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命令示例 health stat huo:/huo/ --bf human-readable Start at 2022-09-01 06:53:01.0466497 +0000 UTC Key: obs://xxx/huo/ LastModified: 2022-08-30T11:13:48Z
药物通用接口 生成分子SVG图 生成分子SDF三维结构 受体预处理 受体信息解析 受体口袋检测 配体格式转换为SMILES 生成相互作用2D图 计算配体间的3D结构差异 创建配体文件预览任务 查询配体文件预览任务 删除配体文件预览任务 创建配体相似性图计算任务 查询配体相似性图计算任务
yaml文件填写规则，完整的NGS配置文件请参考本示例以及获取NGS作业配置文件章节得到的作业信息和模板填写。 job: name: ngs-test description '' priority: 0 timeout: 1440 output_dir: '' workflow_id:
pdb格式文件，最多上传100个靶点文件，如果上传多聚体靶点，仅解析第一条链，每个靶点的氨基酸序列长度不超过2048。 图2 靶点配置选择文件 输入PDB ID，最多输入100个PDB ID，用逗号或换行方式隔开；不区分大小写；如果输入多聚体靶点，仅解析第一条链；每个靶点的氨基酸序列长度不超过2048。
"count_after_scale" : 3, "state" : "Successful", "time" : "2022-10-15T09:53:50Z" } ] } 状态码 状态码 描述 200 OK 错误码 请参见错误码。 父主题： 计算资源扩缩容
OK { "count" : 1, "logs" : [ { "collect_time" : "2021-01-30T02:53:26Z", "content" : "eihealth" } ] } 状态码 状态码 描述 200 OK 错误码 请参见错误码。
0B/0B 435ms Succeed count is: 1 Failed count is: 0 Skip count is: 1 Succeed bytes is: 0B Metrics [max cost:n/a, min cost:n/a
2147483647, "work_dir": "/nextflow/__nextflow_work__/e6dcd289-dadb-48d9-b53b-e0c6c256932e/mb79e5e6-1b14-41b4-ac3b-e8fb0122d64d/f2/a0f16c66bbe8e28824e8ccabbddd25"
"sr_hse": 0.0010032267309725285, "sr_mmp": 0.015672488138079643, "sr_p53": 0.000005944234089838574, "surechembl_rule": "0,", "t12": 0.6137365102767944
000条将进行截取。文件必须有两列是“SMILES”、“NAME”，不区分大小写。文件不允许有中文，数据库小分子会自动去重。 数据文件列名：选择数据库列名，仅解析前100个列名，支持选择12个列名保存到数据库。 组织共享： 如果关闭，则该数据库只能自己使用。 如果开启组织共享，则其他子用户也可以使用您的数据库进行分子搜索。
式（此时Cell中有光标，可以进行代码编写）。在命令模式下，按下“Enter”键或者鼠标单击代码框可以进入编辑模式。在编辑模式下，按下“ESC”键或者鼠标单击代码框左侧区域即可进入命令模式。 删除文件或文件夹 如果需要在Notebook中删除文件或文件夹，您可以在“Files”列
"create_time" : "2021-01-30T02:34:36Z", "finish_time" : "2021-01-30T02:53:26Z", "failed_message" : "null", "user_name" : "demo-user-name"
购买服务 前提条件 注册华为账号并开通华为云，并进行账号实名认证。购买服务时，账号不能处于欠费或冻结状态。 购买服务时，需使用华为主账号购买。如果不确定账号类型，可登录账号中心查看所属账号是主账号还是子账号（IAM账号）。 在账号中心左侧导航栏中有“我的主账号”页签，则说明是子账
购买服务 前提条件 注册华为账号并开通华为云，并进行账号实名认证。购买服务时，账号不能处于欠费或冻结状态。 购买服务时，需使用华为主账号购买。如果不确定账号类型，可登录账号中心查看所属账号是主账号还是子账号（IAM账号）。 在账号中心左侧导航栏中有“我的主账号”页签，则说明是子账
"start_time" : "2021-01-30T02:34:37Z", "finish_time" : "2021-01-30T02:53:26Z", "failed_message" : "null", "user_name" : "demo-user-name"
约束与限制 使用区域限制 医疗智能体目前支持的区域为“华北-北京四”、“华东-上海一”、华南-广州。 盘古辅助制药平台仅在“华东-上海一”支持。 不同区域云服务产品之间内网互不相通；请就近选择靠近您业务的区域，可减少网络延迟，提高访问速度。 平台用户权限限制 EIHealth平台
创建自动作业 针对存在需要批量创建分析作业的场景，您可以选择创建自动作业。 在“自动作业”页签，您可以查看已创建的自动作业，包含作业名称、状态、数据表、创建者、创建时间；在操作列，您可以对已创建的自动作业执行启动、编辑、删除操作，运行中的作业可以执行停止操作。 图1 自动作业 前提条件
关键概念 镜像 运行生物信息学软件，往往由于不同的操作系统（Windows、Linux、Mac等）原因，无法实现统一的运维管理。同时，这些软件具有不同的版本和软件包，安装、使用过程复杂。将生物信息学软件封装成Docker镜像，可以使程序在不同的环境中运行，并通过EIHealth平
执行分析作业 创建分析作业 登录医疗智能体平台，进入项目并选择“工具 > 流程”页签，单击NGS流程行的“启动作业”。 请参考配置输入和依赖数据章节，设置NGS流程数输入数据。 在新建作业页面，填写作业信息。 基本信息：包含作业名称、标签、描述。 输出路径：存放输出结果的路径，格
使用RNA-Seq Analysis Based on STAR流程 二代基因组测序即Next Generation Sequencing (NGS)是一种基于边合成边测序的方式。NGS在保持了测序高准确度的同时，大幅的提高了测序速度。目前NGS已经普遍的应用于全基因组测序、全外显子测序、转录组测序表观遗传学等领域。
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