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”字符本身。如果待复制的对象名匹配该参数,则跳过该对象的复制。 建议使用引号传递该匹配模式( macOS/Linux操作系统使用单引号,Windows操作系统使用双引号)防止特殊符号被操作系统转义,导致不可预期的结果。 该匹配模式作用于对象全路径(含从根路径开始的对象前缀和对象名,例如,桶内对象路径为obs://b
”字符本身。如果待上传的对象名匹配该参数,则跳过该对象的上传。 建议使用引号传递该匹配模式( macOS/Linux操作系统使用单引号,Windows操作系统使用双引号)防止特殊符号被操作系统转义,导致不可预期的结果。 该匹配模式作用于对象全路径(含从根路径开始的对象前缀和对象名,例如,桶内对象路径为obs://b
”字符本身。如果待移动的对象名匹配该参数,则跳过该对象的移动。 建议使用引号传递该匹配模式(macOS/Linux操作系统使用单引号,Windows操作系统使用双引号)防止特殊符号被操作系统转义,导致不可预期的结果。该匹配模式作用于对象全路径(含从根路径开始的对象前缀和对象名,例如,桶内对象路径为obs://b
id)启动作业时,必选。 --io-acc-id -c 否 IO加速实例id,为空则不开启IO加速,设置相应加速包id将会开启加速。实例id可参考“系统设置命令>获取系统资源”章节获取。当id设置为:auto_schedule,则会自动调度加速包,当id设置为local_disk,则开启本地盘加速。
图2 查看靶点口袋发现结果 图3 查看靶点口袋发现运动轨迹 查看2D相互作用图。 在“作业中心”单击作业名称,在输出结果页面右侧口袋列表,单击口袋后面的图标,然后单击查看2D相互作用图即可。 图4 查看2D相互作用图 查看作业信息图。 在“作业中心”单击作业名称,单击“作业信息”页面。可以查看作业的参数和运行信息。
interactions Array of Interaction objects 相互作用力列表。 数组长度:1 - 8 exclusive Boolean 是否排除指定的约束作用力。 operator String 多个作用力之间的逻辑关系。 枚举值: or and 表14 Interaction
是 Array of Interaction objects 相互作用力列表。 数组长度:1 - 8 exclusive 是 Boolean 是否排除指定的约束作用力。 operator 否 String 多个作用力之间的逻辑关系。 枚举值: or and 表13 Interaction
interactions Array of Interaction objects 相互作用力列表。 数组长度:1 - 8 exclusive Boolean 是否排除指定的约束作用力。 operator String 多个作用力之间的逻辑关系。 枚举值: or and 表14 Interaction
是 Array of Interaction objects 相互作用力列表。 数组长度:1 - 8 exclusive 是 Boolean 是否排除指定的约束作用力。 operator 否 String 多个作用力之间的逻辑关系。 枚举值: or and 表13 Interaction
了计算资源或者任务超时才会停止。 单击平台右上角的账号名称,会出现账号的相关操作,包括系统资源,系统配置等。注意这里只有管理员账号有系统资源,系统配置等操作,具体说明请参见用户管理。 图1 系统资源 父主题: 购买计算资源(主账号操作)
息栏中查看作业的输入&输出、节点参数、应用;在作业的子任务中可以查看日志、事件;在事件页签,可以查看实例的事件详情、下载YAML文件、查看监控。如果并发执行了多个作业,则会产生多个子任务。 对于执行失败的作业,鼠标指向作业状态,在弹出的提示框中可以查看“失败信息”和“失败原因”。
药物通用接口 生成分子SVG图 生成分子SDF三维结构 受体预处理 受体信息解析 受体口袋检测 配体格式转换为SMILES 生成相互作用2D图 计算配体间的3D结构差异 创建配体文件预览任务 查询配体文件预览任务 删除配体文件预览任务 创建配体相似性图计算任务 查询配体相似性图计算任务
omeagent_examples"), os.path.expanduser(f"~/work/{project_name}/genomeagent_examples"), dirs_exist_ok=True) os.chdir(os.path.expanduser(f"~/
关键概念 镜像 运行生物信息学软件,往往由于不同的操作系统(Windows、Linux、Mac等)原因,无法实现统一的运维管理。同时,这些软件具有不同的版本和软件包,安装、使用过程复杂。将生物信息学软件封装成Docker镜像,可以使程序在不同的环境中运行,并通过EIHealth平
Hub获取,不建议自己制作。 基础操作系统类镜像,如Ubuntu、Suse、Centos等。 基础编程语言类镜像,如Java、Python、R语言等。 基础通用类软件镜像,如Tomcat、Mysql、Ngnix等。 获取创建Notebook的镜像 创建Notebook时,平台为您提供了系统镜像和自定义镜像。
业。 用于创建Notebook Notebook是一个交互式应用程序,用于代码的编写、调试、运行。创建Notebook时,您可以选择系统镜像。当系统镜像无法满足您的开发需求时,您可以基于EIHealth提供的基础镜像包制作自定义镜像,并上传至平台。您可以在EIHealth平台“开
•克隆作业 通过“工具”页面创建 通过“上传作业”创建 如果在创建应用时打开了“并发”开关,可以设置多个参数值,批量执行作业。 可通过在“系统资源 > 计算资源”页面将计算节点的标签设置为copy-in,实现作业运行于指定的计算节点中。对于“不可调度”状态的计算节点,将无法在此节点运行作业。
--log-path -l 否 日志路径,不填写时默认为命令行工具当前路径下healthcli.log文件。 路径设置格式: Windows系统为“路径\文件名”。 Linux系统格式为“路径/文件名”。 --http-proxy -p 否 HTTP代理配置,格式为“http://username:
IHealth平台项目中数据、应用、流程和作业资源进行管理和使用。 操作步骤 下载命令行工具。 安装命令行工具。 本示例中以Windows系统为例,介绍安装命令行工具的方法。 下载Windows版本的客户端,得到health.exe文件,health文件无需安装,放置在任一文件夹中即可。
Key)加密调用请求。 Token认证 Token的有效期为24小时,需要使用同一个Token鉴权时,可以缓存起来,避免频繁调用。 Token在计算机系统中代表令牌(临时)的意思,拥有Token就代表拥有某种权限。Token认证就是在调用API的时候将Token加到请求消息头,从而通过身份认证,获得操作API的权限。