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autoconf libtool make yum install -y zlib zlib-devel 安装bwa软件，在github上下载bwa的源代码，并使用make编译。 yum install bwa git clone https://github.com/lh3/bwa.git cd
原始测序数据的质控报告，以HTML文件形式展示。 输出 BamQC Report 测序比对数据的质量控制报告，以HTML文件的形式展示。 输出 VCF 样本的突变信息，包含有SNP和INDEL信息，以VCF的格式存储。 输出 VCF Report 样本突变信息的质量控制报告，以HTML文件的形式展示。
在“作业”列表中，可单击作业名称查看作业信息和输入输出数据。 图8 查看作业信息 单击输出路径，可跳转至输出文件位置。html文件支持在线预览，zip文件可下载至本地查看。 图9 输出数据 图10 预览html文件 图11 获取zip文件 父主题： 运行作业
AccessKeyId=ABCDE&Expires=1676759470&Signature=DDDDD" }, { "name" : "report.html", "download_url" : "https://nextflow-cn-north-7-07d79450.obs.cn-north-7
io/docs/latest/tracing.html 对于pod配置，暂不支持用户侧设置。若用户侧设置的情况下可能会导致对应Process执行失败。相关信息可参考https://www.nextflow.io/docs/latest/process.html#pod 对于publishDir
参数名称：json-file 数据类型：File 必传：是 默认值：/fastp.json 参数4 参数名称：html-file 数据类型：File 必传：是 默认值：/fastp.html 参数1 参数名称：sorted-bam 数据类型：File 必传：是 默认值：/bwa-mem.sorted
autoconf libtool make yum install -y zlib zlib-devel 安装bwa软件，在github上下载bwa的源代码，并使用make编译。 yum install bwa git clone https://github.com/lh3/bwa.git cd
其余参数说明见：https://support.huaweicloud.com/clilist-eihealth/eihealth_31_0032.html 'job': { # 【必须】 'job_name': 'case1', 'project_name':
”快捷键，从本地选择一个文件上传。 图7 上传文件 编辑文件 JupyterLab可以在同一个窗口同时打开几个Notebook或文件（如HTML、TXT、Markdown等），以页签形式展示。 JupyterLab的一大优点是，可以任意排版多个文件。在右侧文件展示区，您可以拖动打
fq-file2 file Read2过滤之后输出fq.gz文件 json-file file 以JSON文件的格式输出的质控报告。 html-file file 以HTML的格式输出易于阅读的质控报告。 bwa-mem 输入参数 fq-file1 file 测序得到的fastq1文件。 fq-file2
获取Repository和Anaconda安装包。 Repository: https://repo.anaconda.com/archive/index.html Anaconda Installer: https://repo.anaconda.com/archive/Anaconda3-2022
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