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L文件、查看监控。如果并发执行了多个作业，则会产生多个子任务。 对于执行失败的作业，鼠标指向作业状态，在弹出的提示框中可以查看“失败信息”和“失败原因”。同时，使用不同颜色提示执行状态，特别是对于由多个应用构成的分析作业，通过颜色方便地区分应用的执行状态。 绿色：运行成功。 红色：运行失败。
最小长度：1 最大长度：128 image_tag String 镜像tag名 最小长度：1 最大长度：64 profile String 系统镜像名 枚举值： PY3 表7 NotebookStorage 参数 参数类型 描述 path String notebook存储路径 最小长度：1
最小长度：1 最大长度：128 image_tag String 镜像tag名 最小长度：1 最大长度：64 profile String 系统镜像名 枚举值： PY3 表9 NotebookStorage 参数 参数类型 描述 path String notebook存储路径 最小长度：1
Nextflow需要用户自己进行安装，安装的权限只有管理员拥有。 在平台右上角用户名中选择“系统设置”。 在“Nextflow配置”模块，单击“安装”。 图1 安装Nextflow 选择安装方式。目前支持GitHub获取和上传安装包两种方式。 GitHub获取：可以选择版本，目前支持选择的安装包版本v22
优先级：运行优先级，分为0~9级，优先级高的作业会被优先执行。默认值为0。 计算节点标签：作业会调度到含有相应标签的计算节点上。 当应用和作业都配置了标签，如果应用和作业的计算节点标签在同一计算节点上，则应用调度至该计算节点上；应用和它的作业，不管节点标签是否一致，都会被调度到应用的节点标签所对应的计算节点上。
辅助方式能更好的选择分子。从每个类里挑选出一两个分子进行后续分析和验证，提高分析的效率和分析质量。也可以通过聚类找出一些关键的骨架，来进行下游的分子优化、合成路径规划等。 在输出结果页面左上角单击“聚类分析”后，系统开始进行分析，同时显示“聚类分析中”。 图9 聚类分析 待聚类分
bqsr、gatk-haplotypecaller、gatk-mergevcfs和discvrseq-variantqc应用构成。在创建应用前，请先制作并上传应用所需的镜像。搭建NGS流程所需的镜像和版本如表1所示。 表1 NGS流程镜像信息 NGS流程步骤 描述 依赖镜像及版本
网络下载链接对应的md5列表，值用; 分隔，和网络数据链接一一对应。值用于下载完后对文件进行md5校验。 --project 无 否 指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程，Linux和macOS环境使用方法基本相同，可参考。
靶点优化基于分子动力学模拟和结构聚类，实现靶点结构优化 单击“靶点优化”功能卡片，进入配置页面。 配置靶点文件和相关参数信息。 靶点文件：支持PDB格式文件，文件大小不能超过10M。若文件中含有多个受体，默认只处理第一个。 靶点预处理： 去配体：提交任务时系统会自动删除配体。 是否平
于应用，不填默认1G；对于流程和作业，不填默认使用前一级的配置，填值会覆盖更新。覆盖关系：作业->流程->应用 最小长度：0 最大长度：24 gpu_type 否 String gpu架构类型，取值范围 ' '|GPU|Snt9|D310。对于流程和作业，不填默认使用前一级的配置
于应用，不填默认1G；对于流程和作业，不填默认使用前一级的配置，填值会覆盖更新。覆盖关系：作业->流程->应用 最小长度：0 最大长度：24 gpu_type 否 String gpu架构类型，取值范围 ' '|GPU|Snt9|D310。对于流程和作业，不填默认使用前一级的配置
API（医疗智能体平台） 项目管理 系统管理 数据管理 数据库管理 应用管理 资产市场 notebook开发环境 Nextflow接口
代码单元格。每一个Cell有两种模式：命令模式和编辑模式。 最左侧为蓝色条时，是命令模式，绿色条表示编辑模式（此时Cell中有光标，可以进行代码编写）。在命令模式下，按下“Enter”键或者鼠标单击代码框可以进入编辑模式。在编辑模式下，按下“ESC”键或者鼠标单击代码框左侧区域即可进入命令模式。
、小写字母、下划线、中划线。 核心项目 如果设置该项目为核心项目，不支持立即删除，会进入待删除项目列表。删除项目需要等待7天保留期，到期后系统自动删除。 说明： 一旦设置为核心项目，不可变为非核心项目，非核心项目支持变为核心项目。 标签 设置项目标签。 描述 设置项目描述。 数据保护策略
用户指南（盘古辅助制药） 欢迎使用盘古辅助制药平台 关键概念 准备工作 配额管理 系统设置 项目管理 功能模块 AI模型 自定义数据库 数据管理 作业管理 收藏夹 相关参数
单击“新建应用”，进入新建应用页面。 图1 新建应用 填写应用的基本信息，包括“名称”、“版本”、“图标”、“标签”、“短描述”和“描述”。 图2 基本信息 选择镜像和镜像版本。 详细的镜像介绍和制作方法请参见镜像管理。 填写镜像启动命令。 镜像启动命令需要引用输入、输出参数中的变量，并以大括号扩起，以$符号进行引用。
blood–brain barrier Penetration，血脑屏障。作用于中枢神经系统的药物需要穿过血脑屏障 (BBB) 才能达到其分子靶点。相反，对于具有外围靶点的药物，不需要BBB渗透以避免中枢神经系统副作用，单位为cm/s。logBB 大于-1为（BBB+）, logBB小于等
自动生成多个作业并发执行。并发执行的作业数为设置的参数值个数的乘积。 例如，存在输入参数a和输入参数b，在启动作业时，分别给参数a设置了2个参数值，给参数b设置了2个参数值。那么，系统将自动生成4个作业并发执行。 方式二：参考批量执行NGS分析操作。 参数确认无误后，单击“立即创建”，创建应用。
官能团之间的关系是“和”，即生成的分子都会满足这几个官能团。 如果需要设置相互作用力的约束，可以在约束条件中设置“Interaction”，然后选择“包含”或者“排除”，包含相互作用力或者去除相互作用力。在相互作用力约束条件设置中，可以选择相应的靶点、氨基酸和相互作用力，相互作用力支持H
notebook镜像，支持PY3或者指定项目中镜像（格式为SourceProjectName/ImageName:TagName）。 若选择PY3，则代表使用系统镜像创建notebook；若选择SourceProjectName/ImageName:TagName，则代表使用自定义镜像创建notebook。
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