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Notebook安装Conda指导 打开Notebook，在“File”页签下选择“Terminal”。 图1 选择Terminal 下载和安装Anaconda。 获取Repository和Anaconda安装包。 Repository: https://repo.anaconda
查看执行结果 作业运行完成后，可以在“作业中心”页面，单击作业名称，查看输出结果和作业信息。 输出结果 当作业执行成功后，可以在作业中心页面，单击作业名称，查看输出结果。 在输出结果中可以查看下载某个任务或者全部任务的信息，可以在操作列查看3D、合成路径等信息。 图1 输出结果-列表视图
搭建NGS流程 登录医疗智能体平台，进入项目并选择“工具 > 流程”页签，单击“新建流程”。 图1 新建流程 在弹出的“流程设置”页面填写“流程名称”和“版本”，其他参数可选填。参数填写完成后，单击“确定”，完成流程设置。 在流程设计器左侧应用列表中选择fastp、bwa-mem应用，并使用鼠标拖拽至画布中。
获取数据归档列表 使用get命令获取数据归档列表。 命令结构 health get archive-config # 命令中的archive-config可替换为backup-config 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程，Linu
数据库（可选） 数据库对应的是“项目管理>数据库”功能，可按使用需要购买。 图1 购买数据库 父主题： 购买计算资源（主账号操作）
方式2：使用预置应用搭建NGS流程 将EIHealth平台预置的应用构建成流程，并运行作业。以二代基因组分析流程：fastp，bwa-mem，bamqc，picard-insertsize两个算法为例。 应用是对每个软件的镜像封装，将应用封装好后可以反复利用并也可以让其他人很容易的使用，不用担心复杂的开发环境问题。
绑定CSS集群 功能介绍 绑定CSS集群。 URI POST /v1/{project_id}/drug/css-clusters 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String 项目ID，您可以从获取项目ID中获取。 最小长度：1 最大长度：128
受体预处理 功能介绍 受体预处理，用于前端显示预处理后的受体。 URI POST /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-common/receptor/preprocess 表1 路径参数 参数
聚类分析作业管理 创建聚类分析作业 查询聚类分析作业详情 父主题： API（盘古辅助制药平台）
自定义属性任务（MCP） 新建自定义属性任务接口 查询自定义属性任务 父主题： API（AI辅助药物设计）
Notebook常用操作 打开Notebook 首次打开Notebook之前，请先获取url，然后访问url。 然后单击“高级 > 继续前往xxxx（不安全）”，页面显示“403 : Forbidden”，然后返回Notebook列表页面。 请不要使用无痕浏览器访问。 返回平台操
创建自动作业 针对存在需要批量创建分析作业的场景，您可以选择创建自动作业。 在“自动作业”页签，您可以查看已创建的自动作业，包含作业名称、状态、数据表、创建者、创建时间；在操作列，您可以对已创建的自动作业执行启动、编辑、删除操作，运行中的作业可以执行停止操作。 图1 自动作业 前提条件
通用工具 MOL 3D Viewer MOL Editor 聚类分析 父主题： 功能模块
药物数据输入格式说明 药物虚拟筛选平台的输入数据，需要输入蛋白质和配体小分子数据。参考以下数据要求，将数据上传至项目中。 输入蛋白质，pdb格式，将要进行对接的所有靶标蛋白放在一个文件夹内。 输入配体小分子，配体小分子为如下格式的txt文件。 第一列为smiles字符串，第二列为smiles名称，中间用tab键分割。
创建分子聚类作业 功能介绍 创建分子聚类作业。 URI POST /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-jobs/{job_id}/cluster 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述
创建配体文件预览任务 功能介绍 创建配体文件预览任务，支持SMI、SDF、PDB、MOL2。 URI POST /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-common/ligand/preview 表1
受体预处理（Fasta格式） 功能介绍 受体预处理（Fasta格式），用于前端计算预期扣费次数 URI POST /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-common/receptor/fasta-preprocess
新建分子优化任务接口 功能介绍 输入起始小分子以及属性约束，创建分子优化任务。 URI POST /v1/{project_id}/task/optimization 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String 华为云项目id 请求参数
自由能微扰作业管理 创建自由能微扰作业 查询自由能微扰作业详情 父主题： API（盘古辅助制药平台）
上传镜像到SWR镜像仓库 上传镜像前，您需要安装容器引擎并完成镜像的制作，详细操作请参考安装容器引擎、制作Docker镜像。如果您已经安装了容器引擎，请跳过该步骤。 下载命令行工具并进行初始化配置。 使用health switch project命令进入到所需的项目中。 # 命令结构
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