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-t 否 超时时间。运行时间超过设置时间时,认为超时,默认1440分钟,最大可设置为144000分钟。 --labels -l 否 标签。多个标签使用;符号分隔开。 --project 无 否 指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。 对于可选参数,如果命令中包含了特殊字符,
使用Variant Calling Based On NGS流程 二代基因组测序即Next Generation Sequencing (NGS)是一种基于边合成边测序的方式。NGS在保持了测序高准确度的同时,大幅的提高了测序速度。目前NGS已经普遍的应用于全基因组测序、全外显子测序、转录组测序表观遗传学等领域。
镜像启动命令。设置方法请参见创建FastQC应用样例。 --image -i 否 镜像地址。获取方法请参见获取镜像地址。 --labels -l 否 标签,多个标签使用;符号分隔开。 --nodeLabels -n 否 用于让应用调度到设置了该标签的节点上。 标签数量取值范围[0,1]。单个标签最大长度为63字符,必须以health
&& ./configure --prefix=/usr/local/samtools && make && make install 按Esc键,并执行:wq保存并退出Dockerfile。 制作镜像。 docker build -t bwa_samtools:0.7.17-1.10
/path、OBS:BucketName:/path、OBSFS:ObsfsName:/path、下载url。 须知: 源路径中如果要填写多个路径,路径之间用空格分隔。如果路径中有特殊字符或者空格,用""包裹单个路径;如果路径中有""则使用''包裹,如路径中有''则使用""包裹。
约束与限制 使用区域限制 医疗智能体目前支持的区域为“华北-北京四”、“华东-上海一”、华南-广州。 盘古辅助制药平台仅在“华东-上海一”支持。 不同区域云服务产品之间内网互不相通;请就近选择靠近您业务的区域,可减少网络延迟,提高访问速度。 平台用户权限限制 EIHealth平台
最小值:1 最大值:128 缺省值:1 gpu 是 Float notebook占用的gpu,0.1为使用单卡10%,1为占满单个显卡,1+为使用多个显卡 最小值:0 最大值:16 缺省值:0 memory 是 Float notebook占用的内存,单位为"G" 最小值:2 最大值:512
最小长度:1 最大长度:120 数组长度:1 - 8 exclusive Boolean 是否排除子结构。 operator String 多个子结构之间的逻辑关系。 枚举值: or and 表13 InteractionConstraintDto 参数 参数类型 描述 interactions
最小长度:1 最大长度:120 数组长度:1 - 8 exclusive 是 Boolean 是否排除子结构。 operator 否 String 多个子结构之间的逻辑关系。 枚举值: or and 表12 InteractionConstraintDto 参数 是否必选 参数类型 描述 interactions
最小长度:1 最大长度:120 数组长度:1 - 8 exclusive 是 Boolean 是否排除子结构。 operator 否 String 多个子结构之间的逻辑关系。 枚举值: or and 表12 InteractionConstraintDto 参数 是否必选 参数类型 描述 interactions
应用场景 基因组分析 提供从基因组数据管理、生物信息分析流程到科研分析管理整个流程的服务,快速实现基因组数据分析及AI建模,提供高性能、高可靠性、高性价比的基因测序计算、存储、分析和AI能力支持,让科研过程标准化、可执行。 基因组测序是新型冠状病毒疑似病例确诊的病原学证据之一,基
更新自动作业模板 功能介绍 更新自动作业模板 URI PUT /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/auto-jobs/{auto_job_id} 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 eihealth_project_id
最小长度:1 最大长度:120 数组长度:1 - 8 exclusive Boolean 是否排除子结构。 operator String 多个子结构之间的逻辑关系。 枚举值: or and 表13 InteractionConstraintDto 参数 参数类型 描述 interactions
NextflowTaskResourceRequested 参数 参数类型 描述 container String 容器名称 queue String 执行队列,使用','分隔多个值 cpus Integer 指定task执行需要的cpu数量 memory String 指定task执行需要的内存大小 disk String
最小值:1 最大值:128 缺省值:1 gpu Float notebook占用的gpu,0.1为使用单卡10%,1为占满单个显卡,1+为使用多个显卡 最小值:0 最大值:16 缺省值:0 memory Float notebook占用的内存,单位为"G" 最小值:2 最大值:512
最小值:1 最大值:128 缺省值:1 gpu Float notebook占用的gpu,0.1为使用单卡10%,1为占满单个显卡,1+为使用多个显卡 最小值:0 最大值:16 缺省值:0 memory Float notebook占用的内存,单位为"G" 最小值:2 最大值:512
创建自动作业模板 功能介绍 创建自动作业模板 URI POST /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/auto-jobs 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 eihealth_project_id
数据管理简介 盘古辅助制药平台使用对象存储服务(OBS)存储原始数据、作业执行中间数据和执行结果数据。数据按项目维度进行隔离和划分,从项目角度进行数据的管理,不同项目的数据可以通过“复制数据”实现跨项目使用。您可以在“项目管理”页面,“数据”页签中,完成数据的添加、导入、归档、复制、删除等操作。
相关参数 物化性质(Physicochemical Property) Molecular Weight (MW): 分子量大小,包含氢原子,最佳分子量在100~600之间。 Molecular Refractivity (MR): 总极化率,取决于分子的温度、折射率和压力。 Volume:
Array of strings 子结构SMILES exclusive Boolean 是否排除子结构 operator String 多个子结构之间的逻辑关系 缺省值:or 枚举值: or and 表10 BindingSite 参数 参数类型 描述 protein String