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health create workflow [flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 --yaml -y 否 本地的流程模板路径。获取流程模板方法请参见流程配置文件说明。 --description -d 否 流程的详细描述信息。 --project 无 否 指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。
--add-command -a 否 作业额外执行的命令，如：--param1 hello。 --params -p 否 本地json/yaml格式参数文件路径。 --priority -o 否 作业优先级，支持输入的参数为0-9，默认值为0，0为最低优先级。 命令示例 health nextflow
由于molstar插件自身问题，部分靶点文件中存在REMARK行，会导致受体展示不完整。可通过手动删除文件中REMARK行来解决该问题。 如下所示： 分子优化靶点设置界面，受体展示正常。 但是下载该靶点文件后，使用通用工具Mol 3D Viewer打开，会出现蛋白显示不完整的情况，如下图所示。 此时可将
新建研究 进入“专题”页面，单击“新建研究”。 图1 新建研究 参考表1，设置运行信息。 表1 参数说明 参数 说明 选择项目 选择创建好，并带有数据的项目。 研究名称 可自定义研究名称。 流程 选择资产市场中订阅的Docking Summary流程。 配体分子 选择上传的配体小分子文件。
购买的资源到期后，您可以进行续费以延长有效期，也可以在购买时勾选到期自动续费。续费相关操作，请参见续费管理。 到期与欠费 如果购买资源到期或者账号欠费，会根据“客户等级”和“订购方式”定义不同的保留期时长，保留期内您将不能进行资源访问，保留期内资源处理和费用详见“保留期”。保留期满仍未续订或充值，数据将被删除且无法恢复。
ID 不涉及 否 流程ID，指定后获取流程ID对应的流程详情。不指定时，获取的是流程列表。 --param-file -p 否 参数文件保存路径，以yaml格式保存。如果没指定，则不会显示和保存参数信息。 命令示例 health nextflow get workflow 550e
&& ./configure --prefix=/usr/local/samtools && make && make install 按Esc键，并执行:wq保存并退出Dockerfile。 制作镜像。 docker build -t bwa_samtools:0.7.17-1.10
过质控、比对、变异检测等步骤，最终输出包含样本SNP、INDEL的VCF文件。 该案例介绍NGS的搭建步骤，涵盖镜像、应用、流程制作方法。用户也可以使用“资产市场”提供的已经搭建好的“Variant Calling Based On NGS”流程。该案例比“资产市场”流程多出VCF文件进行质控步骤。
参数--log的优先级高于--file。如果命令中同时包含参数--log和--file，默认只执行--log。 --file -f 否 本地文件夹路径及自定义文件名称，下载详细数据作业执行日志到本地，需要与data-job-id一起使用。 --finish-from-time -x 否
primary: false searchable: true tips: string 将示例文件存储到当前所在路径的app.yaml文件中 health get db template --sample > app.yaml 父主题： 数据库管理命令
只有项目所有者和管理员能修改。 --tags -t 否 项目标签，多个标签使用分号(;)分隔。 只有项目所有者和管理员能修改。 --policy -p 否 设置项目级数据权限策略。只有项目所有者能修改。 用数字0和1表示关闭和打开，以data-share、data-download、data-de
BMITTED，UNKNOWN --workflowName -w 否 流程名。此参数用于获取作业列表。 --userName -u 否 用户名。此参数用于获取作业列表。 --createStartTime -c 否 最小创建时间，格式：YYYY-MM-DD HH:MM:SS。例子："2006-01-02
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