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最小长度:1 最大长度:32768 响应参数 状态码: 200 表3 响应Body参数 参数 参数类型 描述 server String 服务器地址 subject_prefix String 展示名 user_name String 用户名 email String 邮箱 language
以通过搜索应用名称快速查找所需应用。应用列表展示了应用的名称、版本、创建者、修改时间、创建时间和可执行的操作。 详细的应用创建和使用请参见工具管理。 创建应用 应用是生物信息学软件的镜像封装,您可以制作软件镜像并上传至平台,并通过“新建应用”引入相关软件。 导入应用 应用按项目进
--help可以替换成任何fastqc的命令,与linux类似。 步骤2:上传镜像至EIHealth平台 配置命令行工具。 若已完成配置,可跳过此步骤。 在命令行工具所在的目录,使用switch命令进入EIHelath平台的项目中。 # 命令结构 health switch project
入门实践 表1 常用最佳实践 实践 描述 基于二代测序的基因组突变检测 本最佳实践提供了通过命令行工具上传数据、上传镜像后,在医疗智能体平台搭建NGS流程,执行分析作业及批量执行NGS分析。 新型冠状病毒(COVID-19)虚拟药物筛选 本最佳实践介绍如何使用EIhealth平台
在“资产市场”中查找“Variant Calling Based On NGS”流程。 单击界面右侧“订阅”图标,订阅该流程。 订阅的流程将显示在“项目管理 > 工具”页面的流程列表中。 步骤2:上传待分析数据 您在使用NGS流程前,请先上传待分析的数据,上传数据方法请参见数据管理。数据要求是成对的双端
节约研发成本。 产品优势 提供开放的、易于扩展的平台架构。 提供端到端的AI赋能平台加速AI的研发和应用。 提供针对医疗行业的AI自动建模工具。 提供医疗领域专业的预置资产,提升企业的效率。 内置大量生物医疗领域标准分析流程,并结合华为特有的高性能云计算,多样性算力,大数据等技术加速计算过程。
oken。 最小长度:1 最大长度:32768 表3 请求Body参数 参数 是否必选 参数类型 描述 server 是 String 服务器地址 最小长度:1 最大长度:128 subject_prefix 否 String 展示名 最小长度:0 最大长度:128 user_name
记录文件恢复任务。 --jobs -j 否 同步上传文件夹时批量任务的最大并发数,默认为配置文件中的defaultJobs。**说明:**工具会保证该值至少为1。 同步文件夹时该参数可选。 --exclude -x 否 不包含文件的匹配模式,如:*.txt。 支持“*”匹配多个任意字符和“
订阅的流程将显示在“项目管理 > 工具”页面的流程列表中。 步骤2:上传待分析数据 您在使用Docking Summary流程前,请先上传待分析的数据,上传数据方法请参见数据管理。 步骤3:创建分析作业 单击项目名称,进入“项目管理”页面,并选择“工具”页签。 单击Docking S
进入资产市场,分别订阅fasp,bwa-mem,bamqc,picard-insertsize应用。 图1 订阅应用 可以在“工具 > 应用”列表可以看到刚刚订阅的应用。 图2 查看订阅的应用 步骤2:新建流程 在“工具 > 流程”页面,单击“新建流程”按钮,填写流程名称,版本等信息。 图3 新建流程 利用拖拽的
String 内存物理规格描述信息 netcard_detail String 网卡物理规格描述信息 cpu_arch String 裸金属服务器的CPU架构类型 gpu_info String GPU信息 请求示例 查询计算资源规格 /v1/{project_id}/system/
强制操作,不进行询问提示。 批量移动时该参数可选。 --jobs -j 否 批量移动时的最大并发数,默认为配置文件中的defaultJobs。**说明:**工具会保证该值至少为1。 批量移动时该参数可选。 --exclude -x 否 不包含源对象的匹配模式,如:*.txt。批量移动时该参数可选。
下载数据操作会产生流量费用,计费方式为按需计费,计费详情请参考OBS数据下载费用。 以下操作步骤是在“数据”页面下载数据至本地。您也可以使用命令行工具实现数据的下载。 展开数据文件夹,选择待下载的数据。 单击“操作”列“下载”。 单击鼠标右键,选择“链接另存为”,下载数据。 图6 下载数据
&& ./configure --prefix=/usr/local/samtools && make && make install 按Esc键,并执行:wq保存并退出Dockerfile。 制作镜像。 docker build -t bwa_samtools:0.7.17-1.10
删除notebook 使用delete命令删除notebook。 命令结构 health delete notebook <notebook-id> [flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 notebook-id 无 是 notebook id。 --project
编辑notebook 使用update或edit命令更新notebook描述信息。 命令结构 health update notebook <notebook-id> [flags] 或者 health edit notebook <notebook-id> [flags] 表1
创建notebook 使用create命令创建notebook。 命令结构 health create notebook <notebook-name> [flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 notebook-name 无 是 notebook名称。 取值范围[1
启动notebook 使用start命令启动notebook。 命令结构 health start notebook <notebook-id> [flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 notebook-id 无 是 notebook id。 --project
停止notebook 使用stop命令停止notebook。 命令结构 health stop notebook <notebook-id> [flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 notebook-id 无 是 notebook id。 命令示例 本节以Wi
单击“操作”列的“删除”,删除数据。 图4 删除数据 批量删除 勾选文件名左侧图标,单击“删除”,删除数据。 图5 批量删除 查看3D 支持以Mol 3D Viewer工具查看蛋白质和小分子的3D结构。 父主题: 数据管理