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集群云服务器节点创建完成,但在部署过程中失败了能否修复? 将集群删除,不要勾选“删除云服务器”,使用已有节点部署集群的方法重新部署集群。 父主题: 常见问题
弹性云服务器场景最佳实践 HPC断点续算计算方案 基于STAR-CCM+部署HPC集群
关闭防火墙成功 依次登录集群中所有ECS,重复执行步骤1.1~步骤1.3,关闭所有ECS的防火墙。 修改配置文件。 登录集群中任意一台ECS。 执行以下命令,查看ECS的主机名。 # hostname 图2 查看ECS的主机名 依次登录集群中所有ECS,重复执行步骤2.1~步骤2.2,获取所有ECS的主机名。
a~1.c,关闭所有ECS的防火墙。 修改配置文件。 登录集群中任意一台ECS。 执行以下命令,查看ECS的主机名。 # hostname 图2 查看主机名 依次登录集群中所有ECS,重复执行2.a~2.b,获取所有ECS的主机名。 登录集群中任意一台ECS。 执行以下命令,添加hosts配置文件。
安装和使用Intel MPI 操作场景 本节指导用户在BMS集群上安装和使用Intel MPI应用(以版本l_mpi_2018.0.128为例)。 对于集群中的每台BMS,都需要执行该操作。 前提条件 已配置BMS集群间互相免密登录。 操作步骤 安装Intel MPI。 下载Intel
社区OpenMPI 操作场景 本节指导用户安装和使用社区OpenMPI(以3.1.1版本的OpenMPI为例)。 前提条件 已配置弹性云服务器免密登录。 操作步骤 安装HPC-X工具套件。 下载需要的HPC-X工具套件以及OpenMPI。 使用社区OpenMPI时,需要同时使用Mellanox的HPC-X
Platform MPI 操作场景 本节指导用户在ECS上安装和使用Platform MPI应用(以版本platform_mpi-09.01.04.03r-ce为例)。 前提条件 已配置弹性云服务器免密登录。 操作步骤 安装Platform MPI。 执行以下命令,安装需要的库文件。
HPCX_HOME=$PWD 安装IBM Spectrum MPI。 将1中下载的MPI软件包上传至运行MPI的弹性云服务器内。 执行以下命令,切换至root用户。 $ sudo su - 执行以下命令,设置环境变量。 如果选择自动接受IBM Spectrum MPI安装许可协议,执行以下命令: #
IB驱动自带的OpenMPI 操作场景 本节指导用户安装和使用IB驱动自带的OpenMPI(以版本3.0.0rc6为例)。 前提条件 已配置弹性云服务器免密登录。 操作步骤 检查是否已安装IB驱动。 使用“PuTTY”,采用密钥对方式登录弹性云服务器。 执行以下命令,切换为root 用户。 $ sudo su
安装和使用MPICH 操作场景 该任务指导用户在BMS集群上运行MPICH应用(mpich-3.3.2版本)。 前提条件 已配置BMS集群间互相免密登录。 集群中所有的BMS,均已安装MPICH。 操作步骤 关闭防火墙。 登录集群中任意一台BMS。 执行以下命令,关闭BMS防火墙。
Converged Ethernet (RoCE)是一种网络协议,允许应用通过以太网实现远程内存访问。目前RoCE有两个协议版本,v1和v2。其中RoCE v1是一种链路层协议,允许在同一个广播域下的任意两台主机直接访问。而RoCE v2是一种Internet层协议,即可以实现路由功能。虽然R
安装和使用MPI 弹性云服务器场景支持使用的MPI IB驱动自带的OpenMPI 社区OpenMPI Spectrum MPI Intel MPI Platform MPI 父主题: 弹性云服务器场景典型应用
sysctl -w net.ipv4.ip_local_port_range=”20000 65535” >> /etc/sysctl.conf 执行以下命令验证。 sysctl -a | grep ipv4 | grep range 修改内存限制 设置方法: 设置在内存中锁定进程的最大
配置节点互信免密登录 STAR-CCM+集群运行时候需要跨节点运行,推荐使用互信免密登录。 # 生成ssh公钥和私钥 ssh-key-gen # 拷贝公钥到指定主机的~/.ssh/authorized_key文件中 ssh-copy-id root@目标主机IP 例如:ssh-copy-id
操作场景 该任务指导用户在BMS集群上运行Platform MPI应用(platform_mpi- 09.01.04.03r-ce.bin版本)。 前提条件 已配置BMS集群间互相免密登录。 集群中所有的BMS,均已安装Platform MPI。 操作步骤 关闭防火墙。 登录集群中任意一台BMS。
Intel MPI 操作场景 该任务指导用户在BMS集群上运行Intel MPI应用(l_mpi_2017.3.196版本)。 前提条件 已配置BMS集群间互相免密登录。 集群中所有的BMS,均已安装Spectrum MPI。 操作步骤 关闭防火墙。 登录集群中任意一台BMS。 执行以下命令,关闭BMS防火墙。
Spectrum MPI 操作场景 该任务指导用户在BMS集群上运行Spectrum MPI应用(10.01.01版本)。 前提条件 已配置BMS集群间互相免密登录。 集群中所有的BMS,均已安装Spectrum MPI。 操作步骤 关闭防火墙。 登录集群中任意一台BMS。 执行以下命令,关闭BMS防火墙。
社区OpenMPI 操作场景 该任务指导用户在BMS集群上运行社区OpenMPI(以3.1.1版本为例)。 前提条件 已配置BMS集群间互相免密登录。 集群中所有的BMS,均已安装社区OpenMPI。 操作步骤 关闭防火墙。 登录集群中任意一台BMS。 执行以下命令,关闭BMS防火墙。
拷贝至“/share”目录。 make mpi 步骤3 配置lammps 算例输入文件。 以melt为例,生成一个算例melt.in文件。设置每迭代100步生成一个checkpoint文件,假定该文件存放在共享目录“/share”中。内容如下: # 3d Lennard-Jones
DMA请求从用户空间发送到本地网卡并通过网络发送给远程网卡,这就减少了在处理网络传输流时内核内存空间与用户空间之间环境切换的次数。 没有CPU参与:应用程序可以访问远程内存,而不占用远程机器中的任何CPU。远程存储器将被读取,无需任何干预的远程进程(或处理器)。远程CPU中的缓存将不会被访问的内存内容填满。