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说明 ID 不涉及 否 流程ID,指定后获取流程ID对应的流程详情。不指定时,获取的是流程列表。 --param-file -p 否 参数文件保存路径,以yaml格式保存。如果没指定,则不会显示和保存参数信息。 命令示例 health nextflow get workflow
of strings 导入路径集 最小长度:1 最大长度:2000 数组长度:0 - 50 target_folder 否 String 目标文件夹 最小长度:0 最大长度:2000 响应参数 状态码: 202 表4 响应Body参数 参数 参数类型 描述 id String 数据作业ID
项目级删除策略(true:允许项目数据删除操作,false:不允许删除操作,默认为true) data_download Boolean 项目级下载策略(true:允许项目数据下载操作,false:不允许下载操作,默认为true) data_encrypted Boolean 项目级加密策略(true:允许项目数据
二分型:预测二分类离散变量的模型,主要侧重定性分析。 模型数据 选择模型数据。可选择数据中心数据,或者示例数据。 仅支持CSV格式,数据条数支持100-50000条,文件不大于5MB。 组织共享 如果关闭,则该模型只能自己使用。 如果开启组织共享,则其他子用户也可以使用您的模型做分析。 默认为关闭。 单击“确定”。
小分子”,查看已收藏的结果。 单击“查看"按钮,可以查看相应的结果信息 单击“下游分析”按钮,可以选择对相应结果进行下游任务的配置。 单击“下载”按钮可以下载相应结果。 图3 收藏结果展示 当需要取消分子收藏时,单击已收藏的结果右侧的按钮,弹出取消收藏窗口,单击“确认”,取消对该分子的收藏。
单击作业名称,查看输出结果和作业信息。 输出结果 当作业执行成功后,可以在作业中心页面,单击作业名称,查看输出结果。 在输出结果中可以查看下载某个任务或者全部任务的信息,可以在操作列查看3D、合成路径等信息。 图1 输出结果-列表视图 输出结果除了支持上图所示的列表视图外,还支持卡片式图和3D视图。
运行大规模虚拟药筛任务 药物数据输入格式说明 订阅Docking Summary流程 新建研究 查看药筛结果 查看药筛作业和结果下载
杠(/)开头且不能以斜杠(/)结尾,不能包含两个以上相邻的斜杠(/),不能包含以下特殊字符:\ : ; * ? < " > | 。其中单个文件夹名称不能以中划线(-)开头,不能以英文句号(.)或斜杠(/)或空格开头或结尾 最小长度:0 最大长度:128 tasks 否 Array
杠(/)开头且不能以斜杠(/)结尾,不能包含两个以上相邻的斜杠(/),不能包含以下特殊字符:\ : ; * ? < " > | 。其中单个文件夹名称不能以中划线(-)开头,不能以英文句号(.)或斜杠(/)或空格开头或结尾 最小长度:0 最大长度:128 tasks 否 Array
5 workflow_id 是 String 作业依赖的流程id 最小长度:0 最大长度:135 params 否 File 流程参数列表文件,取值范围[0, 10M] priority 否 Integer 作业的优先级,取值范围[0,9],0最低,默认数值0 最小值:0 最大值:9
开发环境(Notebook) Notebook简介 创建Notebook Notebook常用操作 数据的上传和下载 自定义镜像创建Notebook样例 JupyterLab简介及常用操作 url获取方法 Notebook安装Conda指导 父主题: 用户指南(基因平台)
获取并使用命令行工具eihealth-toolkit 步骤1:获取认证信息 步骤2:下载并安装命令行工具eihealth-toolkit 步骤3:初始化配置 步骤4:查看与执行操作命令
数据作业管理 获取数据作业列表 获取数据作业详细信息 删除数据作业 取消数据作业 重试数据作业 获取数据作业执行日志 下载数据作业执行日志 父主题: 数据管理
杠(/)开头且不能以斜杠(/)结尾,不能包含两个以上相邻的斜杠(/),不能包含以下特殊字符:\ : ; * ? < " > | 。其中单个文件夹名称不能以中划线(-)开头,不能以英文句号(.)或斜杠(/)或空格开头或结尾 最小长度:0 最大长度:128 output_dir_type
强型、超大内存型、GPU加速型,根据需求选择类型,并勾选规格名称。 系统盘:40GB,不可修改。 数据盘:数据盘可用于在创建作业时,开启“本地盘加速”,默认100GB,可按使用需要进行扩增。 计费模式:选择“包年包月”或“按需”计费。 购买时长:如果选择的“包年包月”计费,根据实
config_files Array of strings 作业标签 config_context String nextflow config文件内容 表4 NextflowParamsDto 参数 参数类型 描述 name String 参数名 最小长度:1 最大长度:1024 value
其中vendor-config可简写为vc 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 --name -n 否 供应商名称。 --logo -l 是 供应商图标本地路径。 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程,Linux和macOS环境使用方法基本相同,可参考。
0。 上传安装包:用户直接上传一个Nextflow的安装包。如果选择此方式,您可以单击“点击此处”进入nextflow release进行下载安装包。 图2 选择安装方式 单击“开始安装”。 卸载Nextflow 在平台右上角用户名中选择“系统设置”。 在“Nextflow配置”模块,单击“卸载”。
AK/SK,请妥善保管AK/SK信息。 图2 访问密钥 每个用户仅允许新增两个访问密钥。 为保证访问密钥的安全,访问密钥仅在初次生成时自动下载,后续不可再次通过管理控制台页面获取。请在生成后妥善保管。 父主题: 数据管理
杠(/)开头且不能以斜杠(/)结尾,不能包含两个以上相邻的斜杠(/),不能包含以下特殊字符:\ : ; * ? < " > | 。其中单个文件夹名称不能以中划线(-)开头,不能以英文句号(.)或斜杠(/)或空格开头或结尾 最小长度:0 最大长度:128 output_dir_type