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com/lh3/bwa.git cd bwa;make 请预先安装好Git,并检查本机是否有ssh key设置。 输入exit退出容器。 查询容器id。 docker ps -a 制作快照。 docker commit -m "xx" -a "tsj" container-id tsj/image:tag
MOL Editor Mol Editor工具可以查看小分子的2D结构,以及编辑分子结构。 单击“功能模块 > 通用工具 > MOL Editor”,进入Mol Editor页面即可操作。可以通过单击右上角的“保存”,将编辑的分子结构保存在数据中心。 图1 保存分子结构 父主题:
基于流程ID创建分析作业,可使用health get workflow workflow-name:version:srcproject命令查询流程ID,srcproject为源项目名称,可选。不指定srcproject时,默认为当前项目。 --yaml和--workflow命令不能同时存在。
用户的资源数量和容量做了限制。如果当前资源配额限制无法满足使用需要,您可以联系技术支持工程师申请扩大配额。 怎么查看我的配额 在平台右上角用户名中选择“配额管理”,查看配额。 图1 配额管理 父主题: 用户指南(基因平台)
01040025 Invalid query criteria. 请检查查询条件的格式是否符合要求。 400 eihealth.01040026 Column {0} is not searchable. 请检查查询条件中的列是否为存在的列。 400 eihealth.01040027
待聚类分析完成后,单击“查看聚类结果”。进入聚类结果页。 图10 查看聚类结果 在聚类结果页面,可以查看每个聚类的分子数量等信息。 单击某个聚类的操作列的“查看详情”,即可进入聚类详情页面,聚类详情页支持以卡片、列表以及3D的形式查看。默认展示卡片页面,用户可自行进行切换。 图11 查看聚类详情
作业执行失败排查思路 启动作业后作业一直处于已提交的状态 问题现象 作业投递后一直处于已提交的状态。 问题排查和解决方案 查看execution log, 若execution log为空,请提交工单或联系服务技术支持。 execution log 提示K8S pod can‘t
提交成功后,可以在“作业中心”查看执行结果。 查看运行结果。 可以单击“下载”,下载分子属性预测结果信息。单击“操作”列的“查看”,查看分子信息。分子属性预测对应的下游分析为分子优化和合成路径,通过单击“下游分析”可以进行创建。 下载操作将会产生流量费用,具体可参考计费说明。 图2 查看结果(1)
选的排序方式进行展示。 图13 排序方式 单击每个分子卡片右上方的,可以选择“查看详情”、“查看3D”、“下游分析”、“下载3D”。 查看详情:单击查看详情,跳转至分子列表页进行查看。 查看3D:查看分子的3D视图。 下游分析:分子优化对应的下游分析为分子搜索、分子属性预测、分子优化和合成路径,单击“确定”即可创建。
0个。 查看模型列表 在AI模型页签下支持查看创建的所有模型。包括模型的名称、模型类型、基模型来源、创建时间、完成时间、创建者、状态、组织共享、操作等信息。 图2 查看属性模型列表 查看模型指标 查看loss值:loss代表模型训练的损失变化。 单击相应模型操作列的“查看loss”即可查看相应的训练集Loss。
项目详情提供了项目中数据大小、成员、创建时间等信息,您可以通过以下两种方式查看项目信息。 查看项目概览 单击项目名称左侧图标,或双击项目行中的空白处,展开项目概览页面。您可以在该页面查看项目的描述、标签、创建时间、更新时间、是否核心项目、数据大小和成员信息。 图3 项目概览 查看项目详细信息 单击项目名称,进入项目“
图3 查看靶点口袋发现运动轨迹 查看2D相互作用图。 在“作业中心”单击作业名称,在输出结果页面右侧口袋列表,单击口袋后面的图标,然后单击查看2D相互作用图即可。 图4 查看2D相互作用图 查看作业信息图。 在“作业中心”单击作业名称,单击“作业信息”页面。可以查看作业的参数和运行信息。
在作业列表中,单击对应的作业名称,可查看作业运行状态,运行时间等信息。 图13 作业运行状态 单击具体的每个应用,可以查看每个应用的运行信息:输入输出,节点参数,应用以及日志等信息。 单击具体的输出参数便可跳转到具体的文件位置。 图14 查看应用信息 图15 查看输入、输出数据位置 单击输出参数路径,可以跳转至输出文件位置。
选的排序方式进行展示。 图12 排序方式 单击每个分子卡片右上方的,可以选择“查看详情”、“查看3D”、“下游分析”、“下载3D”。 查看详情:单击查看详情,跳转至分子详情页进行查看。 查看3D:查看分子的3D视图。 下游分析:分子优化对应的下游分析为分子优化、分子搜索和合成路径规划,单击“确定”即可创建。
每个小分子支持“查看详情”可以进入小分子的属性详情页;支持“下游分析”,可以进行分子属性预测、分子搜索、分子优化、合成路径规划分析。 图5 查看结果(2) 图6 查看结果(3) 查看作业信息页面。 从作业结果页面单击“作业信息”查看作业信息界面。 图7 查看作业信息 父主题: 苗头化合物发现
下载操作将会产生流量费用,具体可参考计费说明。 图6 查看结果(1) 图7 查看结果(2) 图8 查看结果(3) 单击查看全部展示收敛性分析、RMSF和RMSD结果。 图9 查看结果(4) 单击查看轨迹预览轨迹动图。 图10 查看结果(5) 父主题: 先导化合物优化
靶点会默认下载两个靶点的结果。 图11 查看3D图 在查看3D的页面中,单击右侧的配体列表中,每个配体卡片右上角的,可以查看 查看详情:可以查看每个分子的属性信息和score。 查看属性:查看每个分子的基本属性。 查看2D相互作用图:查看靶点和分子之间的2D相互作用图,并且可以进行图片下载。
申请扩大配额。 EIHealth平台应用的基础设施如下: 统一身份认证(IAM) 容器镜像服务(SWR) 对象存储服务(OBS) 关于如何查看配额,如何申请扩大配额,请参见“《用户指南》 配额管理”章节。
单击“提交”。可在作业中心查看该作业的运行情况。 运行完成后,可在作业中心单击该作业查看输出结果,输出结果缩略图。 图2 查看运行结果(1) 单击查看路径,查看输出结果详情。 可以单击左上角“下载”,下载当前的输出结果。 下载操作将会产生流量费用,具体可参考计费说明。 图3 查看运行结果(2)
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