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“神农项目”简介 “神农项目”是完全免费公开的新冠药物虚拟筛选数据库。在抗疫期间，为了寻找有效治愈新冠肺炎的治疗方式，华为云医疗智能体项目团队联合多家科研机构，从新冠病毒蛋白序列开始，针对所有21个靶点蛋白进行同源建模、分子动力学模拟优化，获取了靶点蛋白的3D结构。并对超过8500
删除项目 使用delete命令删除项目。项目的所有者有权限执行该操作。 为了防止项目误删，执行项目删除命令后工具会提示用户进行二次确认输入要删除的项目，只有二次输入的项目名称和命令中的项目名称一致，命令行工具才会执行删除动作。 命令结构 health delete project
删除镜像标签 使用rmi命令删除当前项目中指定镜像标签。 对于本项目的私有镜像tag会做彻底删除，即删除数据库记录及远程仓库中的镜像tag。 对于其他项目的导入镜像tag或者资产市场订阅的镜像tag仅删除导入或者订阅关系，即只删除数据库记录。 命令结构 health docker
聚类分析 聚类分析工具可以通过骨架聚类方法，将大型小分子数据库中结构相似的化合物聚成一类，从而找到有效骨架 ，辅助苗头化合物发现。 单击“功能模块 > 通用工具 > 聚类分析”功能卡片，进入配置页面。 图1 聚类分析配置页面 输入方式：选择文件和手动输入类型。 上传分子文件：选择可上传的分子文件
导入应用 使用import命令导入应用，当前只支持导入单个应用。 订阅和已导入的应用不支持再被导入到别的项目。 命令结构 health import app <app-name:version:source_project_name> [flags] 或 health import
镜像管理简介 运行生物信息学软件，往往由于不同的操作系统（Windows、Linux、Mac等）原因，无法实现统一的运维管理。同时，这些软件具有不同的版本和软件包，安装、使用过程复杂。将生物信息学软件封装成Docker镜像，可以使程序在不同的环境中运行，并通过EIHealth平台的镜像管理
发布应用 您可以将创建的应用发布到资产市场，供其他项目订阅和使用。 发布资产前，需要先设置商标。详细可参考商标设置。 在“工具”页面选择“应用”。 选择需要发布的应用，单击“操作”列“更多”>“发布”。 在发布页面，填写发布应用的相关信息。 表1 发布应用参数说明 参数 说明 名称
购买存储套餐包 存储资源支持用户购买套餐包。存储资源包不能退订，不能抵扣已经产生的用量。您可以单击右上角“查询详情”，查看套餐包的具体使用量。 在平台右上角单击用户名，选择“系统资源”>“存储资源”。 在存储资源页面选择“套餐包”，单击“购买存储套餐包”。 图1 购买存储套餐包 填写套餐包的信息
导入数据库模板 导入模板 提供两种模板导入方式： 平台支持导入其他项目的模板，用户需是其他项目中的成员，且为其他项目的“所有者”或“管理员”，预置的模板不支持导入。 在左侧导航栏选择“模板”页签，单击“导入模板”。 导入方式选择“项目”，选择项目名称，勾选需要导入的模板，可以在“导入模板名称
发布镜像 您可以将创建的镜像发布到资产市场，供其他项目订阅和使用。 发布资产前，需要先设置商标。详细可参考商标设置。 单击项目名称，进入项目管理页面，选择“镜像”页签。 单击需要发布的镜像名称，进入镜像详情页面。 单击“操作”列的“发布”。 图1 发布镜像 在发布页面，填写发布镜像的相关信息
发布流程 您可以将创建的流程发布到资产市场，供其他项目订阅和使用。 发布资产前，需要先设置商标。详细可参考商标设置。 在“工具”页面选择“流程”。 选择需要发布的流程，单击“操作”列“更多”>“发布”。 在发布页面，填写发布流程的相关信息。 表1 发布流程参数说明 参数 说明 名称
购买资源 盘古辅助制药平台购买完成后，单击“进入平台”，在平台右上角单击用户名，选择“资源中心”。 您可以根据实际需求选择购买功能调用套餐包和存储套餐包。在后续使用过程中，也可根据使用情况随时购买资源。 资源中心 在“资源中心>功能调用”中可以查看功能调用套餐包的使用情况。 图1
归档数据 平台支持数据的归档机制，您可以将核心数据进行归档，避免误删造成损失。 在“数据”页面单击“归档”，进入归档数据页面。 图1 选择归档 填写归档的参数信息。 表1 参数说明 参数 说明 名称 设置归档数据的名称。归档名称长度为1-100。 描述 归档数据描述信息。 归档类型
发布数据 您可以将数据发布到资产市场，供其他项目订阅和使用。 发布资产前，需要先设置商标。详细可参考商标设置。 单击项目名称，进入项目管理页面，选择“数据”页签。 选择需要发布的数据或者文件夹，单击“操作”列的“更多>发布”。 图1 发布数据 在发布页面，填写发布数据的相关信息。
上传应用 通过在本地修改应用的yaml模板，上传应用至项目中。 获取应用yaml模板。 单击“上传应用”，在弹出的页面中下载yaml示例文件。 使用命令行工具，执行health get app -s命令获取创建应用的yaml模板，复制模板并保存到本地。可以保存成.yaml或.txt
应用配置文件说明 EIHealth中的每一个分析作业都依托于应用运行。应用是生物信息学软件和运行该软件所依赖的运行环境的镜像封装。 在EIHealth平台，创建应用的过程通过图形化的界面操作完成。在命令行工具中，该过程以配置文件的形式给出。您可以基于获取到的模板使用命令行工具创建应用
自定义数据库 盘古辅助制药平台支持用户自定义数据库，可以上传自己的数据构建自己的数据库，进行后续的分子搜索。构建自定义数据库需要先购买CSS资源和绑定CSS资源，详情见资源中心 自定义数据库 返回主页，单击“自定义数据库”进入界面，单击页面左上角的“创建数据库”，并填写相关信息。每个用户可新建
约束限制 当前Nextflow相关特性仅为公测版本，部分功能暂不支持，因此存在如下限制约束。 流程使用的镜像和数据需要按照医疗智能体（EIHealth）平台的规范进行上传 推荐通过eihealth-toolkit进行上传。eihealth-toolkit介绍详见什么是医疗智能体eihealth-toolkit
导入用户 EIHealth平台支持把华为云的IAM子用户导入至平台子用户。通过导入已有子用户，增加用户使用的便捷度，方便用户维护账号。 IAM用户导入只支持使用Domain用户导入。 使用管理员账户登录医疗智能体平台。 在右上角用户名中选择“用户管理”。 图1 用户管理 在用户管理页面
下载数据 在EIHealth平台下载数据 下载数据操作会产生流量费用，计费方式为按需计费，计费详情请参考OBS数据下载费用。 以下操作步骤是在“数据”页面下载数据至本地。您也可以使用命令行工具实现数据的下载。 在EIHealth平台“项目 > 数据”页面，展开数据文件夹，选择待下载的数据
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