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可用区(AZ,Availability Zone) 一个AZ是一个或多个物理数据中心的集合,有独立的风火水电,AZ内逻辑上再将计算、网络、存储等资源划分成多个集群。一个Region中的多个AZ间通过高速光纤相连,以满足用户跨AZ构建高可用性系统的需求。 项目 华为云的区域默认对应一个项目,这个项目由系统预置
1 平台界面风格更新,新增项目管理,预置流程,项目间资产共享,开发环境升级,应用、流程支持X86、ARM运行,新增消息中心 项目管理:以项目为粒度对数据、分析作业、开发环境和镜像进行分组。以便用户通过项目进行资源的访问、共享和协作。 预置流程:预置流程包括NGS、GATK、Cell
在新建作业弹窗中单击“确定”。 图2 新建作业 在弹出的作业设置页面,填写作业信息。“作业名称”、“标签”、和“描述”,选择需要执行的流程,设置“输出路径”、“优先级”、“计算节点标签”、“超时时间”、“加速类型”。设置完成后单击“确定”。 基本信息:包含作业名称、标签、描述。
选择AI引擎并新建一个Console 文件创建成功后,将直接呈现Console页面。 图6 新建文件(Console) 上传文件 进入JupyterLab页面后,您可以单击左上角“Upload”快捷键,从本地选择一个文件上传。 图7 上传文件 编辑文件 JupyterLab可以在同一个窗口同
如果不需要设置靶点,此步骤可以进行省略,如果设置了靶点,作业运行时间会加长。 图3 靶点设置 图4 Target1设置 图5 Target2设置 图6 靶点设置完成 通过“靶点设置”上传靶点,并且设置对接口袋。 此处靶点设置为可选参数,如果选择靶点设置,可以将对接活性作为一个约束条件
环境。 使用自己的电脑搭建Docker环境。 使用华为云弹性云服务器ECS搭建Docker环境。 本示例中使用华为云弹性服务器ECS,并通过ECS搭建Docker环境。在创建ECS时,可以选择ECS的操作系统。例如,ECS如果为Linux操作系统,可以依次执行如下命令快速安装容器引擎。
体小分子数据。参考以下数据要求,将数据上传至项目中。 输入蛋白质,pdb格式,将要进行对接的所有靶标蛋白放在一个文件夹内。 输入配体小分子,配体小分子为如下格式的txt文件。 第一列为smiles字符串,第二列为smiles名称,中间用tab键分割。 父主题: 运行大规模虚拟药筛任务
Docker环境。 使用自己的电脑搭建Docker环境。 使用华为云弹性云服务器ECS搭建Docker环境。 本示例中使用华为云弹性服务器ECS,并通过ECS搭建Docker环境。在创建ECS时,可以选择ECS的操作系统。例如,在Linux操作系统下,可以使用如下命令快速安装容器引擎。
展。 镜像 Docker镜像是一个模板,是容器应用打包的标准格式,在部署容器化应用时可以指定镜像。例如一个Docker镜像可以包含一个完整的Ubuntu操作系统环境,里面仅安装了用户需要的应用程序及其依赖文件。 项目 项目是EIHealth平台的一个工作空间,可以在项目中存储数据
单击“合成路径规划”功能卡片,进入配置页面。 在配置页面,可以在左侧绘制分子,也可以通过上传分子文件方式上传分子或者在白框内输入小分子SMILES表达式。 上传分子文件:支持SDF、MOL2、PDB、SMI格式文件。 最大搜索路径个数:合成路径规划的路径数量。路径数量增加,将展示更多的合理合成路
几种不同类型的归档,区别是什么 标准存储 标准存储访问时延低和吞吐量高,因而适用于有大量热点文件(平均一个月多次)或小文件(小于1MB),且需要频繁访问数据的业务场景。 适合高性能,高可靠,高可用,频繁访问场景。 归档存储 归档存储适用于很少访问(平均一年访问一次)数据的业务场景
Boolean 是否包含值域下限 upper Number 值域上限 upper_inclusive Boolean 是否包含值域上限 请求示例 查询一个CPI任务 GET https://{endpoint}/v1/{project_id}/task/cpi/{task_id} 响应示例 状态码:
upper 否 Number 值域上限 upper_inclusive 否 Boolean 是否包含值域上限 响应参数 无 请求示例 创建一个CPI任务 POST https://{endpoint}/v1/{project_id}/task/cpi { "header" :
upper 否 Number 值域上限 upper_inclusive 否 Boolean 是否包含值域上限 响应参数 无 请求示例 创建一个分子生成任务 { "num_trials" : 10000, "weak_constraints" : [ { "name"
upper 否 Number 值域上限 upper_inclusive 否 Boolean 是否包含值域上限 响应参数 无 请求示例 创建一个分子优化任务 POST https://{endpoint}/v1/{project_id}/task/optimization {
Docking,不需设置口袋信息,但需要为每一个靶点上传一个“模板配体文件”。 配置受体口袋位置,如果包含多个受体文件,需要每个受体都进行口袋设置,才能单击提交。 原始配体 将原始配体作为口袋位置,也可以通过上传配体文件来进行口袋设置。 选择残基 选择某些残基来作为口袋位置。 自动预测 如果受体口袋位置未知,可以使用自动预测软件来进行口袋位置预测。
强制操作,不进行询问提示,复制文件夹时该参数可选。 不加-f,会被询问是否执行操作,需选择yes或no。 --flat -l 否 复制文件夹时,只复制文件夹下的所有内容,复制文件夹时该参数可选。 --update -u 否 增量复制,设置该参数后,复制时会判断是否有同名文件,若有同名文件,则跳过不进行复制。
医疗智能体使用IAM实现认证功能。 对象存储服务(OBS) 对象存储服务(Object Storage Service,简称OBS)是一个基于对象的海量存储服务,为客户提供海量、安全、高可靠、低成本的数据存储能力。 医疗智能体使用OBS存储原始数据、参考组数据、计算结果等。 容器镜像服务(SWR)
参数类型 描述 name String 评估指标的名称 最小长度:1 最大长度:32 value Float 评估指标的评估结果 请求示例 查询一个自定义属性 GET https://{endpoint}/v1/{project_id}/custom-props/{task_id} 响应示例
Boolean 是否包含值域下限 upper Number 值域上限 upper_inclusive Boolean 是否包含值域上限 请求示例 查询一个分子生成任务 GET https://{endpoint}/v1/{project_id}/task/generation/{task_id}