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步骤4:查看与执行操作命令 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程,Linux和macOS环境使用方法基本相同,可参考。配置信息导入后,即可查询命令行工具支持的操作,并执行相关命令,使用EIHealth平台。 详细的操作命令请参见其他章节。 查询操作命令列表。
标签:设置任务标签。 单击“提交”。可在作业中心查看该作业的运行情况。 运行完成后,可在作业中心单击该作业查看输出结果。 单击按钮,可以收藏分子搜索结果,收藏后的结果可直接在收藏夹页查看。 图2 作业中心 图3 输出结果(1) 图4 输出结果(2) 图5 查看分子详情 图6 分子下游分析 图7
新建分子搜索任务接口 功能介绍 输入要查询的分子以及查询条件,创建分子搜索任务。 URI POST /v1/{project_id}/task/search 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String 华为云项目id 请求参数 表2 请求Header参数
查看对象属性 查看对象属性。 命令格式 health stat <obj> [flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 obj 不涉及 是 查看的文件、文件夹对象。 注意: 如果为引用数据,必须要使用绝对路径(文件夹最后要加/)。未引用的数据不能查看。 --bf -b
project_num Integer 项目总数 charge_mode Integer 计费模式 is_arrears Boolean 是否欠费 请求示例 查询医疗平台信息 https://eihealth.cn-north-4.myhuaweicloud.com/v1/{project_id}/system/overview
消息状态是否已读,true返回已读,false返回未读,不填返回全部 limit 否 Integer 查询条数 最小值:1 最大值:1000 缺省值:100 offset 否 Integer 查询偏移量 最小值:0 最大值:100000000 缺省值:0 请求参数 表3 请求Header参数
查看药筛结果 药筛运行状态可在“专题”页面查看。 图1 查看运行状态 运行完成后可单击任务名称,查看对接结合能的热图。 热图的横坐标为蛋白质名称,以及对接结合能的均值和标准差。纵坐标为配体小分子名称,数值为结合能的大小,结合能越小,颜色越偏紫色。 可以根据结合能的大小进行排序,结合能越小代表配体和受体结合越稳定。
查看执行结果 作业运行完成后,可以在“作业中心”页面,单击作业名称,查看输出结果和作业信息。 输出结果 当作业执行成功后,可以在作业中心页面,单击作业名称,查看输出结果。 在输出结果中可以查看下载某个任务或者全部任务的信息,可以在操作列查看3D、合成路径等信息。 图1 输出结果-列表视图
PROJECT_IMAGE total Integer 配额 unit String 配额项单位 usage Integer 配额使用量 请求示例 查询配额列表 https://eihealth.cn-north-4.myhuaweicloud.com/v1/{project_id}/quotas
最大长度:64 name String 规格名称 最大长度:64 ram Long 内存 vcpus String vcpus 请求示例 查询扩容策略详情 https://eihealth.cn-north-4.myhuaweicloud.com/v1/{project_id}/
count_after_scale Integer 伸缩后节点数 state String 执行状态 time String 执行时间 请求示例 查询伸缩历史 https://eihealth.cn-north-4.myhuaweicloud.com/v1/{project_id}/sy
每个小分子支持“查看详情”可以进入小分子的属性详情页;支持“下游分析”,可以进行分子属性预测、分子搜索、分子优化、合成路径规划分析。支持收藏功能,单击按钮,即可收藏CPI预测结果,收藏后可直接在收藏夹页查看。 图5 查看结果(2) 图6 查看结果(3) 查看作业信息页面。 从作
参数类型 描述 time String 事件产生时间 name String 事件名称 event_type String 事件类型 请求示例 查询伸缩事件列表 https://eihealth.cn-north-4.myhuaweicloud.com/v1/{project_id}/
切换到引用数据的路径,例如引用了gene-assent项目中的DataSet数据,使用health cd命令切换到该路径,并使用health ls名称查看详细数据。 当由引用数据的路径,切换到自己项目数据时,需指明具体的路径。 health cd gene-assent:/DataSet/ health
响应Body参数 参数 参数类型 描述 total Integer 总配额 usage Integer 已使用 unit String 单位 请求示例 查询evs配额及使用情况 https://eihealth.cn-north-4.myhuaweicloud.com/v1/{project_
数据管理 创建文件夹 查询数据列表 获取桶存量信息 复制项目数据 导入项目数据 导入网上数据 引用项目数据 订阅资产市场数据 上传数据文件 批量删除项目数据 获取桶列表 查询项目级数据权限控制策略 设置项目级权限控制策略 获取数据详情 设置数据对象策略 发布数据资产 父主题: 数据管理
下: 登录管理控制台。 单击用户名,在下拉列表中单击“我的凭证”。 在“API凭证”页面的项目列表中查看项目ID。 图1 查看项目ID 调用API获取项目ID 项目ID通过调用查询指定条件下的项目信息API获取。 获取项目ID的接口为GET“https://{Endpoint}/
分析流程至少由一个应用构成,流程中的各个应用由其前后顺序形成完整的计算工作流,一个应用的输出作为另一个应用的输入。 流程设计器是一种用于创建、查看、修改流程的图形化工具。借助流程设计器,您可以拖拽工具到画布中,可视化链接各应用,指定应用的先后顺序。 流程设计器界面 流程设计器界面由工具栏、资源栏和画布三部分构成。
有重定向日志输出到具体文件的话,此处无日志为正常现象。 子任务的事件中,确认作业子任务的实例是否有正常创建。 图2 子任务的事件 查看实例的事件,查看实例是否有正常创建。 图3 实例的事件 解决方法 若子任务未正常创建,请联系服务技术支持解决。 若子任务正常创建,但是实例未正常创
响应Body参数 参数 参数类型 描述 count Integer 节点总数 nodes Array of strings 节点列表 请求示例 查询对应扩容策略下的节点列表 https://eihealth.cn-north-4.myhuaweicloud.com/v1/{projec