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description String 列描述信息 最小长度:0 最大长度:1024 nullable Boolean 列是否允许为空 primary Boolean 是否作为主键 searchable Boolean 是否可查询 unique Boolean 是否唯一 tips String
"testzip.zip", "workflow_file_url": "https://xxx/__nextflow__/assets/e6dcd289-dadb-48d9-b53b-e0c6c256932e/h3-compress/testzip.zip?Acce
"demo-template", "description" : "description", "columns" : [ { "name" : "column1", "type" : "Long", "description" : "description", "nullable"
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"description" : "description", "nullable" : false, "primary" : true, "searchable" : true, "unique" : true, "tips" : "tips"
# 列是否可查询,必填 tips: uuid # 列的查询提示,非必填, 若该列为可查询列,可提供查询提示 - name: user_name description: user name type:
或者骨架从小分子数据库中搜索到相似结构和排序,可实现百亿级小分子的秒级搜索。 单击“分子搜索”功能卡片,进入分子搜索页面。 在配置页面,进行分子搜索配置,包括输入小分子、选择搜索算法、选择输出个数。 图1 分子搜索页面 输入小分子:可以通过输入SMILES、上传文件或者直接绘制输入小分子。最终以SMILES为准。
合成路径规划 合成路径规划基于盘古药物分子大模型,根据给定的目标分子,可以设计出完整且合理的合成路径。 单击“合成路径规划”功能卡片,进入配置页面。 在配置页面,可以在左侧绘制分子,也可以通过上传分子文件方式上传分子或者在白框内输入小分子SMILES表达式。 上传分子文件:支持SDF、MOL2、PDB、SMI格式文件。
流程创建成功后,您可以对流程进行编辑,删除操作。 编辑 选择已创建成功的流程,单击操作列的“编辑”,进入流程编辑页面。除了流程名称不能更改,您可以修改已有流程的其他参数配置项。 删除 通过单击操作列“删除”,可删除对应的流程。 下载流程文件 单击流程名称,进入流程详情页面,单击流程文件后的“下载”,可下载该流程文件。
在“功能模块”页面,选择对应的模块,单击“立即使用”。 在具体的功能模块页面,配置相关参数信息。具体参考功能模块章节。 通过“作业中心”页面创建 新建作业 单击“新建”,在新建作业页面选择对应的模块。 图1 新建作业 单击“确定”,在对应的模块页面配置详细信息,具体请参考功能模块。 克隆作业 克隆已有的作
参数说明 参数 简写 是否必选 说明 --workflow -w 是 本地workflow文件路径,可以是zip或nf文件。 --name -n 是 流程名称。 --description -d 否 workflow的详细描述信息。 --labels -l 否 流程标签列表。以","分隔,如:"a
参数 简写 是否必选 说明 ID 无 是 流程id。 --workflow -w 否 本地workflow文件路径,可以是zip或nf文件。 --description -d 否 workflow的详细描述信息。 --labels -l 否 流程标签列表,用","分割,如"a,b,c"。
docker pull bbimber/discvrseq:release-1.17 制作bwa-mem镜像 在本地搭建Docker环境。 要求安装的容器引擎版本必须为1.11.2及以上。 下载bwa和samtools软件。 wget http://downloads.sourceforge
"baabcb56-5bb6-11eb-8a0d-fa163e3ddba1", "name" : "demo-workflow", "description" : "description", "labels" : [ "labelA", "labelB" ], "create_time" :
从头生成:通过指定的口袋从头生成小分子。 选定设计方式后,上传靶点结构,并配置其他参数。 图1 查看配置页面 靶点结构:选择靶点结构文件,仅支持PDB格式。若文件中包含多个受体,则默认只处理第一个。 单击下一步,配置配体文件,支持选择原始配体与上传配体文件两种方式 选择原始配体:选择靶
情况,直至购买了计算资源或者任务超时才会停止。 单击平台右上角的账号名称,会出现账号的相关操作,包括系统资源,系统配置等。注意这里只有管理员账号有系统资源,系统配置等操作,具体说明请参见用户管理。 图1 系统资源 父主题: 购买计算资源(主账号操作)
构相似的化合物聚成一类,从而找到有效骨架 ,辅助苗头化合物发现。 单击“功能模块 > 通用工具 > 聚类分析”功能卡片,进入配置页面。 图1 聚类分析配置页面 输入方式:选择文件和手动输入类型。 上传分子文件:选择可上传的分子文件。分子文件支持SMI格式文件;文件大小不超过5G;小分子支持10-10
计算节点标签:作业会调度到含有相应标签的计算节点上。 当应用也配置了标签,如果应用和作业的计算节点标签在同一计算节点上,则应用调度至该计算节点上;应用和它的作业,不管节点标签是否一致,都会被调度到应用的节点标签所对应的计算节点上。 如果设置了不存在的计算节点标签,作业会进入等待,直至配置了相应的标签。 超时时间:作
0:projectname。 --yaml -y 否 本地的应用模板路径。 --summary -s 否 应用的简要描述。 --description -d 否 应用的详细描述。 --commands -c 否 镜像启动命令。设置方法请参见创建FastQC应用样例。 --image
TaskInstanceStatusRsp 参数 参数类型 描述 phase String 实例执行状态 pod_ip String 实例IP host_ip String 实例所在节点IP host_name String 计算节点的名称 start_time String 实例创建时间 container_statuses