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配体格式转换为SMILES 功能介绍 配体格式转换为SMILES，若配体文件中存在多个分子，则只取第一个返回。 URI POST /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-common/ligand/smiles
file 是 ConvertFile object 待转换文件。 in_format 是 String 待转换文件格式，支持PDB、SDF、MOL2、SMI。 最小长度：0 最大长度：6 out_format 是 String 转换后文件格式，支持PDB、SDF、MOL2、SMI。 最小长度：0
Notebook提供了在线的开发和调试工具，用于编写和调测模型训练代码，在创建Notebook时，平台为您提供了系统镜像。同时，您也可以使用自定义镜像，创建Notebook，满足个性化的开发需求。 本章节介绍如何使用自定义镜像创建Notebook（在基础镜像中安装化学分子格式转换工具Open
cd . 切换到上一级路径。 health cd .. 切换到指定的路径，如切换到src1。 health cd /src1 回到本项目根路径。 health cd / 回到本项目下DataSet路径。 health cd gene-assent:/DataSet/ 切换到引用数据
切换项目 使用switch命令切换到指定的项目中。 使用该命令前，您需要先创建项目，再使用switch命令进入该项目。 命令结构 health switch project <project-name> 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 project-name 无 是
String 标签页面标题，正则匹配中文，英文字母和数字及下划线 最小长度：1 最大长度：32 feature 是 String 标签页面类型 枚举值： TOOL labels 是 Array of strings 标签页面包含的标签值，正则匹配中文，英文字母和数字及下划线 最小长度：1 最大长度：32
resource_name 是 String 收藏的资源名称，正则匹配中文，英文字母和数字及下划线。 最小长度：1 最大长度：128 resource_type 是 String 收藏的资源类型，正则匹配英文字母和数字及下划线。 最小长度：1 最大长度：128 display_info
Notebook简介 EIHealth平台集成了基于开源的Jupyter Notebook，可为您提供在线的开发和调试工具，用于编写和调测模型训练代码。Notebook使您无需关心分析软件包的安装、升级和维护等工作，只需聚焦于科研工作，从而加快科研进展。 关于Jupyter No
药物通用接口 生成分子SVG图 生成分子SDF三维结构 受体预处理 受体信息解析 受体口袋检测 配体格式转换为SMILES 生成相互作用2D图 计算配体间的3D结构差异 创建配体文件预览任务 查询配体文件预览任务 删除配体文件预览任务 创建配体相似性图计算任务 查询配体相似性图计算任务
container-id：容器id。 -m：提交时的说明文字，例如xx。 tsj/image:tag：仓库名/镜像名:TAG名，名称可自定义。 执行docker images查看制作完成的Docker镜像。 Dockerfile方式制作镜像 如果后续镜像经常变更（例如某个软件更新版本），建议使用Do
包含中文字符，格式为{project-name}/{image-repo}:{image-tag} commands: # docker启动时执行命令 单行命令长度取值范围[0-256]，不能包含中文字符，支持多行输入，最多支持300行。
ligand-smiles-to-3dsdf 将配体的smiles结构式转换为sdf文件。 ligand-3dsdf-to-pdbqt 将配体的sdf文件转换为pdbqt文件。 receptor-pdb-to-pdbqt 将pdb文件转换为pdbqt文件。 qvina-w 执行分子对接操作（此处为blind
to pdbqt：将配体的sdf文件转换为pdbqt文件。 task-2-ligand smiles to 3dsdf：将配体的smiles文件转换为3dsdf文件。 task-3-receptor pdb to pdbqt：将受体的pdb文件转换为pdbqt文件。 task-4-qvina-w：分子对接。
登录盘古辅助制药平台，选择“AI模型”。 图1 AI模型 单击“创建模型”，设置相关参数信息。 表1 参数说明 参数 说明 名称 模型名称。 长度为5-32个字符，首位需以英文字母开头，仅可以使用字母、数字、下划线“_”和中划线“-”和空格。 描述 设置模型的描述信息。 基模型 设置基模型，基模型与分子描述符有关。选择不同的基模型，分子描述符不一样。
docker镜像地址，取值范围[5-255]，不能包含中文字符 commands: # docker启动时执行命令 单行命令长度取值范围[0-256]，不能包含中文字符，支持多行输入，最多支持300行。 - 'echo
最大长度：32768 表3 请求Body参数 参数 是否必选 参数类型 描述 name 是 String 数据库名称，长度为5-32个字符，首位需以小写英文字母开头，仅可以使用小写字母、数字、下划线“_”和中划线“-”。 最小长度：5 最大长度：32 description 否 String 数据库描述。
to pdbqt：将配体的sdf文件转换为pdbqt文件。 task-2-ligand smiles to 3dsdf：将配体的smiles文件转换为3dsdf文件。 task-3-receptor pdb to pdbqt：将受体的pdb文件转换为pdbqt文件。 task-4-qvina-w：分子对接。
创建数据库”，并填写相关信息。每个用户可新建100个自定义数据库。 图1 创建数据库 名称：数据库名称。长度为5-32个字符，首位需小写英文字母开头，仅可以使用小写字母、数字、下划线“_”和中划线“-”。最终租户下的所有用户数据库名称不能重名，可以和官方数据库名称重名，不区分大小
docker镜像地址 取值范围[5-255]，不能包含中文字符 最小长度：5 最大长度：255 commands 是 Array of strings docker启动时执行命令 取值范围[1-300]，单个命令长度取值范围[0-256]，不能包含中文字符 最小长度：0 最大长度：256 数组长度：1
docker镜像地址 取值范围[5-255]，不能包含中文字符 最小长度：5 最大长度：255 commands 是 Array of strings docker启动时执行命令 取值范围[1-300]，单个命令长度取值范围[0-256]，不能包含中文字符 最小长度：0 最大长度：256 数组长度：1
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