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什么是HPC-S² HPC解决方案服务 高性能计算(High-performance computing,简称HPC)是一个计算机集群系统,通过管理节点对计算任务进行分解,交给不同的计算节点进行计算,以此来解决大型计算问题。在科学研究、气象预报、仿真实验、生物制药、基因测序、图像处理等行业均有广泛的应用。
选择“许可证类型”。 在云平台上使用操作系统或软件的许可证类型。如果您选择的镜像为免费的,则系统不会展示该参数。如果您选择的镜像为计费镜像,此时系统会展示该参数。 使用平台许可证 使用云平台提供的许可证,申请许可证需要支付一定的费用。 使用自带许可证(BYOL) 使用用户已有操作系统的许可证,无需重新申请。
创建镜像需选择ECS系统盘镜像。 需修改镜像属性才能在ECS创建界面的C6h规格中选择到相应的镜像。 镜像获取 请联系技术支持进行操作。 创建系统盘镜像 请使用镜像文件创建系统盘镜像,需注意镜像用途选择ECS系统盘镜像如图1,选择启动方式为UEFI图2,否则系统无法启动。 图1 创建系统盘镜像
什么是HPC 高性能计算(High-performance computing,HPC)是一个计算机集群系统,它通过各种互联技术将多个计算机系统连接在一起,利用所有被连接系统的综合计算能力来处理大型计算问题,所以又通常被称为高性能计算集群。 HPC的业务特点 科学研究、气象预报、
我的配额”。 系统进入“服务配额”页面。 图1 我的配额 您可以在“服务配额”页面,查看各项资源的总配额及使用情况。 如果当前配额不能满足业务要求,请参考后续操作,申请扩大配额。 如何申请扩大配额? 登录管理控制台。 在页面右上角,选择“资源 > 我的配额”。 系统进入“服务配额”页面。
按流量计费:按照实际使用的流量来计费。 选择“镜像”。 公共镜像(推荐) 常见的标准操作系统镜像,所有用户可见,包括操作系统以及预装的公共应用。请根据您的实际情况自助配置应用环境或相关软件。 私有镜像 用户基于弹性云服务器创建的个人镜像,仅用户自己可见。包含操作系统、预装的公共应用以及用户的私有应用。选择私有镜像创
Spectrum MPI(以IBM Spectrum MPI v10.1为例)。 其中,IBM Spectrum MPI v10.1版本当前支持的操作系统列表如下: IBM Spectrum MPI 10.1.0.1 Eval for x86_64 Linux Red Hat Enterprise
MPI应用(以版本10.01.01为例)。 对于集群中的每台BMS,都需要执行该操作。 背景信息 IBM Spectrum MPI v10.1版本当前支持的操作系统列表如下: IBM Spectrum MPI 10.1.0.1 Eval for x86_64 Linux Red Hat Enterprise
SFS”,并在弹性文件服务页面右上角选择“创建文件系统”。 图1 创建文件系统 2.在"创建文件系统"界面的"文件系统类型"选项中,根据业务需要,选择"HPC型"或"HPC缓存型"文件系统类型。 图2 选择文件系统类型 3.在"创建文件系统"界面的"选择网络"选项中,需注意与购买的弹性云服务器选择相同的网络配置。
用同一个镜像主版本。 购买须知 第一次使用公有云服务时,系统将自动为您创建一个虚拟私有云,包括安全组、网卡。同时,用户可根据需要自行创建一个虚拟私有云,更多关于虚拟私有云的信息,请参见《虚拟私有云用户指南》。 用户可使用系统自动创建的安全组,也可以根据需要自行创建一个安全组使用,
检查是否已安装IB驱动。 使用“PuTTY”,采用密钥对方式登录弹性云服务器。 执行以下命令,切换为root 用户。 $ sudo su 执行以下命令,防止系统超时退出。 # TMOUT=0 执行以下命令,查询是否已安装IB驱动。 # rpm -qa | grep mlnx-ofa # ls /u
下载需要的HPC-X工具套件以及OpenMPI。 使用社区OpenMPI时,需要同时使用Mellanox的HPC-X 套件,HPC-X 的下载需要参考弹性云服务器操作系统的版本以及IB驱动版本,例如,下载的HPC-X版本为:hpcx-v2.0.0-gcc-MLNX_OFED_LINUX-4.2-1.2.0
Bring your own license (BYOL) 磁盘 也称云硬盘,包括系统盘和数据盘。 系统盘 如果镜像未加密,则系统盘也不加密,并在界面上显示“Unencrypted”。如果您选择加密镜像,系统盘会自动加密,具体请参见• 加密涉及的参数(可选配置)。 数据盘 您可以为弹性
型显示为“混合计费”。 包年/包月:用户选购完云服务器配置后,可以根据需要设置购买时长,系统会一次性按照购买价格对账户余额进行扣费。 按需付费:用户选购完云服务器配置后,无需设置购买时长,系统会根据消费时长对账户余额进行扣费。 选择“当前区域”和“可用区”。 集群扩容时,当前区域不可选,默认为集群初始创建时所在区域。
前提条件 已成功创建BMS,并绑定了弹性IP进行登录。 操作步骤 使用“PuTTY”,采用密钥对方式登录集群中任意一台BMS。 执行以下命令,防止系统超时退出。 # TMOUT=0 将BMS对应的密钥文件(.pem文件)拷贝至.ssh目录下,命名为“id_rsa”。 $ cd ~/.ssh
命令查看 关闭超线程 系统默认关闭,如果是打开的,需要进行关闭。 判断系统是否开启超线程。 通过查询系统的物理核数和逻辑核数的关系可以判断是否开启多线程,如果:逻辑核数 = 物理核数,说明没有开超线程;逻辑核数 = 2*物理核数,说明系统开启了多线程。 Linux系统可以通过查询/pr
在HPC集群上运行MPI应用(X86 BMS场景) 该任务指导以CentOS7.3的OS为例在集群上运行MPI应用。 IB驱动自带的OpenMPI 社区OpenMPI Spectrum MPI Intel MPI Platform MPI 父主题: 裸金属服务器场景典型应用
报文。 connected模式具有更好的性能,但是会消耗系统更多的内存。多数系统更关注性能,因此大多数场景下IB网口配置为connected模式。 当前版本的网卡驱动不支持connected模式。 由于网卡驱动性能原因,系统关闭了connected模式,因此,当前版本网卡驱动不支持配置connected模式。
已成功创建弹性云服务器,并绑定了弹性IP进行登录。 操作步骤 使用“PuTTY”,采用密钥对方式登录集群中任意一台ECS。 执行以下命令,防止系统超时退出。 # TMOUT=0 将ECS对应的密钥文件(.pem文件,假设为*.pem)拷贝至.ssh目录下,命名为“id_rsa”。 $