功。 # service firewalld status 图1 确认关闭防火墙成功
操作步骤 关闭防火墙。 登录集群中任意一台BMS。 执行以下命令,关闭BMS防火墙。 # service firewalld stop # iptables -F 执行以下命令,查看防火墙是否关闭成功。 # service firewalld status 图1 确认关闭防火墙成功
指定的物理核数。 ip1,ip2:运行STAR-CCM+指定的主机信息。 core_num1,core_num2:指定每个主机运行的物理核数。 hiroce gids:查下设备名和index。 UCX_NET_DEVICES: hiroce gids查到的有ip值一行的ib_dev的值:
第1个1表示备份文件系统,第2个1表示从/分区的顺序开始fsck磁盘检测,0表示不检测,_rnetdev 表示主机无法挂载直接跳过,避免无法挂载主机无法启动。 设置服务开机自启动 systemctl enable rpcbind systemctl enable nfs 父主题: 实施步骤