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创建流程 功能描述 通过引用本地标准的workflow yaml文件创建workflow。 命令结构 health nextflow create workflow [params] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 --workflow -w 是 本地workflow文件路径，可以是zip或nf文件。
创建流程 使用create workflow命令引用本地的配置文件，创建流程。 命令结构 health create workflow [flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 --yaml -y 否 本地的流程模板路径。获取流程模板方法请参见流程配置文件说明。
创建应用 使用create app命令引用本地的配置文件，创建应用。 命令结构 health create app [flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 --yaml -y 否 本地的应用模板路径。获取应用模板方法请参见应用配置文件说明。 --description
HTTP请求方法 方法 说明 GET 请求服务器返回指定资源. PUT 请求服务器更新指定资源。 POST 请求服务器新增资源或执行特殊操作。 DELETE 请求服务器删除指定资源，如删除对象等。 HEAD 请求服务器资源头部。 PATCH 请求服务器更新资源的部分内容。当资源不存在的时
上传应用 通过在本地修改应用的yaml模板，上传应用至项目中。 获取应用yaml模板。 单击“上传应用”，在弹出的页面中下载yaml示例文件。 使用命令行工具，执行health get app -s命令获取创建应用的yaml模板，复制模板并保存到本地。可以保存成.yaml或.tx
fastp-file2。 图8 设置fastp输入数据 将GRCh38目录指定成bwa-mem与picard-insertsize的输入。 图9 设置bwa-mem输入数据 图10 设置picard-insertsize输入数据 若是想查看已经设置好的参数，可以按照下图步骤进行查
繁读写场景的任务建议开启IO加速，开启前需要先购买性能加速。 本地盘加速：使用计算节点的本地盘进行加速。使用本地盘加速时，需保证购买的计算节点带有“数据盘”。OBS桶中的数据不支持本地盘加速，使用OBS桶中数据用于本地盘加速，可能会导致作业运行失败。 图1 “OBS”标签代表数据引用来源为OBS桶
使用download命令将EIHealth平台的数据下载到本地，此命令不支持下载引用项目中的数据。 数据在下载的过程中，受网络影响可能出现损坏，下载命令默认会在下载完成后，验证项目中数据的MD5值与本地数据的MD5值的一致性，以及验证项目中数据的大小与本地数据大小一致性。 命令结构 health download
tag-name> 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 source-image-name 无 是 本地源镜像名称。 source-tag-name 无 是 本地源镜像tag名称。 target-image-name 无 是 新创建的镜像名称。 target-tag-name
繁读写场景的任务建议开启IO加速，开启前需要先购买性能加速。 本地盘加速：使用计算节点的本地盘进行加速。使用本地盘加速时，需保证购买的计算节点带有“数据盘”。OBS桶中的数据不支持本地盘加速，使用OBS桶中数据用于本地盘加速，可能会导致作业运行失败。 图1 “OBS”标签代表数据引用来源为OBS桶
繁读写场景的任务建议开启IO加速，开启前需要先购买性能加速。 本地盘加速：使用计算节点的本地盘进行加速。使用本地盘加速时，需保证购买的计算节点带有“数据盘”。OBS桶中的数据不支持本地盘加速，使用OBS桶中数据用于本地盘加速，可能会导致作业运行失败。 图1 “OBS”标签代表数据引用来源为OBS桶
上传流程 通过在本地修改流程的yaml模板，上传流程至项目中。 获取流程yaml模板。 单击“上传流程”，在弹出的页面中下载yaml示例文件。 使用命令行工具，执行health get workflow -s命令获取创建流程的yaml模板，复制模板并保存到本地。可以保存成.yaml或
繁读写场景的任务建议开启IO加速，开启前需要先购买性能加速。 本地盘加速：使用计算节点的本地盘进行加速。使用本地盘加速时，需保证购买的计算节点带有“数据盘”。OBS桶中的数据不支持本地盘加速，使用OBS桶中数据用于本地盘加速，可能会导致作业运行失败。 图1 “OBS”标签代表数据引用来源为OBS桶
块 > 通用工具 > MOL 3D Viewer”，进入MOL 3D Viewer页面即可操作。 主要功能包括： 本地分子结构的3D可视化，支持多种显示样式，支持本地文件拖拽进画布区域进行渲染。 大分子支持PDB编号自动下载。 相互作用的可视化。 支持分子的编辑、标注。 测量、测量距离、角度、二角面等。
环境。 使用自己的电脑搭建Docker环境。 使用华为云弹性云服务器ECS搭建Docker环境。 本示例中使用华为云弹性服务器ECS，并通过ECS搭建Docker环境。在创建ECS时，可以选择ECS的操作系统。例如，ECS如果为Linux操作系统，可以依次执行如下命令快速安装容器引擎。
Docker环境。 使用自己的电脑搭建Docker环境。 使用华为云弹性云服务器ECS搭建Docker环境。 本示例中使用华为云弹性服务器ECS，并通过ECS搭建Docker环境。在创建ECS时，可以选择ECS的操作系统。例如，在Linux操作系统下，可以使用如下命令快速安装容器引擎。
IO加速实例id，为空则不开启IO加速，设置相应加速包id将会开启加速。实例id可参考“系统设置命令>获取系统资源”章节获取。当id设置为：auto_schedule，则会自动调度加速包，当id设置为local_disk，则开启本地盘加速。 --nodeLabels -l 否 用于让作业调度到设置了该标签的节
使用download命令将EIHealth平台的数据下载到本地，此命令不支持下载引用项目中的数据。 数据在下载的过程中，受网络影响可能出现损坏，下载命令默认会在下载完成后，验证项目中数据的MD5值与本地数据的MD5值的一致性，以及验证项目中数据的大小与本地数据大小一致性。 命令结构 health download
选择“作业>分析作业>Nextflow”，单击“新建作业”。 设置作业参数。 作业名称：设置作业名称。名称长度为1-63，只允许出现中划线、字母和数字。 标签：设置作业标签。最多可以设置5个。 描述：作业描述。 流程名称：选择已创建的流程，如果还未创建，可参考新建流程进行创建。 优先级：设置作业优先级。在资源充足的情
选择“工具>Nextflow”，单击“新建流程”。 填写流程基本信息。 名称：设置流程名称。名称长度为1-56，只允许出现中划线、下划线、字母和数字。 标签：选择流程标签，最多可添加5个。 描述：设置流程相关描述。 单击“下一步”，添加流程文件。 单击“流程文件”后面的“添加”，添加流程文件。
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