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数据上传方法请参见“数据”页面上传。 使用命令行工具上传 命令行工具（eihealth-toolkit）配套EIHealth平台，提供数据、应用、流程和作业资源的管理和使用，支持上传最大为48.8TB的单个文件。 数据上传方法请参见命令行工具概述。 对于非挂载目录以外的目录下的文件，重启Notebook
您可以根据实际情况进行变更。 续费 购买的资源到期后，您可以进行续费以延长有效期，也可以在购买时勾选到期自动续费。续费相关操作，请参见续费管理。 到期与欠费 如果购买资源到期或者账号欠费，会根据“客户等级”和“订购方式”定义不同的保留期时长，保留期内您将不能进行资源访问，保留期内
去水：去掉受体蛋白里面的水分子。 去金属离子：去掉受体蛋白里面的金属离子。 去水、去金属离子参数默认是勾选状态，若上传的受体中包含配体，提交任务时系统会自动删除配体。 单击“应用全局"，可以对受体进行批量处理。 单击“下一步”，进入配体预处理页面。 单击“上传配体”后的，选择配体文件。 配体文件仅支持输入1个文件。
步骤3：新建作业 单击作业页面的“新建作业”按钮，并选择需要运行的流程。这里作业名称可以用默认的名称，也可自己更改一个名称。同时，若想比较好的方式管理输出文件，也可以自行指定输出路径。 图6 新建作业 在作业页面添加好运行参数，添加方式与方式1相同。 配置好参数后，单击右上角“启动作业”按钮启动作业，同时会跳转回作业列表。
gatk-mergevcfs、discvrseq-variantqc连线关系 搭建好的流程如下图所示。单击流程设计器上方保存按钮，保存流程。创建好的NGS将显示在“项目管理 > 工具”页签中。 图8 NGS流程 父主题： 基于二代测序的基因组突变检测
最大长度：64 profile 否 String 系统镜像名 枚举值： PY3 响应参数 状态码： 201 表8 响应Body参数 参数 参数类型 描述 id String notebook ID 请求示例 创建notebook，使用系统默认镜像，需要cpu资源1C，内存资源5G。 https://eihealth
作业运行后，页面将跳转至“项目管理 > 作业”页面。您可以在该页面，查看作业的执行状态。单击作业名称即可进入作业详情页，查看运行进展和执行结果。 图2 作业详情 单击“概述”列按钮，在展开的信息栏中查看作业的输入&输出、节点参数、应用，单击输入输出参数的路径，即可跳转至数据管理页面，查看相应数
notebook镜像，支持PY3或者指定项目中镜像（格式为SourceProjectName/ImageName:TagName）。 若选择PY3，则代表使用系统镜像创建notebook；若选择SourceProjectName/ImageName:TagName，则代表使用自定义镜像创建notebook。
表4 NotebookToolDto 参数 参数类型 描述 display_name String 显示名称 profile String 系统镜像名 枚举值： PY3 请求示例 获取notebook工作环境 https://eihealth.cn-north-4.myhuaweicloud
新型冠状病毒（COVID-19）的出现在全球范围影响了人类健康，寻找有效治愈新冠肺炎的治疗方式是临床医生和药物研发人员最紧迫的工作。 为了全面、系统地评估药物对新冠病毒所有靶点蛋白的结合情况，华为云EI医疗智能体团队与华中科技大学同济医学院基础医学院、华中科技大学同济医学院附属武汉儿童
使用Unix管道技术连接比对和排序步骤，以缩短bwa和samtools的存放、读取、删除中间文件的时间。 流程针对GATK4中的限速步骤，进行了系统的优化加速。流程从contig-file中提取contig，根据contig下发对应的任务，并依据不同任务，指定并行下发的任务数，以降低流程整体的运行时间。
药物通用接口 生成分子SVG图 生成分子SDF三维结构 受体预处理 受体信息解析 受体口袋检测 配体格式转换为SMILES 生成相互作用2D图 计算配体间的3D结构差异 创建配体文件预览任务 查询配体文件预览任务 删除配体文件预览任务 创建配体相似性图计算任务 查询配体相似性图计算任务
约束条件是target2_binding_energy 您可以通过“上传靶点”，将受体文件上传。受体文件仅支持pdb格式的文件，提交任务时系统会自动删除受体中包含水、配体和金属离子。删除受体文件后，运行任务时会跳过靶点设置步骤。 口袋设置。 原始配体： 将原始配体作为口袋位置，也可以通过上传配体文件来进行口袋设置。
上传受体：受体仅支持PDB格式的文件。 上传配体：配体仅支持SDF、MOL2、PDB格式文件，且只支持3D结构。 选择参考配体：当前自由能微扰支持自动规划路径，选择参考配体后系统自动计算，用户也可自主添加或删除配体对。 图1 上传文件 引用外部桶时，需要确保所引用的数据不超过45层级的目录。 单击“下一步”，选择配体对。
最小长度：1 最大长度：128 image_tag String 镜像tag名 最小长度：1 最大长度：64 profile String 系统镜像名 枚举值： PY3 表7 NotebookStorage 参数 参数类型 描述 path String notebook存储路径 最小长度：1
最小长度：1 最大长度：128 image_tag String 镜像tag名 最小长度：1 最大长度：64 profile String 系统镜像名 枚举值： PY3 表9 NotebookStorage 参数 参数类型 描述 path String notebook存储路径 最小长度：1
析和验证，提高分析的效率和分析质量。也可以通过聚类找出一些关键的骨架，来进行下游分析或者优化等。 在输出结果页面左上角单击“聚类分析”后，系统开始进行分析，同时显示“聚类分析中”。 图5 聚类分析 待聚类分析完成后，单击“查看聚类结果”。进入聚类结果页。 图6 查看聚类结果 在聚
配置完成后，单击“提交”。 提交成功后，可以在“作业中心”查看执行结果。 查看多对多运行结果。 如果是多受体对多配体，打开作业结果页面可以看到结合能二维矩阵，支持分别按照靶点和小分子进行排序。 图4 查看结果（1） 查看一对多运行结果。 单击受体结合能框，跳转到单受体对多配体的结果表页面，可以下载全量及单条CPI预测结果。
高分析的效率和分析质量。也可以通过聚类找出一些关键的骨架，来进行下游的分子优化、合成路径规划等。 在输出结果页面左上角单击“聚类分析”后，系统开始进行分析，同时显示“聚类分析中”。 图9 聚类分析 待聚类分析完成后，单击“查看聚类结果”。进入聚类结果页。 图10 查看聚类结果 在
blood–brain barrier Penetration，血脑屏障。作用于中枢神经系统的药物需要穿过血脑屏障 (BBB) 才能达到其分子靶点。相反，对于具有外围靶点的药物，不需要BBB渗透以避免中枢神经系统副作用，单位为cm/s。logBB 大于-1为（BBB+）, logBB小于等
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