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是否必选 参数类型 描述 eihealth_project_id 是 String 平台项目ID，您可以在平台单击所需的项目名称，进入项目设置页面查看。 最小长度：1 最大长度：128 job_id 是 String 作业id 最小长度：1 最大长度：128 project_id
1GB。 图1 上传数据 复制数据 复制数据会从别的项目中复制一份数据到当前项目中，这里可选择的源项目需是当前账号为管理员的对应项目。如需设置项目成员，请参考用户指南中的项目成员和权限。 图2 复制数据 引用数据 引用数据可以引用其他项目中或对应的obs桶的数据。引用的数据不能在
登录医疗智能体平台，进入项目并选择“工具 > 流程”页签，单击“新建流程”。 图1 新建流程 在弹出的“流程设置”页面填写“流程名称”和“版本”，其他参数可选填。参数填写完成后，单击“确定”，完成流程设置。 在流程设计器左侧应用列表中选择fastp、bwa-mem应用，并使用鼠标拖拽至画布中。
强制操作，不进行询问提示，上传文件夹时可选。 --flat -l 否 上传文件夹时，只上传该文件夹下的所有内容，上传文件夹时可选。 --update -u 否 增量上传操作，设置该参数后上传每个文件时会比对平台数据路径中的文件，仅在以下情况时上传数据： 文件不存在。 待上传文件大小不与平台文件大小一致。 文件的最后修改时间不一致。
流程设计器界面由工具栏、资源栏和画布三部分构成。 图1 流程设计器界面 表1 界面说明 区域 说明 工具栏 上方的工具栏显示设计器的快捷控制操作。 由设置、新建作业、保存、另存为、删除、自动保存构成。 资源栏 左侧的资源栏显示项目中可以使用的应用和流程。 画布 中间区域为搭建流程的操作界面。
指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程，Linux和macOS环境使用方法基本相同，可参考。 从医疗项目中引用数据 health import data eihealth-project-name:/path1/
String 离子种类，支持选择NaCl、MgCl2、None，若设置了平衡电荷不支持选择None。 缺省值：NaCl ion_concentration Float 离子浓度，单位mol/L，若离子种类设置为None离子浓度不支持设置。 最小值：0 最大值：5.0 缺省值：0.15 表7 ReceptorDrugFile
平台ID与“命令行工具 > 步骤3 初始化配置”中的platform-id对应。 登录医疗智能体平台。 在右上角用户名中选择“个人设置”，获取平台ID。 图3 个人设置 图4 平台ID 父主题： 配置命令行工具
用户指南（基因平台） 欢迎使用医疗智能体服务 关键概念 准备工作 用户管理 配额管理 系统设置 项目管理 数据管理 数据库管理 镜像管理 工具管理 作业管理 Nextflow 资产市场 开发环境（Notebook） 大规模药物虚拟筛选
离子种类，支持选择NaCl、MgCl2、None，若设置了平衡电荷不支持选择None。 缺省值：NaCl ion_concentration 否 Float 离子浓度，单位mol/L，若离子种类设置为None离子浓度不支持设置。 最小值：0 最大值：5.0 缺省值：0.15 表6
使用绝对路径即可，如：health ls /abc/。 --limit -l 否 列举查询结果的最大个数，小于等于0表示列举所有结果，不设置时默认为最大值1000。 引用数据会列举全部，不受该参数影响 。 --simple -s 否 以精简格式显示查询结果，返回结果只包含对象名。
强制操作，不进行询问提示，批量下载时可选。 --flat -l 否 批量下载时，不包含上一级父对象名前缀，批量下载时可选。 --update -u 否 增量下载操作，设置该参数后，下载每个文件时会比对本地的文件，仅在以下情况时下载数据： 文件不存在。 下载文件大小与本地文件大小不一致。 文件的最后修改时间不一致。
最小长度：1 最大长度：128 eihealth_project_id 是 String 平台项目ID，您可以在平台单击所需的项目名称，进入项目设置页面查看。 最小长度：1 最大长度：128 请求参数 表2 请求Header参数 参数 是否必选 参数类型 描述 X-Auth-Token
--crr -c 否 复制时使用客户端跨区域复制模式，从通过数据流的方式从源桶直接复制数据到目标桶，且两个桶可以是任意两个OBS服务的桶。 若设置了该参数，必须确保更新了配置文件中客户端跨区域复制的相关配置信息，具体可参考更新配置文件。复制时源桶对应的配置信息为配置文件中的：akCr
选择的属性包含在我们所设置的参数设置区间内。“最大化”指的是我们所设置的属性越大越好，而不只是限定在某区间内，当我们无法判断属性应该设置在什么区间，但是属性越高，成药性越好，可以设置属性设置条件为最大化，这个只能在弱约束里面进行设置。“最小化”指的是所设置的属性越小越好，与最大化相反，也是只能在弱约束里面进行设置。
长。 图3 靶点设置 图4 Target1设置 图5 Target2设置 图6 靶点设置完成 通过“靶点设置”上传靶点，并且设置对接口袋。 此处靶点设置为可选参数，如果选择靶点设置，可以将对接活性作为一个约束条件进行分子优化。靶点1对应的约束条件是target1_binding_
示已选择90个用户。 如果导入后用户状态显示异常，需联系技术支持处理。 单击“下一步”，设置角色。 角色：支持管理员和操作员两种角色，默认为操作员。权限描述可以参考表2。 用户资源配额：设置用户的个人资源配额。详细请参考个人资源配额。 配置完成后，单击“确定”。 等待导入成功后，
Nullable cannot be set for columns that are set as primary keys. 检查设置为主键的列是否设置为允许为空。 400 eihealth.01040004 The uploaded template cannot be empty
消息中心管理 获取消息列表 统计消息信息 获取用户邮件配置 设置用户邮件配置 邮箱连通性测试 获取消息邮件配置 设置消息邮件配置 删除消息邮件配置 获取消息清理规则 设置消息清理规则 获取通知消息列表 批量删除通知消息 批量更新消息 父主题： 系统管理
在本地编写模板，模板中的参数与在EIHealth平台新建应用过程一致。模板修改好后，再使用命令行工具上传模板，创建应用。 修改模板时，需填写镜像地址，获取方法请参见获取镜像地址。镜像制作和上传方法请参见镜像管理和创建FastQC应用样例。 # 详情说明可参考API文档中应用管理-创建应用 app: name:
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