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LAMMPS， GROMACS。同时HPC常用的调度软件也对断点续算有集成支持，如PBS、Slurm与LSF等。 本节以LAMMPS为例，介绍如何在HPC进行断点续算。 步骤1 安装FFTW 依次执行以下命令，安装FFTW软件。 yum install gcc-gfortran gcc-c++
STAR-CCM+部署HPC集群流程图 本文档介绍如何通过仿真软件STAR-CCM+部署HPC集群，流程如图1所示。 图1 基于STAR-CCM+部署HPC集群流程图 父主题： 基于STAR-CCM+部署HPC集群
对象存储服务（OBS） 提供海量、安全、高可靠、低成本的数据存储能力。 华为 >1 以华为云管理控制台显示为准。 9 镜像服务（IMS） 提供镜像（ROCE）的全生命周期管理能力，具有便捷、安全、灵活、统一的优势。 华为 1 以华为云管理控制台显示为准。 仿真软件STAR-CCM+安装在SFS
弹性云服务器使用的VPC网络DHCP不能禁用。 安全组 安全组用来实现安全组内和安全组间弹性云服务器的访问控制，加强弹性云服务器的安全保护。用户可以在安全组中定义各种访问规则，当弹性云服务器加入该安全组后，即受到这些访问规则的保护。 配置方法请参见为安全组添加安全组规则。 常用端口与协议的用途如下，请按需开启：
用于在公有云平台上创建高性能计算服务器。 虚拟私有云（VPC） HPC场景下所涉及的云服务器，都位于同一个VPC中，并且需要使用VPC中的子网和安全组的相关网络安全隔离。 镜像服务（IMS） 在创建高性能计算的云服务器时，需要使用符合要求的镜像文件。 在制作私有镜像时，需要将已有的高性能计算云服务器创建为私有镜像，从而创建集群使用。
已配置BMS集群间互相免密登录。 操作步骤 安装Spectrum MPI。 获取IBM Spectrum MPI软件包，需要进行注册。 获取的IBM Spectrum MPI软件包有两个，包括license和软件两部分： ibm_smpi_lic_s-10.1Eval-rh7_Aug11.x86_64
可以利用公有云的跨地域能力，共享计算资源，海量数据，并能实现云端大数据分析。 优化性能 性能比普通云服务器大幅提升。 通过虚拟化优化（SR-IOV、PCI直通）等，各类测试报告显示：大规模云化HPC性能损耗不大。 约束与限制 MPI和通讯库的版本需要提前适配RoCE，请联系技术支持进行操作，建议使用推荐版本运行STAR-CCM+。
Service，简称HPC-S²），主要面向对大规模计算有需求的企事业单位，为用户提供一站式可扩展的高性能计算，同时集成基础服务、业务软件等，实现一键式开通部署等功能，支持常用作业调度软件，例如slurm、sge及华为多瑙（Huawei commercial HPC Donau Scheduler）调
已配置弹性云服务器免密登录。 操作步骤 获取软件包。 获取IBM Spectrum MPI软件包。 下载地址：https://www-01.ibm.com/marketing/iwm/iwm/web/preLogin.do?source=swerpsysz-lsf-3 获取的软件包一般为两个，包括li
RoCE网络问题 dtest或rping打流测试网络双向不通问题 问题现象： dtest/rping打流测试网络双向不通问题：A机器作为Server端，B机器作为Client端，dtest/rping测试RoCE网络异常；调换A、B机器角色，B机器作为Server端，A机器作为C
C集群。 自定义购买ECS 虚拟私有云（VPC） 同一个HPC场景的云服务器，都位于同一个VPC中，并且需要使用VPC中的子网和安全组进行相关的网络安全隔离。 创建虚拟私有云和子网 修改虚拟私有云基本信息 镜像服务（IMS） 可以使用公共镜像、私有镜像、共享镜像创建高性能计算的云服务器。
com/products/infiniband-drivers/linux/mlnx_ofed/ 图2 IB驱动的下载页面 执行以下命令，安装软件包。 # yum install tk tcl # tar -xvf MLNX_OFED_LINUX-4.3-1.0.1.0-rhel7.3-x86_64
一VPC、同一子网内。 - 安全组 安全组用来实现安全组内和安全组间弹性云服务器的访问控制，加强弹性云服务器的安全保护。用户可以在安全组中定义各种访问规则，当弹性云服务器加入该安全组后，即受到这些访问规则的保护。 创建弹性云服务器时，可支持选择多个安全组（建议不超过5个）。此时，
3-x86_64.tbz”。 下载地址：https://developer.nvidia.com/networking/hpc-x 将下载的软件包拷贝到BMS内（建议在“/home/rhel”目录下）。 执行以下命令，解压HPC-X工具套件，并修改HPC-X工具套件目录。 # tar
要自行创建一个安全组使用，安全组规则的配置会影响弹性云服务器的正常访问与使用。 为确保集群能正常创建/部署，需保证安全组规则22端口开放，具体配置方法请参见：为安全组添加安全组规则。 一站式HPC服务使用弹性文件服务SFS作为文件共享存储，更多关于弹性文件系统的信息，请参见《弹性文件服务用户指南》。
华为云SFS Turbo提供按需扩展的高性能文件存储，并针对HPC有优化，建议直接使用华为云SFS Turbo存放算例文件。 HPC仿真软件STAR-CCM+需要每个节点都安装，比较麻烦，可以将STAR-CCM+直接安装在NAS存储中，每个节点直接将NAS挂载到本地盘中，简化安装，使用更加方便。
创建新的虚拟私有云。 安全组 安全组用来实现安全组内和安全组间裸金属服务器的访问控制，加强裸金属服务器的安全保护。用户可以在安全组中定义各种访问规则，当裸金属服务器加入该安全组后，即受到这些访问规则的保护。购买裸金属服务器时，支持选择裸金属服务器所在的安全组。目前，申请一台裸金属服务器时只能选择一个安全组。
挂载共享目录 安装软件 yum install nfs-utils 挂载SFS Turbo 将SFS Turbo挂载到/opt/Siemens目录 mkdir /opt/Siemens # 在/etc/fstab中添加开启自动挂载 echo "192.168.0.15:/ /opt/Siemens
域、虚拟私有云、安全组、节点信息以及共享存储以及集群的关系图等信息。 操作步骤 登录HPC-S²控制台。 单击左侧的“集群管理”。 在“集群管理”页面选择要查看的集群，单击集群名称查看集群详情页。 在集群的详情页面可查看集群ID、状态、所在区域、虚拟私有云、安全组、节点信息以及共享存储以及集群的关系图等信息。
规格：公有云提供了多种类型的弹性云服务器供您选择，单击下拉框进行选择； 系统盘：根据所需要的选择磁盘类型和大小； 网络配置。 集群扩容时，网络配置包括“虚拟私有云”、“安全组”以及“网卡”不可选，和集群初始创建时保持一致。 选择“镜像”。 推荐使用公共镜像，其他类型镜像可能出现扩容时自动部署失败的情况。 公共镜像（推荐）
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