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使用华为云弹性云服务器ECS搭建Docker环境。 本示例中使用华为云弹性服务器ECS,并通过ECS搭建Docker环境。在创建ECS时,可以选择ECS的操作系统。例如,在Linux操作系统下,可以使用如下命令快速安装容器引擎。 curl -fsSL get.docker.com -o get-docker.sh
8TB的单个文件。 数据在上传的过程中,受网络影响可能出现损坏,上传命令默认会在上传完成后,验证项目中数据的MD5值与本地数据的MD5值的一致性,以及验证项目中数据的大小与本地数据大小一致性。 命令结构 health upload <srcdir> <destdir> [flags]
使用华为云弹性云服务器ECS搭建Docker环境。 本示例中使用华为云弹性服务器ECS,并通过ECS搭建Docker环境。在创建ECS时,可以选择ECS的操作系统。例如,ECS如果为Linux操作系统,可以依次执行如下命令快速安装容器引擎。 curl -fsSL get.docker.com -o get-docker
license: "" health get app -s 获取app.yaml模板,以yaml格式打印到控制台 app: # 系统唯一标识,由系统随机分配,说明如下: # 1. 通过文件创建app时(UI\CMD),id必须为空,不允许指定 # 2. 通过文件修改ap
地。可以保存成.yaml或.txt文件,保存为txt文件时,其内容需为yaml格式。 修改流程yaml模板。 在本地编写模板,模板中的参数与在EIHealth平台新建流程过程一致。 修改yaml模板时,详细的命令和参数请参见流程配置文件说明。 # 详情说明可参考API文档中流程管理-
workflow: # 处理规则同app id: xxxx # 可选 # 流程唯一标识,由系统随机分配 # 处理规则同app name: xxxx # 必选 # workflow名称
缩容的策略配置权限。 操作员 拥有除用户管理、系统设置、设置商标、购买系统资源之外的所有权限。 购买平台的账户为管理员账户,该账户不可被删除。 管理员可以创建子用户,并将子用户授权为管理员。子管理员同样具备“用户管理”功能。 对于系统级别的管理员用户(购买平台的账户),可以在平台
Similarity:代表优化后的分子与原始分子的相似度。 QED:代表分子的成药性。 SaScore:代表合成可及性分数,旨在评估分子的合成难易程度。 图13 查看结果(2) 单击“查看3D”,可以看到分子的3D构象,如果设置了靶点,还可以看到优化后的小分子与靶点的结合构象。 如果上传了
为设置的参数值个数的乘积。 例如,存在输入参数a和输入参数b,在启动作业时,分别给参数a设置了2个参数值,给参数b设置了2个参数值。那么,系统将自动生成4个作业并发执行。 方式二:参考批量执行NGS分析操作。 参数确认无误后,单击“立即创建”,创建应用。 表1 fastp、bwa_samtools应用参数说明
选择属性模型:选择AI模型。如果需要创建模型,可参考AI模型。此参数只有专业版支持。一次最多可以选10个模型属性。属性模型的基模型必须与上一步所选择的基模型一致。 输出小分子表征:是否输出小分子表征文件,小分子表征文件可以用作训练模型使用,默认是不输出。 作业名称:设置作业名
准备工作 购买服务 购买存储套餐包 购买系统资源 获取认证信息 父主题: 用户指南(基因平台)
数字、中划线(-),开始只能是小写字母,结束只能是小写字母或数字。 描述 Notebook的简要描述。 镜像类型 支持系统镜像和自定义镜像。 工作环境 选择系统镜像时,工作环境选择“PY3”。 自定义镜像:当提供的镜像无法满足您的需求时,可以使用自己制作的Notebook镜像。镜
建场景; # 其他场景,app_id为系统分配的唯一标识 display_name: '步骤1' # 流程的子任务展示名称,最大长度64
网络、存储等资源划分成多个集群。一个Region中的多个AZ间通过高速光纤相连,以满足用户跨AZ构建高可用性系统的需求。 项目 华为云的区域默认对应一个项目,这个项目由系统预置,用来隔离物理区域间的资源(计算资源、存储资源和网络资源),以默认项目为单位进行授权,用户可以访问您账号
配额管理 盘古辅助制药平台分为基础版和专业版两个版本。 表1 基础版与专业版区别 功能配额 专业版 基础版 用户总数 50 10 项目总数 100 50 单用户创建项目数 20 20 作业并发数 150 30 模型训练&模型管理 支持 不支持 父主题: 用户指南(盘古辅助制药)
String 自动作业创建时间 finish_time String 自动作业结束时间 database_id String 自动作业依赖的数据库ID database_column String 自动作业状态更新列 database_column_type String 自动作业状
将gatk-markduplicates的输出参数markduped-bam与gatk-bqsr、gatk-applybqsr的输入参数markduped-bam相连。将gatk-bqsr的输出参数recal-table与gatk-applybqsr的输入参数recal-table相连。 图4
上传受体:受体仅支持PDB格式的文件。 上传配体:配体仅支持SDF、MOL2、PDB格式文件,且只支持3D结构。 选择参考配体:当前自由能微扰支持自动规划路径,选择参考配体后系统自动计算,用户也可自主添加或删除配体对。 图1 上传文件 引用外部桶时,需要确保所引用的数据不超过45层级的目录。 单击“下一步”,选择配体对。
引用OBS类型数据时,如果数据在OBS中的存储类型为“归档存储”,则将该数据引用过来后,该数据不能用于创建作业,并不可下载。 平台系统管理员在自己的所有者、管理员、操作者项目可以引用OBS类型数据。平台系统管理员在自己的所有者、管理员、操作者项目可以解除引用OBS类型数据。其他角色的用户仅能使用引用进来的OBS类型数据。
{app_name}::{app_version}::{src_project_name}格式,用于手动创建场景;其他场景,app_id为系统分配的唯一标识 最小长度:1 最大长度:135 display_name 否 String 流程的子任务展示名称,最大长度64 最小长度:0