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产品功能 eihealth-toolkit提供了以下功能: 系统设置 您可以使用该工具获取系统标签、系统资源、系统配额信息、消息列表,查询和修改消息及完成作业保留配置,也可以获取和修改供应商logo、名称设置。 项目管理 您可以使用该工具获取、切换、创建、更新、删除和转移项目,也可以添加、修改、移除项目成员角色。
靶点结构:选择靶点结构文件,仅支持PDB格式。若文件中包含多个受体,则默认只处理第一个。 单击下一步,配置配体文件,支持选择原始配体与上传配体文件两种方式 选择原始配体:选择靶点结构文件中已存在的原始配体用来定位口袋或作为片段优化,存在多个原始配体时可通过下拉框选择,与上传配体文件二选一。
最大值:1000 disk_encrypt 是 Boolean 磁盘是否加密 响应参数 无 请求示例 创建数据库资源,选择规格,设置磁盘大小为0,设置磁盘加密 https://eihealth.cn-north-4.myhuaweicloud.com/v1/{project_id
Long 指定下载对象的结束位置 最小值:0 最大值:9223372036854775807 响应参数 无 请求示例 文件下载,其中文件类型为PUBLIC,文件链接如下。 https://eihealth.cn-north-4.myhuaweicloud.com/v1/{proj
联系管理员。 节点数上限 设置自动扩容的节点数上限。 取值范围为0-50。 节点数下限 设置自动扩容的节点数下限。 取值范围为0-50。 CPU执行规则 设置CPU自动扩容的条件。 启用规则:默认开启。 触发条件:设置CPU分配率达到的条件,当满足设置的条件时进行自动扩容。取值范围:1-100。默认值:80。
project_id 是 String 华为云项目ID,您可以从获取项目ID中获取。 最小长度:1 最大长度:128 id 是 String 云服务器ID 最小长度:1 最大长度:128 请求参数 表2 请求Header参数 参数 是否必选 参数类型 描述 X-Auth-Token 是
最小值:1 最大值:1000 schedulable 否 Boolean 资源是否可调度 响应参数 无 请求示例 更新性能加速资源配置,设置作业数配额为2,设置我可调度 https://eihealth.cn-north-4.myhuaweicloud.com/v1/{project_i
极大方便了软件的安装和运行。 Docker镜像是一个模板,是容器应用打包的标准格式,在部署容器化应用时可以指定镜像。例如一个Docker镜像可以包含一个完整的Ubuntu操作系统环境,里面仅安装了用户需要的应用程序及其依赖文件。EIHealth平台使用容器镜像服务(Software
平台ID与“命令行工具 > 步骤3 初始化配置”中的platform-id对应。 登录医疗智能体平台。 在右上角用户名中选择“个人设置”,获取平台ID。 图3 个人设置 图4 平台ID 父主题: 配置命令行工具
修饰造成的亲和能改变。 单击“自由能微扰”功能卡片,进入上传文件页面。 在上传页面右侧,选择上传受体,上传配体,选择中心配体。 上传受体:受体仅支持PDB格式的文件。 上传配体:配体仅支持SDF、MOL2、PDB格式文件,且只支持3D结构。 选择参考配体:当前自由能微扰支持自动规
分子SMILES表达式为string,靶点设置的受体文件为project:/test.pdb,口袋中心位置为[0,0,0],口袋尺寸大小为[500,500,500],设置弱约束为eye_corrosion,类型为布尔值,值为true,设置强约束为sascore,类型为range,值为[0
最小长度:1 最大长度:32768 响应参数 状态码: 200 表3 响应Body参数 参数 参数类型 描述 quantity Integer 剩余服务器数 cpu Integer 剩余CPU ram Integer 剩余内存 请求示例 获取节点剩余配额 https://eihealth.cn-north-4
最小长度:1 最大长度:32768 响应参数 状态码: 200 表3 响应Body参数 参数 参数类型 描述 server String 服务器地址 subject_prefix String 展示名 user_name String 用户名 email String 邮箱 language
您可以导入本项目或使用其他项目中的数据生成数据库。 选择好文件后,通过设置数据的分隔符、跳过的行数来设置有效数据的起始位置。 常见的分隔符有“;”、“,”、“\t”,除此之外您也可以使用其他分隔符。以图1为例,分隔符为制表符,创建数据库时,分隔符填写为“\t”,有效数据从第2行开始,跳过文件行数填写为1。 在本地编写
工具管理简介 EIHealth中的每一个分析作业都依托于应用运行。应用可以组合形成分析流程。 应用是生物信息学软件的镜像封装。您可以将软件制作成镜像,并将镜像上传至EIHealth平台,通过应用引入镜像。制作好的应用可以单独使用,也可以将多个应用编排入流程串联使用。在“项目管理”
are set as primary keys. 检查设置为主键的列是否设置为允许为空。 400 eihealth.01040004 The uploaded template cannot be empty. 检查上传的模板文件内容是否已填写。 400 eihealth.01040005
public private url 是 String 文件URL,用户私有数据中心为项目路径、公共数据场景为obs地址。 最小长度:1 最大长度:2000 eihealth_project_id 否 String 模型文件所在项目id,仅文件为数据中心时填写。 最小长度:1 最大长度:128
受体蛋白文件。 ligand 是 ReceptorDrugFileReq object 配体小分子文件。 表4 RunReceptorPreprocessReq 参数 是否必选 参数类型 描述 file 是 ReceptorDrugFileReq object 受体文件。 remove_water
在“数据中心”页面,使用“复制”,将本项目的某一个文件、文件夹复制到其他文件夹中。 单击页面右上角“复制”。 图1 复制数据 选择需要复制的文件或文件夹,以及数据存储路径,单击“确认”,复制数据。 例如,将“test.zip”文件复制到“abc”文件夹中。复制数据时可单击图标创建文件夹。 图2 复制数据 下载数据
点标签是否一致,都会被调度到应用的节点标签所对应的计算节点上。 如果设置了不存在的计算节点标签,作业会进入等待,直至配置了相应的标签。 超时时间:作业运行时间超过设置时间时,认为超时,默认1440分钟,最大可设置为144000分钟,即作业运行至多100天。 加速类型: 加速效率:IO加速>本地盘加速>无